中科院PNAS發表測序新成果
來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所、深圳湖大基因研究所、美國伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校和美國普渡大學的研究人員聯合發表了題為 “Insights into salt tolerance from the genome of Thellungiella salsuginea”的論文，解析了鹽芥基因組序列及其耐鹽機制。相關成果發表在《美國科學院院刊》(PNAS)上 來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所植物基因組學國家重點實驗室的謝旗研究員、王秀杰研究員、陳受宜研究員、儲成才研究員和深圳華大基因基因研究院王俊研究員、美國伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校的Han Bohnert教授以及美國普渡大學朱健康教授為該篇論文的共同通訊作者。王秀杰課題組的吳華君博士和謝旗課題組的張鐘徽博士等七位研究人員為該論文的共同第一作者。 對高等植物非生物脅迫應答的分子機制的研究具有重要的意義.擬南芥是一種典型的甜土植物,它在耐鹽......閱讀全文
中國農業科學院Cell子刊發布番茄研究重要成果
來自中國農業科學院、中科院遺傳與發育生物學研究所的研究人員，通過繪制番茄果實發育過程中全基因組脫氧核糖核酸酶I(DNase I)超敏位點圖譜，鑒別出了一些調控DNA元件。這一重要的研究成果發布在5月29日的《Molecular Plant》雜志上。 中國農業科學院的崔霞（Xia Cui）研究員
遺傳發育所等發現植物重復基因對的進化規律和機制
全基因組重復事件是生物界中的一個普遍現象，目前在很多物種中都有報道。重復基因對的功能分化是植物產生新基因的來源，為植物基因組進化注入新的動力，但是目前重復基因對的進化規律和機制并不是十分清晰。 為了研究重復基因對的進化機制，中國科學院遺傳與發育生物學研究所田志喜課題組與美國普渡大學教授馬漸新以
全基因組研究解碼口吃根源
口吃跨越不同語言和血統，影響著全球約7000萬人。過去，許多人認為口吃能夠通過自主控制來改善。但數十年來的研究表明，口吃實際上是一種高度遺傳的不可控疾病，其原因復雜且模糊。而一項7月28日發表于《自然-遺傳學》上的研究讓口吃的部分原因變得清晰。 研究人員利用基因檢測服務公司23andMe的龐大
多國實施全基因組分析計劃
由于基因測序可以探查與特定疾病相關的基因，該療法正在成為日益受歡迎的診斷方法。 英國計劃到2017年對10萬人進行基因組測序。 美國加州一對龍鳳胎出生后，他們的父母非常憂慮：兩個嬰兒不僅發育緩慢，而且肌肉松軟無力。大腦掃描結果顯示，男嬰或存在大腦性麻痹；然而醫生對造成女嬰震顫和癲癇的原因卻不
昆蟲全基因組DNA的提取
實驗概要利用改進的CTAB 法提取昆蟲全基因組DNA。主要試劑1. 蛋白酶K[美國Merck公司]2. 三羥甲基氨基甲烷(Tris)[美國Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 瓊脂糖及溴化乙錠(EB)[美國Amresco公司生產]5. 乙二胺四乙酸鈉(Na2ED
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
全血基因組提取操作步驟
操作步驟（（２００ul全血））* 第一次使用前請先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水乙醇! 1. 取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液，放入1.5ml離心管。對如果全血起始量小于200μl，則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間，則后續操作需要按照比例增
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
擬南芥的轉化
實驗概要本實驗采用花浸泡法利用農桿菌介導將目的基因轉入擬南芥。主要試劑YEB液體培養基，LB培養基，0.1 M CaCl2，0.05 M MgSO4，花浸泡緩沖液(0.5XMS，5%蔗糖，0. 03%Silwet L-77 )，Rif，Kan主要設備搖床，離心機，培養缽，溫室，托盤，塑料薄膜實驗材料
擬南芥的培養
實驗概要本實驗方法就擬南芥的培養技術進行了簡單介紹。主要試劑1. PNS營養液:每升含2.5m1 1M磷酸緩沖液(pH5.5)5ml 1M KN03，2m1 1M MgSO4.7H20，2m1 1M Ca(N03)a.4H20，2.5m1 20mM? Fe.EDTA，1 ml MS微量兀素。2. 人
中學生走進中國科學院植物研究所
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512900.shtm
《中國科學院研究所綜合管理條例》頒布
本報北京3月24日訊(記者祝魏瑋)今天，中國科學院正式頒布了《中國科學院研究所綜合管理條例》(以下簡稱《條例》)，這是繼2006年中科院頒布《中國科學院章程》后的又一重要基本制度。 據了解，《條例》共14章85條，包括總則、所長負責制、黨的委員會、學術委員會、職工代表大會、戰略研究與規劃、科研活動
中國科學院工業人工智能研究所成立
11月26日上午，中國科學院工業人工智能研究所成立大會在江蘇省南京市舉行。中國科學院院長、黨組書記侯建國，江蘇省委書記、省人大常委會主任信長星出席會議并講話。江蘇省委副書記、省長劉小濤主持會議。中國科學院副院長、黨組成員汪克強，江蘇省和南京市領導周紅波、儲永宏、趙巖、李忠軍出席會議。 侯建國對
中國科學院工業人工智能研究所成立
11月26日上午，中國科學院工業人工智能研究所成立大會在江蘇省南京市舉行。中國科學院院長、黨組書記侯建國，江蘇省委書記、省人大常委會主任信長星出席會議并講話。江蘇省委副書記、省長劉小濤主持會議。中國科學院副院長、黨組成員汪克強，江蘇省和南京市領導周紅波、儲永宏、趙巖、李忠軍出席會議。侯建國對江蘇省、
頂級實驗室《Nature》發布表觀基因組學圖譜
