擬南芥葉綠體基因組DNA雙鏈斷裂修復的全新分子機制
2021年6月16日,清華大學生命學院/清華-北大生命科學聯合中心孫前文實驗室在Nucleic Acids Research雜志在線發表題為“RNase H1C與單鏈DNA結合蛋白WHY1/3和重組酶RecA1在擬南芥葉綠體中協作完成DNA損傷修復 (RNaseH1C collaborates with ssDNA binding proteins WHY1/3 and recombinase RecA1 tofulfill the DNA damage repair in Arabidopsis chloroplasts)”的研究論文,揭示了RNA:DNA hybrids結構協助擬南芥葉綠體基因組DNA雙鏈斷裂修復的全新分子機制。 正確修復受損DNA對基因組完整性和個體發育至關重要。作為半自主細胞器,質體必須通過一系列機制來維持自身基因組完整。孫前文實驗室之前發現通過維持三股基因組結構R-loop的水平可以保持質體免......閱讀全文
擬南芥葉綠體基因組DNA雙鏈斷裂修復的全新分子機制
2021年6月16日,清華大學生命學院/清華-北大生命科學聯合中心孫前文實驗室在Nucleic Acids Research雜志在線發表題為“RNase H1C與單鏈DNA結合蛋白WHY1/3和重組酶RecA1在擬南芥葉綠體中協作完成DNA損傷修復 (RNaseH1C collaborates
從擬南芥菜中分離葉綠體實驗
實驗材料葉組織試劑、試劑盒研磨懸浮緩沖液儀器、耗材燒杯Polytron 勻漿器實驗步驟1. 組織勻漿(1) 收集 10 g 葉組織,放進一 400 ml 的燒杯中。(2) 加入 200 ml 冰冷的研磨懸浮緩沖液。在 4℃ 的房間中,用 Polytron 勻漿器進行 6~7 個 3 秒鐘脈沖勻漿葉組
從擬南芥菜中分離葉綠體實驗
實驗材料 葉組織試劑、試劑盒 研磨懸浮緩沖液儀器、耗材 燒杯Polytron 勻漿器實驗步驟 1. 組織勻漿(1) 收集 10 g 葉組織,放進一 400 ml 的燒杯中。(2) 加入 200 ml 冰冷的研磨懸浮緩沖液。在 4℃ 的房間中,用 Polytron 勻漿器進行 6~7 個 3 秒鐘脈沖
從擬南芥菜中分離葉綠體實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 葉組織 試劑、試劑盒 研磨懸浮緩沖液 儀器、耗材
從擬南芥菜中分離葉綠體實驗
實驗材料葉組織 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?試劑、試劑盒研磨懸浮緩沖液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?儀器、耗材燒杯 ? ? ?
擬南芥葉綠體蛋白質組學分析實驗
試劑、試劑盒HEPES-KOH ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?山梨醇 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
擬南芥葉綠體蛋白質組學分析實驗
試劑、試劑盒 HEPES-KOH山梨醇抗壞血酸維生素 C半胱氨酸PF-Percoll儀器、耗材 濃縮離心設備實驗步驟 建議在短日照條件下培養材料以誘導營養生長,并在照光的早期收取材料以提高獲得完整葉綠體的產率。所以試劑應在收集材料之前準備好,并連同其他一些設備,如離心機轉頭及離心管等在冰箱或冰上冷卻
擬南芥葉綠體蛋白質組學分析實驗
試劑、試劑盒HEPES-KOH山梨醇抗壞血酸維生素 C半胱氨酸PF-Percoll儀器、耗材濃縮離心設備實驗步驟建議在短日照條件下培養材料以誘導營養生長,并在照光的早期收取材料以提高獲得完整葉綠體的產率。所以試劑應在收集材料之前準備好,并連同其他一些設備,如離心機轉頭及離心管等在冰箱或冰上冷卻至 0
DNA斷裂修復增加基因突變風險
據美國物理學家組織網近日報道,美國印第安納大學與普渡大學印第安納波利斯聯合分校(IUPUI)和瑞典優密歐大學(Umea University)最近的一項聯合研究顯示,有一種細胞用于修復自身DNA斷裂的方法(稱為斷裂誘導復制),比正常合成DNA產生的基因變異要高出2800倍。
