Nature匯總兩個大規模項目提出重要標準
來自加拿大蒙特利爾大學IRCM,美國哈佛大學醫學院等處的研究人員根據兩個大型研究項目:癌癥基因組計劃CGP,和癌細胞系百科全書CCLE的研究數據,指出藥物篩選研究中標準化的重要性,這對于提高篩選研究的可重復性,尋找更多新型治療性藥物具有重要的意義。 這篇文章發表在Nature雜志上,文章的通訊作者是一位來自IRCM的生物信息學家Benjamin Haibe-Kains。他在這篇文章中強調了標準化藥物篩選的重要性,這項研究表明需要進一步發展和標準化藥物篩選研究的重現性,因為這對于尋找新的治療藥物及潛在的藥物組合非常重要。 癌癥基因組計劃(CGP)是一項針對主要癌癥遺傳變異的全面整合分析的計劃。最早出現在2005年,目的是繪制一個有關各種癌癥基因異常特征的“一覽表”,以便通過系統分析找到新方法對抗這一頑疾。 而癌細胞系百科全書(CCLE)整合了來自大約1000個人類癌細胞系的基因表達,染色體拷貝數和大規模平......閱讀全文
基因芯片——生物信息精靈
基因芯片,也叫DNA芯片,是在90年代中期發展出來的高科技產物。基因芯片大小如指甲蓋一般,其基質一般是經過處理后的玻璃片。每個芯片的基面上都可劃分出數萬至數百萬個小區。在指定的小區內,可固定大量具有特定功能、長約20個堿基序列的核酸分子(也叫分子探針)。由于被固定的分子探針在基質上形成不同的探針陣列
2018基因檢測與生物信息分析論壇圓滿閉幕
2018年9月16-17日由江蘇人民政府主辦,易貿醫療協辦的2018基因檢測與生物信息分析論壇在江蘇泰州舉辦。這是一場生信人的大聚會,13場嘉賓發言,2場晚間沙龍,1場嘉賓訪談和1場閉門圓桌論壇,大家意猶未盡,期待下次的相聚!16日下午 大會首先由泰州醫藥高新技術產業園區管委會副主任梁洪基先生
Cystatin基因家族的生物信息學分析
實驗概要半胱氨酸蛋白酶抑制劑(cystatin)基因廣泛存在于植物物種中。該類基因能夠起到抑制某些病原微生物和昆蟲體內半耽氨酸蛋白酶的作用,在植物的防衛體系中起到重要作用。我們利用已經分離出植物cystatin基因的cystatin結構域為檢索序列在基因組水平上對擬南芥和水稻中的cystatin基因
轉基因生物反應器的相關信息介紹
轉基因動物是指人們按照自己的意愿有目的地將外源基因導人動物細胞內,通過與動物基因組進行穩定的整合,將生物性狀傳遞給后代動物。轉基因動物反應器是指從轉基因動物體液或血液中收獲目標產物的生命系統,其原理是將編碼活性蛋白的基因導人動物的受精卵或早期胚胎內,以制備轉基因動物,并使外源基因在動物體內(乳汁
全基因組重測序的生物信息分析內容
1.數據量產出總堿基數量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads統計,測序深度分析。2.一致性序列組裝與參考基因組序列(Reference genome sequence)的比對分析,利用貝葉斯統計模型檢測出每個堿基位點的最大可能性基因型,并組裝出該個體
華大基因成功開發移植瘤生物信息分析新算法――PDXomics?
