科學家開發逆轉座子基因工程新技術?實現全RNA介導的基因精準寫入
基因組DNA是生命的藍圖，對基因組DNA實現任意尺度的精準操作代表對生命藍圖進行修改繪制的底層能力，是基因工程技術發展的核心。以CRISPR基因編輯技術為代表的技術進步實現了基因組單堿基和短序列尺度的精準編輯，基本解決了基因組精準編輯的挑戰。然而，如何針對應用場景的需求，實現大片段DNA在基因組的高效精準整合，仍然是整個基因工程領域亟需突破的難題。該技術的突破意味著可以通過外源功能基因的精準寫入來干預多種不同位點基因突變導致的單基因遺傳缺陷等疾病，從而開發更為通用的基因與細胞療法，具有廣泛的應用前景。 針對這一重大技術挑戰，多種基因寫入技術已被開發，如CRISPR核酸酶介導的同源重組或非同源末端連接技術等，但是這些技術都依賴于DNA模板作為基因寫入的供體（donor）。在實際醫學應用中，DNA供體面臨免疫原性高、在體（in vivo）遞送困難、在基因組中具有隨機整合風險等諸多挑戰。相比之下，RNA供體具有免疫原性低、可被非......閱讀全文
RNA介導的基因沉默實驗
實驗材料pGEM-T 載體 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?DNA 模板 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?試劑、試劑盒d
RNA介導的基因沉默實驗
實驗材料 pGEM-T 載體DNA 模板試劑、試劑盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶（Sigma) 及配套緩沖液限制酶儀器、耗材 PCR 純化試劑盒或柱子實驗步驟 一、篩選目的基因片段的參數1. 序列( 1 ) 構建一個指定的 RNA 沉默載體首先要進行生物信息學分析。根據目的基因對應的已知 c
RNA介導的基因沉默實驗
實驗材料pGEM-T 載體DNA 模板試劑、試劑盒dNTP 混合物DNA 聚合酶（Sigma) 及配套緩沖液限制酶儀器、耗材PCR 純化試劑盒或柱子實驗步驟一、篩選目的基因片段的參數1. 序列( 1 ) 構建一個指定的 RNA 沉默載體首先要進行生物信息學分析。根據目的基因對應的已知 cDNA 序列
基因敲除，rna干擾，基因沉默有什么關系
基因敲除一般指永久的、不可逆轉的敲除/失活靶基因，目前其中一種熱門的，常見的基因敲除方法是CRISPR/Cas9，利用gRNA靶向靶基因并指導cas9切割基因雙鏈，形成移碼突變或片段敲除來完成基因敲除。基因沉默與基因敲除不同的地方在于，沉默可以是暫時性的、可逆轉的失活基因/抑制基因表達，基因可以是存
新基因編輯技術“RNA橋”來了！
科學家在兩項獨立研究中描述了一種新的基因組編輯技術，能在用戶指定的基因組位點插入、倒位或刪除長DNA序列，實現這些基本DNA重排的單步法或提供一種更簡易的基因組編輯方法。該方法或比現有技術更有優勢，例如有望比現有技術進行更精準、有效的大規模基因組編輯，以及能介導重組而非造成需要修復的斷裂。相關研究近
RNA干擾（轉錄后基因沉默）實驗
RNA干擾 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 1. 病毒基因、人工轉入基因、轉座子等外源性基因隨機整合到宿主細胞基因組內，并利用宿主細胞進行轉錄時，常產生一些dsR
新基因編輯技術“RNA橋”來了！
科學家在兩項獨立研究中描述了一種新的基因組編輯技術，能在用戶指定的基因組位點插入、倒位或刪除長DNA序列，實現這些基本DNA重排的單步法或提供一種更簡易的基因組編輯方法。該方法或比現有技術更有優勢，例如有望比現有技術進行更精準、有效的大規模基因組編輯，以及能介導重組而非造成需要修復的斷裂。相關研究近
基因表達RNA加工的機制介紹