戚益軍組揭示葉綠體逆行信號擬南芥microRNA生成重要機制
microRNA(miRNA)是一類長約21個核苷酸的內源小RNA,它們從其前體(primary miRNA, pri-miRNA)在細胞核內被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工產生,與效應蛋白 Argonaute1 結合后通過切割靶標 mRNA 或抑制翻譯等方式調節基因
戚益軍組揭示葉綠體逆行信號擬南芥microRNA生成重要機制
microRNA(miRNA)是一類長約21個核苷酸的內源小RNA,它們從其前體(primary miRNA, pri-miRNA)在細胞核內被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工產生,與效應蛋白 Argonaute1 結合后通過切割靶標 mRNA 或抑制翻譯等方式調節基因表達。葉綠體
關于同源重組的雙股斷裂修復模型介紹
雙股斷裂修復模型( double-strand break repaii。mnodel)也將同源重組分為四個階段。 1、同源序列配對。 2、形成3’端突出結構,即配對同源序列之一的DNA雙鏈水解,并由5’外切核酸酶水解,形成3'端突出結構(即3’黏端)(①~②) 3、形成Holli
德研究發現與DNA雙鏈斷裂修復相關基因
德國研究人員在尋找參與修復脫氧核糖核酸(DNA)雙鏈斷裂的基因方面獲得進展。研究小組在人類細胞中找到61個位點,并發現了此前未知的與DNA雙鏈斷裂修復有關的基因。該研究結果將顯著加速DNA修復基因的繼續搜尋,并帶來新的醫療應用可能。相關研究成果發表在6月29日的《公共科學圖書館·生物學》雜志上。
染色體斷裂,如果修復不當會導致細胞死亡
染色體斷裂是對細胞最有害的DNA損傷。如果不進行修復,它們會阻止染色體的復制和分離,停止生長周期并導致細胞死亡。這些斷裂經常出現在腫瘤細胞中,并在遺傳物質的復制過程中自然發生。為了修復遺傳物質中的這種損害,細胞將信息從未受損的子本拷貝轉移到斷裂的副本,這被稱為姊妹染色單體之間的重組。圖片來源于網
與DNA雙鏈斷裂修復相關新基因被發現
德國研究人員在尋找參與修復脫氧核糖核酸(DNA)雙鏈斷裂的基因方面獲得進展。研究小組在人類細胞中找到61個位點,并發現了此前未知的與DNA雙鏈斷裂修復有關的基因。該研究結果將顯著加速DNA修復基因的繼續搜尋,并帶來新的醫療應用可能。相關研究成果發表在6月29日的《公共科學圖書館·生
天差地別!CRISPR導致的DNA斷裂后修復與理論差距巨大
盡管世人對CRISPR-Cas9基因編輯抱有很高期望,科學家們仍對其人體臨床應用持懷疑態度。為什么呢? “基因編輯非常強大,但是到目前為止還有許多問題和錯誤需要探索。它們的工作方式就像一個黑匣子,有許多猜想和假設,”加州大學伯克利分校分子生物學教授Jacob Corn說。“現在,我們終于有能力
精確編輯基因!利用機器預測細胞修復CRISPR誘發的DNA斷裂
當雙螺旋DNA因損傷(比如X射線暴露)發生斷裂時,細胞中的分子機器會開展基因“自動校正(auto-correction)”,從而將基因組重新連接在一起,但是這種修復通常是不完美的。細胞中的天然DNA修復過程能夠以一種看似隨機且不可預測的方式在斷裂位點處添加或移除DNA片段。利用CRISPR-Ca
擬南芥轉化
實驗概要本實驗以擬南芥為試材介紹了轉化及篩選的過程。主要試劑1. 滲透培養基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH調至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%瓊脂PNS或水溶液2. 篩選培
葉綠體亞分級實驗——葉綠體亞分級
實驗材料葉綠體試劑、試劑盒裂解緩沖液儀器、耗材微量離心管小型離心機實驗步驟1. 將含 1 mg 葉綠素的葉綠體懸液吸至一微量離心管中。2. 在小型離心機中 14000 r/min 離心 30 秒鐘,棄去上清。3. 加 1 ml 裂解緩沖液,振蕩,冰浴 5 分鐘。裂解緩沖液:10 mmol/L HEP
