新一代測序技術的先鋒SOLiD系統
2008年12月 作為上世紀生命科學領域最重要的技術發明之一，測序技術深刻地改變了我們對生命本質的理解和掌控能力。假如沒有測序技術，基因序列就無法確定，酶切、克隆、反轉錄、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技術也就根本無從談起，生命科學領域也不會有今日的蓬勃發展。無人不曉的GenBank；歷時13年、耗資3億美元、全球合作的人類基因組計劃，無不建立在測序的基礎上，極大地推動了全球生命科學領域研究的發展。 但是，人類永遠不會停下創新的腳步。不斷創新，把原本不可能的變為可能，把既慢又費力的工作變為簡單快捷，本來就是科技最奇妙、最吸引人的地方。生命科學領域更不例外。 科學家一直在努力尋求測序技術的創新。新一代測序技術的誕生和發展，令1000人基因組計劃，以及各物種的基因組圖譜如雨后春筍般地涌現。歷時13年耗資3億美元的HGP從此成為歷史------完成人類基因組測序，如今只要區區1萬美元，1輪反應，1個實驗室，數周時間-......閱讀全文
AB－SOLiD測序儀
AB SOLiD測序儀可以對由任何方法制成的DNA文庫進行測序。AB SOLiD測序儀有一個極大的特點就 是能夠將富集模板片段的微珠在芯片上進行高度可控的任意排列。AB SOLiD測序儀也是使用如圖5a中所示 的微乳液PCR方法擴增模板片段的，不過，它這里使用的是直徑只有1μm的小磁珠。PCR擴增反
solid4測序儀
羅氏454、Illumina不久前分別宣布推出了新測序儀，生命科技公司當然也不甘落后。1月底，SOLiD? 4測序系統的神秘面紗被揭開。 據生命科技公司介紹，Applied Biosystems的SOLiD 4系統目前每次運行能產生100 GB可定位的序列數據，每個基因組的測序費用降至6000
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶，能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2（NSUN2-/-HEK293細胞）后進行
新一代測序技術的先鋒SOLiD系統
2008年12月 作為上世紀生命科學領域最重要的技術發明之一，測序技術深刻地改變了我們對生命本質的理解和掌控能力。假如沒有測序技術，基因序列就無法確定，酶切、克隆、反轉錄、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技術也就根本無從談起，生命科學領域也不會有今日的蓬勃發展。無人不曉的GenBank；
新一代測序技術（下）SOLiD－(ABI)
【摘要】 2005年454公司首推劃時代的新一代測序儀，從而引發了測序市場上454、Illumina、ABI等公司在新一代測序技術上的比拼高潮。也正是這種你追我趕，讓繪制人類全基因組圖譜由過去的耗費4.37億美元和13年時間，驟然縮短到如今SOLiD 3運行一次即獲得50GB可定位測序數據。新一代
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...2
（二）云序客戶m6A RNA甲基化修飾表達譜，一次測序兩篇文章疾病：胃癌樣品：胃癌組織vs癌旁組織（6 vs 6）研究方法：m6A-MeRIP-Seq，RNA-seq4. m6A修飾對其修飾基因在胃癌中的異常表達及預后的潛在影響發表雜志：Frontiers in Genetics影響因子：3.258
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...1
一次RNA甲基化測序的多項成果-云序RNA甲基化測序技術大公開文章導讀RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程，目前對m6A RNA修飾的研究已進行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修飾以及ac
RNA甲基化研究
近期華人科學家辛辛那提大學陳建軍教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修飾在正常和惡性造血過程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信號軸在髓系分化以及白血病發生過程中的作用。該研究于2018年1月發表在干細胞頂級期刊《Cell Steam Cell》（影響因子：
高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀，分別是Solexa，454 (GS-FLX)，SOLiD和Polonator。根據測序原理，它們可以被分為兩大類：使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454，及使用連接法測序(Sequencing by Ligat
新一代高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀，分別是Solexa，454 (GS-FLX)，SOLiD和Polonator。根據測序原理，它們可以被分為兩大類：使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454，及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
新一代高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀，分別是Solexa，454 (GS-FLX)，SOLiD和Polonator。根據測序原理，它們可以被分為兩大類：使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454，及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
SNP檢測技術（測序、taqman探針和snp芯片）
snp現有檢測技術有主要的3大類別1、測序 主要發現新的snp位點和比較集中的snp位點，如hla區域，但成本較高，工作量大，不適合大樣本做疾病關聯分析。 2、taqman探針 結果比較可靠，國外文章也大量應用，不過對于國內成本偏高，同類還有snpshot技術，abi和貝克曼