原核蛋白編碼基因的轉錄產生的是可以翻譯成蛋白質的信使RNA（mRNA）,但真核基因的轉錄會產生RNA的初級轉錄本（pre-mRNA）,必須經過一系列加工才能成為成熟RNA（mRNA）。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物細胞核帶來的進化優勢。在原核生物中
“RNA橋”新基因編輯技術問世
RNA橋。圖片來源：Visual Science本報訊?《自然》6月26日發表的兩篇論文描述了一種新的基因組編輯技術，這種技術能在用戶指定的基因組位點插入、倒位或刪除長DNA序列，這項技術有望成為這些基本DNA重排的單步法或提供一種更簡易的基因組編輯方法。該方法可能比現有技術更有優勢，比如有望進行比
RNA干擾（轉錄后基因沉默）實驗
RNA干擾（RNA interference, RNAi）是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA（double-stranded RNA，dsRNA）誘發的、同源mRNA高效特異性降解的現象。目前主要用于（1）特異性剔除或關閉特定基因的表達 （2）探索基因功能和傳染性疾病及惡性腫瘤的治療 （3）使
基因敲除與RNA干擾的關系
20世紀80年代初，胚胎干細胞分離和體外培養的成功為基因敲除奠定了技術基礎。1985年，首次證實的哺乳動物細胞中同源重組(homology recombination, HR)的存在為基因敲除奠定了理論基礎[2]。為了編輯基因，傳統的靶向特定等位基因的同源重組技術被使用，但是，這個方法在當年來說，存
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
分子遺傳學詞匯轉移RNA基因
中文名稱：轉移RNA基因英文名稱：transfer RNA gene;tRNA gene定 義：轉錄后可產生tRNA的基因。應用學科：遺傳學（一級學科），分子遺傳學（二級學科）
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析,所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析,來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
賽爾基因口服RNA藥物顯示療效
今天賽爾基因宣布其口服RNA藥物mongersen（GED0301）在一個克羅恩癥臨床1b試驗中顯示療效。這個臨床試驗中有63名中重度克羅恩患者參與，三組病人使用每日160毫克mongersen（12周mongersen，8周mongersen+4周安慰劑，4周mongersen+8周安慰劑）。
基因組分析揭示等位基因特異RNA編輯現象
核糖核酸（RNA）編輯是RNA水平一種常見的修飾，是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。17日，來自中科院昆明動物研究所的消息，由張亞平院士領導的、多個研究機構加盟的團隊，在等位基因特異的RNA編輯研究上取得了重要進展。 中科院昆明動物研究所周中銀博士介紹，對二倍體生物來說，雖然兩個等位基因的
基因組分析揭示等位基因特異RNA編輯現象
核糖核酸（RNA）編輯是RNA水平一種常見的修飾，是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。17日，來自中科院昆明動物研究所的消息，由張亞平院士領導的、多個研究機構加盟的團隊，在等位基因特異的RNA編輯研究上取得了重要進展。 中科院昆明動物研究所周中銀博士介紹，對二倍體生物來說，雖然兩個等位基
篩選或驗證RNA修飾直接靶點，研究RNA修飾靶基因的調控...
