“拉曼組內關聯分析”揭示代謝物轉化網絡
細胞內代謝物之間是否正在發生相互轉化,是細胞代謝活動最重要的動態特征之一,但其檢測方法繁瑣。為此,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心提出名為“拉曼組內關聯分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理論框架與算法,并示范了細胞工廠功能測試等方面的應用。在無需標記或破壞細胞的前提下,IRCA僅需基于一個拉曼組數據點(即一個樣品的一個狀態),利用其中不同單細胞拉曼光譜的差異,就能推測該狀態下的代謝物相互轉化網絡。相關研究成果于8月31日發表在mBio上。 傳統上,代謝物相互轉化網絡的構建基于質譜或色譜等代謝組學方法,其通常破壞細胞,每次分析需要大量細胞,且要求基于一系列不同代謝狀態的實驗樣品進行關聯比較,導致整個過程十分繁瑣。單細胞中心提出了基于“拉曼組”(ramanome)的原創解決方案。拉曼組是一個細胞群體在特定狀態下單細胞拉曼光譜的集合,這些單細胞盡管遺傳背景與......閱讀全文
“拉曼組內關聯分析”揭示代謝物轉化網絡
細胞內代謝物之間是否正在發生相互轉化,是細胞代謝活動最重要的動態特征之一,但其檢測方法繁瑣。為此,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心提出名為“拉曼組內關聯分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理論框架與算法,并示范了細胞工廠功能測
研究提出“過程拉曼組”技術助力啤酒發酵過程智能監控
啤酒的風味與品質主要由發酵過程中酵母代謝產生的醇、酯、酸等多種化合物共同決定。傳統發酵過程監控主要依賴氣相色譜、液相色譜等多種儀器來“分別”檢測發酵液中不同物質的含量,過程繁瑣、耗時長且成本高昂。更重要的是,這些發酵過程監控技術無法快速獲取酵母細胞自身的實時代謝狀態,也忽視了細胞群體中存在的代謝差異
拉曼分析
當一束激發光的光子與作為散射中心的分子發生相互作用時,大部分光子僅是改變了方向,發生散射,而光的頻率仍與激發光源一致,這中散射稱為瑞利散射。但也存在很微量的光子不僅改變了光的傳播方向,而且也改變了光波的頻率,這種散射稱為拉曼散射。其散射光的強度約占總散射光強度的10-6~10-10。拉曼散射的產生原
拉曼光譜結合人工智能無損表征微生物研究取得進展
近日,中科院微生物研究團隊在微生物表征研究上取得進展,在線發表兩項研究成果,利用拉曼光譜結合人工智能技術實現了微生物單細胞水平的快速準確鑒定并證明了使用拉曼光譜表征基因轉錄的可行性。 拉曼光譜作為化學分子的“指紋圖譜”,可以對生物樣品在溶液中進行無損、非標記、非接觸的原位檢測分析。在微生物研究
拉曼技術正在坐等臨床轉化
拉曼技術正在坐等臨床轉化 “拉曼技術正在坐等臨床轉化。這項研究只需要有針對性地打破障礙,以拉曼作為臨床工具向前邁進。” Mahadevan Jansen說。一旦這樣,內外科醫生將可以更加準確有效地診斷多種疾病。 一項正在進行的研究表明,基于拉曼的設備可以廣泛應用在臨床診斷中。此外,該技術可以用于
首創拉曼云平臺!輕松分析復雜數據!