2012年7月17日,華大基因宣布其成功開發出一套適用于異種移植瘤模型生物信息學分析的新算法——PDXomics?,該算法能夠將移植瘤與宿主基因組序列進行區分,有效地排除后續分析中異源物種數據的污染,保證分析結果的準確性和可靠性,從而可使移植瘤模型更為有效的應用于腫瘤新藥開發和疾病機理研究。
生物信息學技術:基因芯片實驗原理與方法
本實驗的目的是學會cDNA芯片的使用方法。了解各種基因芯片的基本原理和優缺點。基因芯片這一技術方法在1991年的Science雜志上被提出,其高通量、并行檢測的特點適應了分析人類基因組計劃所提供的海量的基因序列信息的需要,可以說,人類基因組計劃是基因芯片技術發展的原因,而對深人研究基因突變和基因表達
生物信息分析數據挖掘
DNA芯片技術能夠在基因組水平分析基因表達,檢測許多基因的轉錄水平及在不同條件下的基因轉錄變化,顯示反映特征組織類型、發育階段、環境條件應答、遺傳改變的基因譜。基因芯片產生了海量的數據,僅僅進行差異表達分析還遠遠不夠,如何管理分析這些數據、從中挖掘信息已經成為利用這一技術的新的難點。芯片數據大量出現
天津工業生物所通過信息整合獲得更可靠的基因組注釋
不同來源的數據信息的比較整合是提高數據質量,獲得對特定生物更準確認識進而進行設計改造的常用方法。目前已有多種基于web的基因組注釋服務(如RAST, JCVI, IMG, IGS等),通過這些服務提交序列信息即可得到基因注釋結果,但不同服務得到的結果往往有較大不同,因此對不同來源的基因注
“計算生物學與生物信息學術研討會”在基因組所召開
隨著生命科學研究及基因測序等相關技術的飛速發展,計算生物學的重要性和復雜性在當前生物學數據量的不斷增長中日益顯現,并逐漸成為現代生物學研究的核心方法之一。為了推動國內相關研究單位間計算生物學和生物數據庫等領域的交流與合作,10月27日至28日,中科院北京基因組研究所召集國內外眾多
信息素生物測定的概念
中文名稱信息素生物測定英文名稱bioassay of pheromone定 義測定信息素引起同種動物靶標的行為或生理反應的大小與強度。應用學科生態學(一級學科),化學生態學(二級學科)
生物信息學教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
信息素生物測定的定義
中文名稱信息素生物測定英文名稱bioassay of pheromone定 義測定信息素引起同種動物靶標的行為或生理反應的大小與強度。應用學科生態學(一級學科),化學生態學(二級學科)
信息素生物測定的定義
中文名稱信息素生物測定英文名稱bioassay of pheromone定 義測定信息素引起同種動物靶標的行為或生理反應的大小與強度。應用學科生態學(一級學科),化學生態學(二級學科)
信息素生物合成的定義
中文名稱信息素生物合成英文名稱biosynthesis of pheromone定 義在生物體內生成信息素的過程。應用學科生態學(一級學科),化學生態學(二級學科)
基因組學:將數字信息轉化為生物學功能
優勢 ·????? 同時檢測克隆和定量熒光標記---使用表現型篩選克隆 ? ·????? 從加樣、涂布到挑取完全自動化工作流程 ? ·????? 從樣品涂布到挑取、復制和重排記錄并追蹤樣品數據 ? ·????? 每天準確挑取超過30000個篩選到的克隆,效率>98% ? 美國能源部聯合基因組研究所(
生物信息學在基因芯片數據功能分析中的應用
隨著人類基因組計劃(Human Genome Project)即全部核苷酸測序的即將完成,人類基因組研究的重心逐漸進入后基因組時代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多樣性傾斜。通過對個體在不同生長發育階段或不同生理狀態下大量基因表達的平行分析,研究相應基因在生物體內的功能
生物信息學在基因芯片數據功能分析中的應用
隨著人類基因組計劃(Human Genome Project)即全部核苷酸測序的即將完成,人類基因組研究的重心逐漸進入后基因組時代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多樣性傾斜。通過對個體在不同生長發育階段或不同生理狀態下大量基因表達的平行分析,研究相應基因在生物體內的功能,
VHL基因的基本信息
