不同來源的數據信息的比較整合是提高數據質量，獲得對特定生物更準確認識進而進行設計改造的常用方法。目前已有多種基于web的基因組注釋服務(如RAST, JCVI, IMG, IGS等)，通過這些服務提交序列信息即可得到基因注釋結果，但不同服務得到的結果往往有較大不同，因此對不同來源的基因注釋信息進行數據比對整合對得到可靠的注釋結果非常重要。但由于很多注釋信息并不標準化，這個比較整合的過程常常需要費時的人工檢驗核對。
近日，中科院天津工業生物技術研究所研究員馬紅武和英國愛丁堡大學合作提出了一種通過對不同來源的基因組注釋數據整合得到更準確可靠的注釋結果的半自動化方法。研究組對由四種基因組注釋服務(RAST, JCVI, IMG, IGS)得到的注釋結果進行了比較分析。首先，通過程序對用各種ID(如EC號，COG ID，Pfam ID等)表示的功能進行比較，然后重點通過借鑒計算機科學領域中自然語言處理的方法解決了對基因功能描述的文本直接進行比較的問題。這使得87%的基因功能注釋都可以通過程序自動比較，僅僅13%需要費時的手動比較。在此基礎上，研究組又引入了一個多數規則來確定正確的基因功能注釋，從而得到整合多種來源數據的更可靠的一致化的注釋結果。將該方法應用于6種不同生物的基因組注釋的結果充分證明了該方法的有效性。
相關研究成果發表于BMC Bioinformatics 期刊上。
對六種生物不同來源的基因組注釋信息進行自動化比較的結果
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國際期刊《內分泌學前沿》日前刊登的一項新研究揭示，一種特殊基因對腸道吸收維生素D及其后續代謝過程至關重要，阻斷或抑制該基因能夠選擇性抑制癌細胞生長。這一發現在癌癥治療等精準醫學領域具有廣闊應用前景。維......
記者從安徽農業大學獲悉，該校王曉波教授團隊聯合中國農業科學院作物科學研究所邱麗娟、李英慧研究員團隊，解析了關鍵基因對大豆種子油脂和蛋白比例（油蛋比）的調控機制，為高油或高蛋白大豆品種選育提供了新方向。......