成千上萬條拉曼光譜數據,到底蘊含了哪些生物學意義?代碼不熟、理論知識不足、終端算力不夠,也想輕松徜徉拉曼數據瀚海?人工智能時代,一切皆有可能!在剛剛落幕的2024中國生命科學大會上,青島星賽生物科技有限公司(以下簡稱“星賽生物”)正式發布了一站式拉曼組智能云專家系統——拉曼智云(RamanAI;ww
單細胞拉曼光譜助力揭示持留菌的代謝特征
近期,中國科學院青島生物能源與過程研究所與香港大學合作,利用單細胞拉曼光譜技術在單菌體精度揭示了持留菌的代謝特征,為研究微生物持留現象的產生和持留菌復蘇的機制提供了進一步的線索,有助于開發針對慢性感染復發的新治療策略和方法。 面對惡劣的生存條件和巨大的生存壓力,微生物開發了多種策略,“持留”(
《分析化學》:基于拉曼組的腫瘤單細胞藥敏檢測新方法
腫瘤藥敏性檢測方法學是抗癌藥物評價和篩選的前提,也是臨床化療方案設計的基礎。青島能源所單細胞中心開發了基于拉曼組的腫瘤單細胞藥敏檢測新方法D2O-CANST-R,具有快速、低成本、單細胞器精度、識別耐藥細胞、體現抗癌機制、可對接單細胞分選和測序等特色,為癌細胞-藥物互作研究、抗癌藥物篩選等提供
拉曼光譜的分析
通過的結構分析解釋光譜: 分子為四面體結構,一個碳原子在中心,四個氯原子在四面體的四個頂點。當四面體繞其自身的一軸旋轉一定角度,或記性反演(r—-r)、或旋轉加反演之后,分子的幾何構形不變的操作稱為對稱操作,其旋轉軸成為對稱軸。CCI4有13個對稱軸,有案可查4個對稱操作。我們知道,N個原子構
基于拉曼組與機器學習的微藻種質挖掘新技術
微藻是地球上代謝功能較為多樣化的生物類群,在全球碳循環中發揮關鍵作用,也是生物技術產業中重要的一類光合細胞工廠。但微藻的種質鑒定和代謝功能檢測繁瑣,且自然界大部分微藻難以培養。近日,中國科學院青島能源研究所單細胞中心發表了首個微藻拉曼組數據庫,并結合機器學習示范了單細胞精度、快速的微藻種類鑒定和
科學家開發出物種代謝雙靶向的微生物細胞及酶資源挖掘新技術
微生物及其合成的各種酶支撐著生物圈中較多關鍵的生態過程。在環境中高效識別與挖掘具有特定原位代謝功能的細胞和酶是微生物組科學與產業的熱點。近日,中國科學院青島生物能源與過程研究所聯合自然資源部第一海洋研究所、山東大學等,開發了熒光原位雜交介導的拉曼激活單細胞分選與測序(FISH-scRACS-seq)
拉曼光譜的分析技術
幾種重要的拉曼光譜分析技術1、單道檢測的拉曼光譜分析技術2、以CCD為代表的多通道探測器的拉曼光譜分析技術3、采用傅立葉變換技術的FT-Raman光譜分析技術4、共振拉曼光譜分析技術5、表面增強拉曼效應分析技術拉曼光譜用于分析的優點和缺點1、拉曼光譜用于分析的優點拉曼光譜的分析方法不需要對樣品進行前
拉曼光譜的分析技術
幾種重要的拉曼光譜分析技術1、單道檢測的拉曼光譜分析技術2、以CCD為代表的多通道探測器的拉曼光譜分析技術3、采用傅立葉變換技術的FT-Raman光譜分析技術4、共振拉曼光譜分析技術5、表面增強拉曼效應分析技術拉曼光譜用于分析的優點和缺點 1、拉曼光譜用于分析的優點拉曼光譜的分析方法不需要對樣品進行
分析·拉曼光譜應用淺談
01、拉曼光譜的發現和產生 光和介質分子相互作用時會引起介質分子作受迫振動從而產生散射光,其中大部分散射光的頻率和入射光的頻率相同,這種散射被稱為瑞利散射,英國物理學家瑞利于1899年曾對其進行了詳細的研究。在散射光中,還有一部分散射光的頻率和入射光的頻率不同。印度科學家Raman在1928
藥物成分的拉曼分析
進行拉曼分析的儀器品類豐富,包括適合手持式、實驗室和教育用途的拉曼系統。 拉曼分析系統一般包括光譜儀、激光光源、操作軟件和采樣配件,客戶可以根據自身要求選擇模塊化組件進行配置,也可以選擇不同波長范圍和分辨率要求的拉曼光譜儀。前言對檢驗和表征而言,拉曼光譜具有多種優勢。它檢測速度快,對樣品
拉曼光譜圖怎么分析
拉曼光譜圖分析:是基于印度科學家C.V.拉曼(Raman)所發現的拉曼散射效應,對與入射光頻率不同的散射光譜進行分析以得到分子振動、轉動方面信息,并應用于分子結構研究的一種分析方法。拉曼光譜(Raman spectra),是一種散射光譜。拉曼光譜分析法是基于印度科學家C.V.拉曼(Raman)所發現
拉曼光譜的分析技術
幾種重要的拉曼光譜分析技術1、單道檢測的拉曼光譜分析技術2、以CCD為代表的多通道探測器的拉曼光譜分析技術3、采用傅立葉變換技術的FT-Raman光譜分析技術4、共振拉曼光譜分析技術5、表面增強拉曼效應分析技術拉曼光譜用于分析的優點和缺點 1、拉曼光譜用于分析的優點拉曼光譜的分析方法不需要對樣品進行
