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  • 全新一代測序技術:沒有光的測序

    至今,新一代測序技術已經遍布全球上百個基因組測序中心 ――明斯特大學Dag Harmsen 在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過50人的生命(德國范圍內),在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。 Harmsen教授在這場疫情中發揮了重要的作用――他們通過將引發此次疫情的O104:H4型腸出血性大腸桿菌與2001年采集自一名溶血性尿毒癥(HUS)體內的O104:H4型腸出血性大腸桿菌進行基因對比后,發現,兩種菌株并非同源,引起此次德國EHEC暴發的O104:H4菌株來自一種腸聚集性大腸桿菌EAEC O104:H4 55989菌株的變異,其中還摻雜了一種目前未知的由志賀毒素產生的O104:H4菌株。 在這一場“戰役”中,Harmsen教授主要采用......閱讀全文

    測序新技術速覽

    454技術 樣品制備? 將基因組打成較短的DNA片段,再將片段與接頭相連,以便使其更容易與磁珠結合在一起(一個DNA片段結合于一個磁珠)。將PCR產物包被于“油包水”的乳化劑中,每一滴乳化劑內除PCR產物外,還含有一個結合了一個DNA片段的磁珠,這樣,PCR擴增過程就可以在每一滴乳化劑內獨立進行,而

    無需建庫,直接測序的測序新技術

      來自英國老牌測序研究機構Sanger研究院,以及英國劍橋巴布拉漢研究所的研究人員發表了題為“Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation”的文章,首

    新技術可快速檢測大腸桿菌

      華威大學生命科學學院的研究人員發現了一種新技術,可以在幾分鐘內檢測細菌的存在。在這項研究中,華威大學的科學家發現健康細菌和受到抗生素或紫外線殺傷的細菌表現出完全不同的電反應。這些發現發表在《PNAS》雜志上。  目前測試臨床樣品或商業產品中的細菌污染情況通常需要數天的時間。在此期間,如果不能通過

    全新一代測序技術:沒有光的測序

      至今,新一代測序技術已經遍布全球上百個基因組測序中心   ――明斯特大學Dag Harmsen   在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過

    Nature-methods發布單細胞測序新技術

      來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術,可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。   資深作者Ri

    Nature新技術:CRISPR+單細胞測序=?

    CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因(pooled CRISPR screens),可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因,同時編輯許多細胞,然后實驗篩選編輯細胞,gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物

    微生物控制的新技術

     食品工業界在繼續發展現有控制微生物控制方法的同時,正研究新技術以保證食品的微生物安全,同時也為消費者提供稍需加工或不需加工的高質量食品。這些年,輻照、高強度電子場、脈沖光、紫外線、高壓加工和臭氧已作為消滅微生物的非加熱方法。然而,在商業上運用這些技術僅在最近幾年。盡管這些新技術以及其它方法看起來能

    微生物新技術有哪些

    目前,微生物污染造成的食源性疾病仍是世界食品安全中最突出的問題。加工食品所含菌的種類、數量,常隨原料的生產環境及細菌學質量、工廠環境與操作人員的衛生及處理狀況、制品貯運狀況等而異。由于食品微生物污染的廣泛發生,嚴重影響人民的健康,因此食品微生物檢驗工作對評價食品衛生質量,保證消費者飲食衛生有著極為重

    食品微生物檢驗新技術

      摘要:食品安全是全球面臨的難題和巨大挑戰,不僅影響著人們的健康與生活,還關系著社會的穩定。本文初步介紹了幾種食品檢測中微生物檢驗的新技術,希望為從事食品檢驗工作的人員提供幫助。?  《中華人民共和國食品安全法》中定義食品安全是指食品無毒、無害,符合應當有的營養要求,對人體健康不造成任何急性、亞急

    掌上測序儀新玩法:空氣微生物實時測

    近日,英國基因組分析中心(TGAC)的研究團隊分享了利用MinION掌上測序儀,進行創造性研究。作為MinION首批試用者,TGAC摒棄以往需要把樣本帶回實驗室的做法,使用了微型測序設備對環境中成百上千種不同生物樣本進行現場物研究,以便研究人員能夠對實驗基因數據進行實時分析。   該研究的目標是

    全新測序技術利弊比較之單分子測序

      在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過50人的生命(德國范圍內),在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。   Harmsen教授在這場疫情

    北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術

      來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法,這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異,提高單細胞全轉錄組分析的準

    Nature子刊:癌癥單細胞測序新技術

      只有通過近距離觀看修拉(Seurat)的繪畫,你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點,從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似,生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜,然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。   發布在7月22日《自然生物技術》(

    同濟大學發布單細胞測序新技術

      單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而,在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。這是因為細胞之間存在較大的差異,又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組。  加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授領導團隊解決了這個問題。他們在五月五日的Geno

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    DNA測序儀:454測序儀

    454測序儀的出現極大促進了測序業務的開展,科研人員已經將測序技術作為解決科研工作中許多常見 問題的利器。這是因為454測序儀在以下幾個方面取得了質的突破:首先是解決了高通量測序問題;其次它簡 化了樣品準備步驟,將以往轉化大腸桿菌擴增質粒的繁瑣過程全部用簡單的體外PCR擴增法替代了;最后, 它縮小了