篩選或驗證RNA修飾直接靶點，研究RNA修飾靶基因的調控機制技術簡介用體外轉錄法標記生物素RNA探針，然后與胞漿蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白質復合物。該復合物可與鏈霉親和素標記的磁珠結合，從而與孵育液中的其他成分分離。復合物洗脫后，通過Western Blot檢測特定的RNA結合蛋白是否與R
使用“RNA橋”的新基因編輯技術問世
《自然》6月26日發表的兩篇論文描述了一種新的基因組編輯技術，這種技術能在用戶指定的基因組位點插入、倒位或刪除長DNA序列，這項技術有望成為這些基本DNA重排的單步法或提供一種更簡易的基因組編輯方法。該方法可能比現有技術更有優勢，比如有望進行比后者更精準有效的大規模基因組編輯，以及能夠實現基因組的介
反義RNA調控細菌基因的表達功能介紹
反義RNA對編碼CAP的基因的調控作用已如前述。這里再介紹一下micF RNA對ompF基因的表達的調控。ompF蛋白質是大腸桿菌的外膜蛋白的主要成分這一。micF RNA是從另一基因(ompC基因)附近的DNA序列轉錄而來，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互補，因此在體外m
關于核糖體RNA基因的基本介紹
RNA一般與核糖體蛋白質結合在一起，形成核糖體（ribosome），如果把rRNA從核糖體上除掉，核糖體的結構就會發生塌陷。原核生物的核糖體所含的rRNA有5S、16S及23S三種。S為沉降系數（sedimentation coefficient），當用超速離心測定一個粒子的沉淀速度時，此速度與
Cell：RNA機器如何越過基因組障礙
曾幾何時，科學家們認為，RNA聚合酶——通過將DNA轉錄成RNA開啟蛋白質合成的分子，就像一個發條玩具那樣工作：它置于我們DNA中的一個起始位點上，一直穩步急速運作，抽出一個RNA拷貝，直到它到達停靠位置。延伸閱讀：單細胞RNA-seq實現細胞空間定位。 最近，科學家們意識到，他們沒有給予RN
DNA與RNA能協同互補調控基因表達
比利時布魯塞爾自由大學主導的一項研究揭示，DNA和RNA的表觀遺傳學協同調控比過去想象的更加緊密。這項發表在最新一期《細胞》雜志上的研究，結合了DNA和RNA研究結果，指出這兩種調控方式共同作用，形成一個互補系統：DNA表觀遺傳學決定了哪些基因可以被激活，而RNA表觀遺傳學則動態調整這些基因的表達水
RNAi——雙鏈RNA引起的基因敲除（1）
1995年，康奈爾大學的Su Guo博士用反義RNA阻斷線蟲基因表達的試驗中發現，反義和正義RNA都阻斷了基因的表達，他們對這個結果百思不得其解。直到1998年， Andrew Fire的研究證明，在正義RNA也阻斷了基因表達的試驗中，真正起作用的是雙鏈RNA[1]。這些雙鏈RNA是體外
反義RNA的調控細菌基因的表達功能
反義RNA對編碼CAP的基因的調控作用已如前述。這里再介紹一下micF RNA對ompF基因的表達的調控。ompF蛋白質是大腸桿菌的外膜蛋白的主要成分這一。micF RNA是從另一基因(ompC基因)附近的DNA序列轉錄而來，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互補，因此在體外mic
m5C－RNA修飾靶基因驗證
技術簡介 RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡的有力工具。這種技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，然后經過分離純化就可以對結合在復合物上的RNA進行分析。RIP-Seq將RIP技
小干擾RNA轉錄后基因沉默的介紹
siRNA誘導的轉錄后基因沉默始于RNA誘導的沉默復合物（RISC）的組裝。該復合物通過切割編碼靶基因的mRNA分子來沉默某些基因表達。為了開始該過程，兩條siRNA鏈中的一條（引導鏈）將被裝載到RISC中，而另一條鏈即過客鏈被降解。某些Dicer酶可能負責將引導鏈加載到RISC中。然后，siR
簡述RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必
RNAi——雙鏈RNA引起的基因敲除（2）
在構建雙鏈RNA的表達載體時，使用RNA多聚酶Ⅲ來指導RNA的合成。這是因為RNA多聚酶Ⅲ有明確的啟始和終止序列，而且合成出的RNA不會帶有polyA尾。當RNA多聚酶Ⅲ遇到連續5個胸腺嘧啶時，它指導的轉錄就會終止，并且轉錄產物在第二個尿嘧啶處被切下來。U6啟動子能被RNA多聚酶Ⅲ識別， 合