拉曼光譜圖怎么分析
拉曼光譜圖分析:是基于印度科學家C.V.拉曼(Raman)所發現的拉曼散射效應,對與入射光頻率不同的散射光譜進行分析以得到分子振動、轉動方面信息,并應用于分子結構研究的一種分析方法。拉曼光譜(Raman spectra),是一種散射光譜。拉曼光譜分析法是基于印度科學家C.V.拉曼(Raman)所發現
拉曼光譜圖怎么分析
拉曼光譜圖分析:是基于印度科學家C.V.拉曼(Raman)所發現的拉曼散射效應,對與入射光頻率不同的散射光譜進行分析以得到分子振動、轉動方面信息,并應用于分子結構研究的一種分析方法。拉曼光譜(Raman spectra),是一種散射光譜。拉曼光譜分析法是基于印度科學家C.V.拉曼(Raman)所發現
基于拉曼組的單細胞快檢技術可同時定量檢測
通過光合作用固定的二氧化碳與太陽能在生物體內有三種主要的存儲形式:多糖、油脂和蛋白質,共同構成了生物碳存儲與生物能源產業的物質基礎。目前,對細胞中這三類高含能儲碳分子的識別、表征和定量極為繁瑣,通常難以在單個細胞精度測量,這限制了光合固碳細胞工廠的篩選與改造效率。中國科學院青島生物能源與過程研究
拉曼介導靶向單細胞基因組原創技術研發成功
? 單細胞精度的海洋微生物組功能靶向性拉曼分選與測序技術(scRACS-Seq)? 劉陽供圖 海洋是地球上最大的活躍碳庫,海洋微生物在全球碳循環中起著至關重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚難以培養、原位代謝功能難以測量等技術瓶頸,業界對于海洋微生物光合固碳的原位功能機制等重要
拉曼介導靶向單細胞基因組原創技術研發成功
? 單細胞精度的海洋微生物組功能靶向性拉曼分選與測序技術(scRACS-Seq)? 劉陽供圖 海洋是地球上最大的活躍碳庫,海洋微生物在全球碳循環中起著至關重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚難以培養、原位代謝功能難以測量等技術瓶頸,業界對于海洋微生物光合固碳的原位功能機制等重要問題,仍然存在爭議
單細胞拉曼結合靶向宏基因組揭示土壤活性抗生素耐藥組
抗生素耐藥性(AMR)在人類、環境和動植物間的傳播,加劇全球“One Health”的負擔。土壤是“One Health”的關鍵環節之一,所攜帶的抗生素耐藥性可通過食物鏈等方式轉移至人類而帶來健康威脅。土壤中棲息著地球上最豐富多樣的微生物,其中活性耐藥菌在驅動土壤耐藥性傳播中具有關鍵作用。然而,
“拉曼光譜在藥學方面的應用”網絡講座已開始
賽默飛世爾科技“拉曼光譜在藥學方面的應用”網絡講座已經開始,點擊下面的鏈接即可參加: ? http://www.antpedia.com:81/ant_video/thermo/thermo6/raman-spectra-drugs.html 然后輸入您的用戶名、郵
紫外拉曼與共振拉曼原理
熒光干擾問題和靈敏度較低嚴重阻礙了常規拉曼光譜的廣泛應用。但近年來發展起來的紫外拉曼光譜技術有效地解決了上述問題。紫外拉曼光譜技術的出現和發展大大地擴展了拉曼光譜的應用范圍。右圖是紫外拉曼光譜避開熒光干擾的原理圖。熒光往往出現在300nm-700nm區域,或者更長波長區域。而在紫外區的某個波 紫外
紫外拉曼與共振拉曼原理
熒光干擾問題和靈敏度較低嚴重阻礙了常規拉曼光譜的廣泛應用。但近年來發展起來的紫外拉曼光譜技術有效地解決了上述問題。紫外拉曼光譜技術的出現和發展大大地擴展了拉曼光譜的應用范圍。右圖是紫外拉曼光譜避開熒光干擾的原理圖。熒光往往出現在300nm-700nm區域,或者更長波長區域。而在紫外區的某個波
紫外拉曼與共振拉曼原理
熒光干擾問題和靈敏度較低嚴重阻礙了常規拉曼光譜的廣泛應用。但近年來發展起來的紫外拉曼光譜技術有效地解決了上述問題。紫外拉曼光譜技術的出現和發展大大地擴展了拉曼光譜的應用范圍。右圖是紫外拉曼光譜避開熒光干擾的原理圖。熒光往往出現在300nm-700nm區域,或者更長波長區域。而在紫外區
拉曼光譜的分析與應用
拉曼光譜儀原理是當一束頻率為v0的單色光照射到樣品上后,分子可以使入射光發生散射。大部分光只是改變光的傳播方向,從而發生散射,而穿過分子的透射光的頻率,仍與入射光的頻率相同。在拉曼散射中,散射光頻率相對入射光頻率減少的,稱之為斯托克斯散射,因此相反的情況,頻率增加的散射,稱為反斯托克斯散射,斯托克斯