m5C－RNA甲基化測序介紹
m5C RNA甲基化簡介通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊。RNA甲基
高通量測序（NGS）的原理簡介
高通量測序（High-Throughput Sequencing）又名下一代測序（Next Generation Sequencing，NGS），是相對于傳統的桑格測序（Sanger Sequencing）而言的。目前高通量測序的主要平臺代表有羅氏公司(Roche)的454測序儀（Roch
SOLiD－5500新一代測序儀性能大盤點
2010年12月16日 生命科技公司（Life Technogy Inc.），宣布推出的SOLiD? 5500和SOLiD? 5500xl新一代測序儀。 上海伯豪生物技術有限公司作為ABI公司服務供商，將在2011年利用SOLiD? 5500xl為廣大科研工作者提供更為全面的新一代測序服務解決
RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達 17 篇。
RNA甲基化研究深度剖析（一）
一、聽說最近?RNA甲基化很火，它是何方神圣？1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達?17?篇。 圖：RNA甲基化近期高
“RNA－甲基化”研究匯總——擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育
萬元全基因組測序在望－全新分析平臺登場
今年早期，ABI公司應用SOLiD 3系統領先的寡核苷酸連接和檢測技術對人類基因組進行了測序，費用低于6萬美元。這臺新儀器的技術改進使更高的樣品和數據通量成為可能，從而有望進一步降低基因組測序的費用。例如，更廉價的基因組數據有望加速疾病關聯和生物標志物的發現，從而改善診斷和疾病處理，支持與個人最佳治
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化（二）
5.進化角度分析人類m6A修飾位點作者通過比較人鼠之間保守m6A位點比例和保守對照A比例，來評估CDS區域m6A位點面臨的自然選擇壓力，發現發生于第 一個密碼子處的m6A的周圍序列保守程度低，可能由于此處的m6A會帶來不利的影響比如影響tRNA結合，而發生于第三個密碼子處的m6A則受到進化選
最新DNA甲基化測序技術比較研究
在不同疾病中，DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具體模式通常與諸如疾病亞型、疾病預后以及藥物反應等臨床信息具有一一對應的聯系。在多種癌癥的治療過程中，DNA甲基化生物標志物可以幫助臨床醫生選擇恰當的治療方式。 對于擁有成千上萬個樣本的大量病人來說，全基因組映射與DNA甲基化分析是非常合
m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在
PYRO測序用于SNP基因分型原理
其實是一種段片段焦磷酸測序技術，在測序引物的引導下，完成段片段（含snp）的測序，從而實現基因分型。缺點：不能檢測長片段，對于重復序列沒有辦法。原理簡介1.測序引物與單鏈，PCR擴增的DNA模板相結合。然后將其與DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、熒光素酶和三磷酸腺苷雙磷酸酶，以及底物APS和熒光素一起孵
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化
文章導讀 m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾，通過多種機制，比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異，m6A位點在轉錄本上的位置分布，以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響，近期Nucle
云序生物獨家首發m5C－RNA甲基化測序
m5C RNA甲基化簡介 通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊
云序生物獨家首發m5C－RNA甲基化測序
m5C RNA甲基化簡介 通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊
表觀遺傳研究熱點：RNA－甲基化（m6A）研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入，組蛋白修飾（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和?DNA?甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存在可逆的表觀遺
表觀遺傳研究熱點：RNA－甲基化（m6A）研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入，組蛋白修飾（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和 DNA 甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存
數十個測序平臺技術參數盤點
1.第二代測序技術1.1 Roche 454 測序平臺Roche 454（Genome Sequencer 20 System）是第一個NGS測序平臺，由美國454 Life Sciences公司于2005年推出，2007年被瑞士Roche公司收購。此后Roche公司在此基礎上開發了Roch
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化
文章導讀 m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾，通過多種機制，比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異，m6A位點在轉錄本上的位置分布，以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響，近期Nucle