擬南芥的培養
實驗概要本實驗方法就擬南芥的培養技術進行了簡單介紹。主要試劑1. PNS營養液:每升含2.5m1 1M磷酸緩沖液(pH5.5)5ml 1M KN03,2m1 1M MgSO4.7H20,2m1 1M Ca(N03)a.4H20,2.5m1 20mM? Fe.EDTA,1 ml MS微量兀素。2. 人
擬南芥的轉化
實驗概要本實驗采用花浸泡法利用農桿菌介導將目的基因轉入擬南芥。主要試劑YEB液體培養基,LB培養基,0.1 M CaCl2,0.05 M MgSO4,花浸泡緩沖液(0.5XMS,5%蔗糖,0. 03%Silwet L-77 ),Rif,Kan主要設備搖床,離心機,培養缽,溫室,托盤,塑料薄膜實驗材料
Nature發文:揭秘PARP酶修復癌細胞斷裂DNA雙鏈的分子機制
近日,一項刊登在國際雜志Nature上的研究報告中,來自圣猶大兒童醫院等機構的科學家們通過研究揭示了PARP酶對雙鏈DNA進行斷裂修復的結構,相關研究結果表明,PARP2能填補這一缺口并將兩條斷裂的DNA端連接在一起。此外,本文研究也深入闡明了PARP激活和催化循環背后的分子機制,這對于后期科學
Revo帶線錨釘修復急性跟腱斷裂術后并發感染病例報告
病例報道患者,男,27歲,2個月前因打籃球摔傷致“左跟腱急性閉合性斷裂(距止點約4cm)”,無糖尿病、免疫力低下、糖皮質激素應用病史,在外院行切開Revo帶線錨釘內固定跟腱修復術,術后1周切口紅腫、膿液流出,經反復換藥2個月仍未好轉。入本院后常規檢查,并行切口分泌物細菌培養、藥物敏感試驗,結合B超、
從豌豆組織分離葉綠體實驗_葉綠體分離
實驗材料葉子組織試劑、試劑盒PBF-Percoll 溶液山梨醇BSAHEPES-KOHEDTA儀器、耗材聚碳酸酯離心管實驗步驟1. 制備 Percoll 梯度(1) 兩個 50 ml 的聚碳酸酯離心管中分別加入 25 ml 50% 的 PBF-Percoll 溶液。50% PBF-Percoll0.
穿晶斷裂與沿晶斷裂說明什么
錳鋅鐵氧體的斷裂貌似是沿晶斷裂,根據我的短口SEM照片來看,有一些氣孔,且這些氣孔集中于晶界處。一般脆性較大的話應該是沿晶斷裂吧。看到文獻指出通過添加一些添加劑的方法增厚錳鋅鐵氧體的晶界以達到提高電阻率的效果,至于這個增厚程度如何是否能夠明顯強化結合力沒看到過類似的文獻報道。
如何區分穿晶斷裂和沿晶斷裂
沿晶斷裂:裂紋沿晶界擴展,可以清楚地看到一個個晶粒,晶粒面比較光滑; 穿晶斷裂:也可以看清晶界,但是晶粒面相比沿晶斷裂不是那么的光滑,也分為韌性和脆性穿晶斷裂;
科學家揭示葉綠體蛋白質量控制新機制
近日,中國科學院植物研究所研究員林榮呈等揭示了葉綠體蛋白質量控制的新機制,發現CDC48復合體可以通過泛素化蛋白酶體途徑介導葉綠體內RbcL和AtpB蛋白的降解。相關研究成果發表于《細胞通訊》。 葉綠體是綠色植物和真核藻類特有的細胞器,是光合作用以及許多其他重要生物學過程發生的重要場所。葉
葉綠體DNA分離
設備:Hitachi CS-150GXL或CS-120GXL微量超速離心機,S100AT6 轉頭,5PA 密封管(如果用4PC管,可接比例減少各層液量)溶液配制:A液:0.35Msorbitol(山梨醇),50mM Tris—Hcl (PH8.0) 25mM EDTA—Na2B液:5%(w/w)So
葉綠體是什么
葉綠體是質體的一種, 是高等植物和一些藻類所特有的能量轉換器。葉綠體是含有綠色色素(主要為葉綠素 a 、b)的質體,為綠色植物進行光合作用的場所,存在于高等植物葉肉、幼莖的一些細胞內,藻類細胞中也含有。葉綠體的形狀、數目和大小隨不同植物和不同細胞而異。
什么是葉綠體
葉綠體葉綠體(chloroplast)植物綠色細胞中存在的有色質體。其內含有葉綠素及類胡蘿卜素,是進行光合作用的場所。在高等植物中一般呈橢圓形,長軸4~10微米,短軸2~4微米。它被雙層膜(稱為外被)包圍著,內部為層膜系統和基質(或稱間質)所組成。在電鏡下觀察,每一層膜是由雙層膜組成扁平的囊,中間是