我科學家主導完成白菜全基因組研究
8月29日，由多國科學家共同合作完成的白菜全基因組研究成果在《自然—遺傳學》上在線發表。這是由中國科學家主導，通過國際合作完成的又一重大成果。 白菜類蔬菜包括結球白菜、小白菜、菜心和蕪菁等形態各異的一大類蔬菜。據了解，科學家開展了白菜基因組注釋、比較基因組學、基因組進化和各種相關的生物學分析。結果表明，白菜基因組大小為約485Mb，共包含約4萬多個基因；白菜的祖先種與模式物種擬南芥非常相似，它們大約在1300萬—1700萬年前發生了分化，兩者依然維持著良好的基因間線性對應關系；白菜基因組存在3個類似但基因密度明顯不同的亞基因組，其中一個亞基因組密度顯著高于另外兩個亞基因組，推測白菜基因組在進化過程中經歷了兩次全基因組復制事件與兩次基因丟失的過程。研究還發現，白菜在基因組發生復制之后，與器官形態變異有關的生長素相關基因發生了顯著擴增，白菜基因組復制導致了許多與形態變異有關的基因保留更多拷貝，這可能是白菜類蔬......閱讀全文
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明，白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
我科學家主導完成白菜全基因組研究
8月29日，由多國科學家共同合作完成的白菜全基因組研究成果在《自然—遺傳學》上在線發表。這是由中國科學家主導，通過國際合作完成的又一重大成果。 白菜類蔬菜包括結球白菜、小白菜、菜心和蕪菁等形態各異的一大類蔬菜。據了解，科學家開展了白菜基因組注釋、比較基因組學、基因組進化和各種
擬南芥基因組DNA的提取
實驗概要本實驗介紹了用CTAB法提取擬南芥基因組DNA。主要試劑CTAB提取液(2%CTAB，50mMEDTA，50mM Tris-HCl，PH 8.0，0.84M NaCI，0.05%巰基乙醇)，氯仿，無水酒精，70%的酒精主要設備1.5 mL離心管，65℃水浴鍋，高速離心機，研缽實驗材料擬南芥葉
南京農大研究揭示小白菜維生素C等營養物質的代謝機制
不結球白菜俗稱青菜、小白菜，栽培面積由2005年的800萬畝上升到現在的2100萬畝左右，已成為第三大蔬菜作物。 近日，南京農業大學園藝學院教授侯喜林團隊在《園藝研究》在線發表研究論文。該團隊經過十多年深入研究，揭示了不結球白菜維生素C和硫代葡葡糖苷營養物質的代謝機制，為優良性狀分子設計育種
接近完整：高質量白菜基因組圖譜發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494026.shtm近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所分子育種創新團隊研究獲得接近完整組裝的白菜基因組，揭示白菜著絲粒的快速進化特征。相關研究成果在線發表于《植物生物技術》（Plant Biotechno
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
昆明植物所在甘藍WRKY基因家族研究中取得新進展
甘藍（Brassica oleracea）是十字花科蕓苔屬植物，其作為人類廣泛食用的蔬菜而具有重要的經濟價值。甘藍種內形態差異巨大，有著眾多的品種或變種，如花椰菜（菜花）、結球甘藍（卷心菜或包菜）、芥藍、西蘭花和苤藍等。然而，甘藍抗病抗蟲能力不強，極易受到病菌的感染或昆蟲蠶食，制約著甘藍綠色栽培
黃白菜立即吃綠白菜要放放
大白菜是冬天菜籃子里的主角。應該怎么挑選呢？買回家馬上吃的，和準備儲藏的，挑選方法一樣嗎？ 一般來說，優質大白菜包心緊、分量重、底部突出、根部切口大。買回家馬上吃的，菜心要裹得越緊越好；長期儲存的，就要買松散點的。因為白菜砍下來還是活的，菜心會緩慢生長，如果
lncRNA在農業領域的研究成果（三）
【結論】①通過lncRNA測序，在上萬條白菜中候選的lncRNA中挑出了1,300余條與花粉授粉相關的lncRNAs。分析結果顯示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整個發育過程中持續表達，其余的部分為階段、部位特異性表達。lncRNA在白菜不同發育階段花蕾種的表達呈現出較明顯的差異，在V級花蕾中特異
擬南芥轉化
實驗概要本實驗以擬南芥為試材介紹了轉化及篩選的過程。主要試劑1. 滲透培養基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH調至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%瓊脂PNS或水溶液2. 篩選培
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
虎尾海馬全基因組破譯
中科院南海海洋研究所、德國康斯坦茨大學、華大基因和新加坡A*STAR研究院聯合破譯了虎尾海馬的全基因組。有關研究成果日前以封面文章的形式發表在《自然》雜志上。 海馬隸屬于海龍科。與其他硬骨魚不同，海馬呈現高度特殊的形態，例如頭部前方具有管狀長嘴，無腹鰭和尾鰭，尾端卷曲，全身覆蓋硬骨骼，沒有鱗片
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA，解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本，不會造成偏差，擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w
分子植物卓越中心揭示天然反義轉錄本調控機制