VHL基因的突變會導致林島綜合征(Von Hippel—Lindau Syndrome,VHL),即VHL綜合征,也VHL基因名字的來源。VHL綜合征是常染色體顯性遺傳性腫瘤疾病,一般包括腎囊腫、腎細胞癌、胰腺囊腫、胰腺癌、嗜鉻細胞瘤、視網膜血管瘤、上皮性囊腺瘤和大腦脊髓的血管瘤病。發病機制為VHL
生物芯片用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
生物信息學在人類基因組計劃中的應用
生物信息學是當前生物學領域的研究熱點,預計在未來的若干年它將變得越來越重要、越來越引起人們的重視。近期任務由于未來幾年蛋白質和核酸的測序數據將以指數方式增加,近期生物信息學將在以下幾方面迅速發展:大規模基因組測序中的信息分析大規模測序是基因組研究的最基本任務,它的每一個環節都與信息分析緊密相關。目前
《基因組蛋白質組與生物信息學報》影響因子顯著提高
在日前舉行的第四屆中國英文版科技期刊研討會上,中國科學技術信息研究所發布了《2007年版中國英文版科技期刊引證報告》。根據這一報告提供的數據,中科院北京基因組研究所主辦的《基因組蛋白質組與生物信息學報》(Genomics,? Proteomics? &? Bioinformatics,簡稱GPB)的
轉基因生物的發展
隨著分子生物技術的不斷發展,尤其是上世紀90年代末以來,科學家們能夠在不導入外源基因的情況下,通過對生物體本身遺傳物質的加工、敲除、屏蔽等方法也能改變生物體的遺傳特性,獲得人們希望得到的性狀。 在此類情形下,沒有轉入外源基因,嚴格說就不能再稱為轉基因,稱為“基因修飾”更加合適和全面,因此現在開
轉基因生物的概念
“轉基因生物”一詞的最初來源是英語“Transgenic Organisms”,因為在上世紀70年代,重組脫氧核糖核酸技術(rDNA)剛開始應用于動植物育種的時候,常規的做法是將外源目的基因轉入生物體內,使其得到表達,因而在早期的英語文獻中,這種移植了外源基因的生物被形象地稱為“transgenic
轉基因生物的種類
應用轉基因技術培育的轉基因生物已多達上百種,它們中有的用于生產醫藥類的疫苗、生物制劑;有的用于生產食品工業中的纖維素酶、凝乳酶;有的用于消除環境污染;還有許多轉基因生物在農業生產中發揮了重要作用。
關于生物酶的信息簡介
生物酶是一種無毒、對環境友好的生物催化劑,其化學本質為蛋白質。人類利用生物酶的歷史已非常悠久,遠在6000年前,巴比倫人已用麥芽釀造類似啤酒的飲料。5000年前,巴比倫人已懂得將乙醇轉變為醋的方法,阿拉伯人利用羊胃膜凝乳酶制造干酪。我國先民利用酶的歷史也非常悠久,秦漢以前人們已掌握制造美味豆醬的
生物識別技術:-領跑信息安全時代
生物識別技術因其安全、便捷等優勢近年獲得了用戶的青睞,得到快速的發展。但是利用生物識別技術收集在數據庫中的信息,卻是它的“阿喀琉斯之踵”,能否保證這些信息的安全,防止信息被復制和濫用就成為影響其健康發展的重要因素。 進入現代社會以后,人們的生活高度信息化,一個突出特征就是人們高度依賴由互聯
Qiagen公司收購生物信息公司OmicSoft
分析測試百科網訊 近日,Qiagen公司宣布已使用現金收購了生物信息公司OmicSoft。 該交易的具體價格未作披露。 OmicSoft推出了一套工具,使研究人員能夠分析和可視化數據,并將其與大型的,可公開獲得的多組學數據集進行比較。 Qiagen說,該收購將為其提供可擴展和靈活的軟件架構解
生物素的基本信息
中文名稱:生物素?中文別名:維生素H;D-生物素? ;D-(+)-生物素? ;VH英文名稱:Vitamin H維生素H英文別名:D-Biotin ;Biotin? ;Vitamin B7 ;CAS:58-85-5EINECS:200-399-3?分子式:C10H16N2O3S?分子量:244.303
生物樣本庫的信息系統
生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統是為了便利于有效的管理生物樣本和相關信息所建立的具有搜集、保存、檢索和分析功能的信息系統。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核內容。為此: 生物樣本庫(Biobank)資源管理信息系統的功能包括但不限于:追蹤捐贈者的問卷和知情同意,管理生物樣本采集、