基因組中表觀遺傳變化是能遺傳的，近期來自Salk生物學研究所等處的一組研究人員完成了一項野生植物表觀基因組學全范圍內的研究分析，從中發現了這種修飾與遺傳信息相互作用的共同模式。這一成果公布在3月7日Nature雜志在線版上。 文章通訊作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
研究揭示擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
Cell新文章：癌癥全基因組測序
根據華盛頓大學醫學院的一項新研究，具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。 論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說：“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明，白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
我國率先完成棗樹全基因組測序
在科技部“十一五”和“十二五”科技支撐計劃項目的持續資助下，河北農業大學劉孟軍教授研究團隊在世界上率先完成了棗樹的高質量全基因組測序，組裝出總長4.38億個堿基的棗基因組序列，達估測基因組的98.6%，使棗樹成為世界鼠李科植物（近千種）和我國干果樹種中第一個完成基因組測序的物種。 相關論文
單細胞的可靠全基因組擴增
目前多種新型分析技術，如新一代測序和芯片，都是為細胞群體而設計的，需要一定的樣本量。對于一些臨床或法醫樣本，如腫瘤細胞或循環胎兒細胞等，它們的細胞數量有限，直接限制了其下游應用。例如，在分析腫瘤細胞中的體細胞DNA突變或單個細菌基因組時，單細胞中的DNA無法滿足測序的mg級樣品量需求。為了從少量樣品
“863”腫瘤全基因組研究獲進展
7月14日，“十一五”國家“863”重大專項“食管癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”和“肺癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”成果匯報會在京召開。 日前，遺傳學權威期刊《自然—遺傳學》刊登了我國科學家食道癌和肺癌研究的重要進展。由中國醫學科學院腫瘤研究所分子腫瘤學國家重點實驗室教授林東昕
中國種茶樹全基因組密碼破解
記者從安徽農業大學獲悉，該校茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室宛曉春教授研究團隊，聯合深圳華大基因等單位，破解了世界上分布最廣的中國種茶樹的全基因組信息，成果日前在線發表于《美國科學院院刊》上。 世界主栽茶樹分屬兩個變種：即中國種和阿薩姆種，前者葉小，分布廣泛，適制綠茶等六大茶類；后者葉大，主
我國率先完成菊花全基因組測序
中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心對外發布消息稱，由他們共同發起的科研團隊，在菊花全基因組計劃獲重大進展的同時，還完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。此舉使我國成為世界上首次完成菊屬植物菊花全基因組測序的國家。 據了解，菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到
簡述全基因組測序的技術路線
全基因組測序的技術路線：提取基因組DNA，然后隨機打斷，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接頭, 進行DNA簇（Cluster）制備，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法對插入片段進行測序。然后對測得的序列組裝成Contig，通
關于全基因組測序的應用介紹
全基因組測序的應用：通過生物信息手段，分析不同個體基因組間的結構差異，同時完成SNP及基因組結構注釋。 DNA突變可誘發癌癥。吸煙過程中所釋放的>60種致癌化學物質可與DNA結合并對DNA鏈上的鳥嘌呤和腺嘌呤進行化學修飾從而產生大的加合物，該加合物改變了DNA雙螺旋的結構，如果不被核苷酸剪切修復
中國樹鼩全基因組解析完成
中科院昆明動物研究所張云研究員課題組與深圳華大基因研究院合作，解析了新型實驗動物中國樹鼩的全基因組，系統評估了樹鼩作為藥物研發實驗動物的特征和優勢。研究近日發表于《公共科學圖書館·綜合》。 研究不僅為中國樹鼩用于新藥研發的藥效學、藥理學和毒理學評價提供了系統的基礎信息數據和科學依據，而且揭示了
小須鯨全基因組圖譜獲破譯
11月25日，韓國海洋科學技術研究所、深圳華大基因研究院等宣布成功破譯了小須鯨全基因組圖譜，并對鯨類獨特生理習性的遺傳學機制進行了分析。相關成果在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 人們一直癡迷于海洋生物是如何演化為陸生生物的。鯨類的進化卻反其道而行之，由陸生向水生演化，和陸生偶蹄動物如牛、豬等
關于全基因組測序的內容介紹
1998年，克萊格·凡特的塞雷拉基因組公司成立，而且宣布將在2001年完成測序工作。隨后國際團隊也將完成工作的期限提前。2000年6月26日，塞雷拉公司的代表凡特，以及國際合作團隊的代表弗朗西斯·柯林斯（Francis Collins），在美國總統柯林頓的陪同下發表演說，宣布人類基因組的概要已經
研究發現全新全基因組組裝方法
十年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 英國時間12月9日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 這篇論文只有兩位作者，
昆明植物所建立全新植物基因鏈接與克隆系統
隨著高通量測序技術的普及與基因組信息爆炸式的增長，解析基因與基因組孕藏的功能信息成為我們了解生命密碼的必需步驟。功能基因研究是破解基因組信息這部天書的重要手段之一，而功能基因的研究離不開載體的構建與轉基因方法。傳統的載體構建耗時耗力，伴隨著煩瑣的酶切與連接手段，成功地構建一個用于植物轉化的載體往