近期，中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所研究員何玉科研究組在Nature Communications上，發表題為Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and a
擬南芥葉綠體基因組DNA雙鏈斷裂修復的全新分子機制
2021年6月16日，清華大學生命學院/清華-北大生命科學聯合中心孫前文實驗室在Nucleic Acids Research雜志在線發表題為“RNase H1C與單鏈DNA結合蛋白WHY1/3和重組酶RecA1在擬南芥葉綠體中協作完成DNA損傷修復 (RNaseH1C collaborates
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
昆蟲全基因組DNA的提取
實驗概要利用改進的CTAB 法提取昆蟲全基因組DNA。主要試劑1. 蛋白酶K[美國Merck公司]2. 三羥甲基氨基甲烷(Tris)[美國Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 瓊脂糖及溴化乙錠(EB)[美國Amresco公司生產]5. 乙二胺四乙酸鈉(Na2ED
多國實施全基因組分析計劃
由于基因測序可以探查與特定疾病相關的基因，該療法正在成為日益受歡迎的診斷方法。 英國計劃到2017年對10萬人進行基因組測序。 美國加州一對龍鳳胎出生后，他們的父母非常憂慮：兩個嬰兒不僅發育緩慢，而且肌肉松軟無力。大腦掃描結果顯示，男嬰或存在大腦性麻痹；然而醫生對造成女嬰震顫和癲癇的原因卻不
全血基因組提取操作步驟
操作步驟（（２００ul全血））* 第一次使用前請先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水乙醇! 1. 取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液，放入1.5ml離心管。對如果全血起始量小于200μl，則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間，則后續操作需要按照比例增
全基因組研究解碼口吃根源
口吃跨越不同語言和血統，影響著全球約7000萬人。過去，許多人認為口吃能夠通過自主控制來改善。但數十年來的研究表明，口吃實際上是一種高度遺傳的不可控疾病，其原因復雜且模糊。而一項7月28日發表于《自然-遺傳學》上的研究讓口吃的部分原因變得清晰。 研究人員利用基因檢測服務公司23andMe的龐大
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
碳離子束輻射對擬南芥基因組誘變效應研究獲進展
重離子輻射誘變育種是植物品種改良的重要手段，輻射誘變效應及分子機制的研究是涉及多學科交叉的重要共性課題。目前，對重離子輻射誘變效應的研究集中在表型、染色體畸變、遺傳物質多態性及特定基因序列分析等方面，而分子水平的突變特征研究仍相對薄弱，欠缺全基因組水平大視角、多方位及大樣本量數據支持。 中國科
擬南芥的培養
實驗概要本實驗方法就擬南芥的培養技術進行了簡單介紹。主要試劑1. PNS營養液:每升含2.5m1 1M磷酸緩沖液(pH5.5)5ml 1M KN03，2m1 1M MgSO4.7H20，2m1 1M Ca(N03)a.4H20，2.5m1 20mM? Fe.EDTA，1 ml MS微量兀素。2. 人
擬南芥的轉化
實驗概要本實驗采用花浸泡法利用農桿菌介導將目的基因轉入擬南芥。主要試劑YEB液體培養基，LB培養基，0.1 M CaCl2，0.05 M MgSO4，花浸泡緩沖液(0.5XMS，5%蔗糖，0. 03%Silwet L-77 )，Rif，Kan主要設備搖床，離心機，培養缽，溫室，托盤，塑料薄膜實驗材料
巖白菜的介紹
巖白菜（學名：Bergenia purpurascens（Hook. f. et Thoms.）Engl.）是虎耳草科，屬多年生草本植物，高可達52厘米。 其根狀莖粗壯、葉均基生、葉片革質、先端鈍圓、邊緣具波狀齒至近全緣、基部楔形、兩面具小腺窩、托葉鞘邊緣無毛。分布于中國四川西南部、云南北部及
巖白菜的簡介
巖白菜（學名：Bergenia purpurascens（Hook. f. et Thoms.）Engl.）是虎耳草科，屬多年生草本植物，高可達52厘米。 其根狀莖粗壯、葉均基生、葉片革質、先端鈍圓、邊緣具波狀齒至近全緣、基部楔形、兩面具小腺窩、托葉鞘邊緣無毛。分布于中國四川西南部、云南北部及
巖白菜的概述
巖白菜（學名：Bergenia purpurascens（Hook. f. et Thoms.）Engl.）是虎耳草科，屬多年生草本植物，高可達52厘米。 其根狀莖粗壯、葉均基生、葉片革質、先端鈍圓、邊緣具波狀齒至近全緣、基部楔形、兩面具小腺窩、托葉鞘邊緣無毛。分布于中國四川西南部、云南北部及
研究揭示擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
中國種茶樹全基因組密碼破解
記者從安徽農業大學獲悉，該校茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室宛曉春教授研究團隊，聯合深圳華大基因等單位，破解了世界上分布最廣的中國種茶樹的全基因組信息，成果日前在線發表于《美國科學院院刊》上。 世界主栽茶樹分屬兩個變種：即中國種和阿薩姆種，前者葉小，分布廣泛，適制綠茶等六大茶類；后者葉大，主