    謝曉亮院士Science單細胞測序新技術

      人類、草莓、蜜蜂、雞和大鼠等許多生物體都已經進行過DNA測序。如果說測序個別物種具有挑戰性,那么測序單個細胞的DNA無疑更難。   為了獲得足夠的DNA進行測序,通常需要數以千計或甚至數以百萬計的細胞。而找出哪種突變存在于哪種細胞中幾乎是不可能的,只存在于少數細胞(如早期癌細胞)中的突變也基本

    基因測序新貴在ZL訴訟期間發布新技術

    面對啟迪公司的訴訟,牛津納米孔技術公司表示,這種名為CsgG的微小孔隙是其新設備的基礎。  首創了一種名為納米孔測序的新DNA分析技術的英國牛津納米孔技術公司,對其產品的核心部分一直守口如瓶。不過,緊隨一項來自測序行業巨頭——啟迪公司的專利侵權訴訟,該公司揭示了驅動其最新設備的東

    基因測序新貴在ZL訴訟期間發布新技術

      首創了一種名為納米孔測序的新DNA分析技術的英國牛津納米孔技術公司,對其產品的核心部分一直守口如瓶。不過,緊隨一項來自測序行業巨頭——啟迪公司的專利侵權訴訟,該公司揭示了驅動其最新設備的東西,即一種看上去巧妙避開了啟迪公司挑戰的細菌孔。  同此前方法相比,納米孔測序在分析DNA方面更加便捷和廉價

    PNAS:新技術實現納米孔內快速測序DNA

      據《每日科學》近日報道,由美國華盛頓大學物理學家領導的研究小組設計了一種新技術,可在納米孔內對DNA進行快速測序,而且價格比較便宜。新方法可為癌癥、糖尿病或某些成癮患者量身繪制個性化基因測序藍圖,提供更加高效的個體醫療。相關論文發表于美國《國家科學院院刊》(PNAS)。  論文主要作者

    美用新技術完成炭疽基因組測序

      美國喬治亞理工學院科學家使用一種稱為RNA測序的新技術,描繪出了炭疽芽孢桿菌的基因表達。公布在最新一期《細菌學》雜志網絡版上的此項研究成果,標志著任何細菌轉錄(細菌表達不同基因時產生的完整信使RNA集合)自此可被全面定義,并為研究細菌如何調控基因表達提供了更多細節。   喬治亞理工學院光電系統

    新技術解讀微生物間的“談話”

    美國加州大學圣迭戈分校團隊開發了一種新的搜索工具,利用由全球研究人員整理的超過6萬種微生物的數據庫,可立即將微生物與其產生的代謝物進行匹配,從而幫助人們更好地了解微生物的新陳代謝。相關論文5日發表在《自然·微生物學》上。這項技術使研究人員能夠在沒有任何先驗知識的情況下,將微生物與它們產生的新陳代謝特

    新技術解讀微生物間的“談話”

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517287.shtm

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      美國加州大學圣迭戈分校團隊開發了一種新的搜索工具,利用由全球研究人員整理的超過6萬種微生物的數據庫,可立即將微生物與其產生的代謝物進行匹配,從而幫助人們更好地了解微生物的新陳代謝。相關論文5日發表在《自然·微生物學》上。  這項技術使研究人員能夠在沒有任何先驗知識的情況下,將微生物與它們產生的新

    微生物實驗大腸桿菌能水解淀粉嗎

    不能,淀粉水解實驗,大腸桿菌沒有圈,枯草芽孢桿菌有透明圈,基本說明大腸桿菌不水解淀粉。

    重感冒病人患上帕金森氏癥的風險是健康人的兩倍

      在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過50人的生命(德國范圍內),在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。   Harmsen 教授在這

    華大智造DNBSEQE5基因測序儀--4.5小時完成病原微生物測序

      7月15-16日,第二屆感染性疾病診斷技術創新論壇(IDD)在武漢召開,華大智造攜病原微生物高通量測序平臺亮相。在論壇上,華大智造官方首次發布了DNBSEQ-E5基因測序儀在科研和實戰場景下的一系列使用數據。據悉,DNBSEQ-E5基因測序儀體積小、重量輕、測序速度快、操作簡單,大大降低了基因測

    DNA測序儀pcr測序反應

      pcr測序反應  (1) 取0.2ml的pcr管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,按下表加試劑:  所加試劑 測定模板管 標準對照管  bigdye mix 1μl 1μl  待測的質粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 雙鏈dna - 1μl  待測dna的正向引物 1μl -  

    業界對DNA測序公司新技術褒貶不一

      美國佛羅里達州馬可島被奉為基因測序領域的圣地,每年都有大批研究基因測序的公司及科研人員會聚于此,分享最新科技成果。兩年前,英國牛津納米孔技術公司曾宣布,該公司已成功研發出對特定DNA片段進行測序的新技術,但很多人認為該方法并不現實。與其他技術相比,這一技術可以閱讀更長的DNA片段(因此有望用于對

    Nature子刊:新技術攻克單分子測序大問題

      來自冷泉港實驗室(CSHL)的一位定量生物學家及同事們開發出了一種混合錯誤校正新方法攻克了單分子測序的重大問題,可將長讀(long reads)的準確度提高到99.9%。這一研究成果發布在7月1日的《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上。   領導這一研究的是冷

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