液體核磁與小角度X射線散射刻畫CTCF多點識別DNA動態特性
中國科學技術大學生命科學學院施蘊渝院士/吳季輝教授團隊的阮科副教授和張志勇教授利用液態核磁共振結合小角度X射線散射等技術,在對人源多功能轉錄因子CTCF的結構與功能研究中取得重要進展。相關成果以“Dynamic Nature of CTCF Tandem 11 Zinc Fingers in Multivalent Recognition of DNA As Revealed by NMR Spectroscopy”為題在線發表在The Journal of Physical chemistry Letters上。 多功能轉錄因子CTCF含有11個串聯鋅指,在基因表達過程中起著關鍵性的作用。它在基因組中有著多種結合位點;通過與這些不同的結合位點結合,CTCF可以使得線性的染色質成環,形成拓撲結構,并在此基礎上進一步架構為染色質的三維空間構象。 雖然CTCF的11個串聯鋅指的可塑性是其識別基因組中多個位點的必要因素,但這1......閱讀全文
CTCF:-First-Multivalent-Nuclear-Factor
CTCF is central to signaling pathways in immature B cells elicited by cross-linking the Ig BCR and stimulation with TGF?. Both stimuli result in induc
核受體信號通路相關因子CTCF
該基因屬于boris+ctcf基因家族,編碼一個具有11個高度保守的鋅指結構域的轉錄調節蛋白。這種核蛋白能夠利用zf結構域的不同組合來結合不同的dna靶序列和蛋白質。根據所述位點的上下文,所述蛋白質可結合包含組蛋白乙酰轉移酶(hat)的復合物并作為轉錄激活劑發揮作用,或結合包含組蛋白脫乙酰基酶(hd
CTCF基因編碼功能及結構描述
該基因屬于boris+ctcf基因家族,編碼一個具有11個高度保守的鋅指結構域的轉錄調節蛋白。這種核蛋白能夠利用zf結構域的不同組合來結合不同的dna靶序列和蛋白質。根據所述位點的上下文,所述蛋白質可結合包含組蛋白乙酰轉移酶(hat)的復合物并作為轉錄激活劑發揮作用,或結合包含組蛋白脫乙酰基酶(hd
CTCF的結構特點和生理作用
該基因屬于boris+ctcf基因家族,編碼一個具有11個高度保守的鋅指結構域的轉錄調節蛋白。這種核蛋白能夠利用zf結構域的不同組合來結合不同的dna靶序列和蛋白質。根據所述位點的上下文,所述蛋白質可結合包含組蛋白乙酰轉移酶(hat)的復合物并作為轉錄激活劑發揮作用,或結合包含組蛋白脫乙酰基酶(hd
CTCF基因突變與藥物因子介紹
該基因屬于boris+ctcf基因家族,編碼一個具有11個高度保守的鋅指結構域的轉錄調節蛋白。這種核蛋白能夠利用zf結構域的不同組合來結合不同的dna靶序列和蛋白質。根據所述位點的上下文,所述蛋白質可結合包含組蛋白乙酰轉移酶(hat)的復合物并作為轉錄激活劑發揮作用,或結合包含組蛋白脫乙酰基酶(hd
核受體信號通路CTCF基因的臨床解釋
該基因屬于boris+ctcf基因家族,編碼一個具有11個高度保守的鋅指結構域的轉錄調節蛋白。這種核蛋白能夠利用zf結構域的不同組合來結合不同的dna靶序列和蛋白質。根據所述位點的上下文,所述蛋白質可結合包含組蛋白乙酰轉移酶(hat)的復合物并作為轉錄激活劑發揮作用,或結合包含組蛋白脫乙酰基酶(hd
我國學者應用液體核磁刻畫CTCF多點識別DNA的動態特性
穩態強磁場實驗裝置(SHMFF)用戶中科大生命科學學院施蘊渝院士/吳季輝教授團隊的阮科副教授和張志勇教授利用液態核磁共振結合小角度X射線散射等技術,在對人源多功能轉錄因子CTCF的結構與功能研究中取得重要進展。相關成果在線發表在《物理化學快報雜志》上。CTCT與DNA相互作用示意圖 多功能轉錄
液體核磁與小角度X射線散射刻畫CTCF多點識別DNA動態特性
中國科學技術大學生命科學學院施蘊渝院士/吳季輝教授團隊的阮科副教授和張志勇教授利用液態核磁共振結合小角度X射線散射等技術,在對人源多功能轉錄因子CTCF的結構與功能研究中取得重要進展。相關成果以“Dynamic Nature of CTCF Tandem 11 Zinc Fingers in M
染色質高級結構變化調控細胞凋亡的新機制
真核生物DNA通過纏繞組蛋白八聚體形成以核小體為重復單元的串珠結構,再通過形成遠距離的染色質環等高級結構而存儲于細胞核中。近年來研究表明染色質高級結構在維持基因表達和細胞命運決定等方面發揮重要作用,且染色質高級結構的形成和維持需要特定轉錄因子的介導。多功能轉錄因子CCCTC結合因子(簡稱:CTC
調控基因表達的“染色質環”新因子篩選獲進展
? 中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院、生物島實驗室研究員姚紅杰課題組通過系統性篩選在基因組上與CTCF共定位的轉錄因子,鑒定出大量與CTCF存在高共定位率的新轉錄因子,并選取了轉錄因子BHLHE40進行后續的功能驗證,發現BHLHE40可以調控CTCF在基因組上的結合,進而影響其介導的遠距離染色質
中科院發表Cell-Res文章:三維基因組組裝重要新機制
來自上海交通大學系統生物醫學研究院比較生物醫學中心,中科院北京生物物理所的研究人員發表了題為“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章,闡明了染色質架構蛋
染色質高級結構調控細胞命運機制研究中獲進展
真核生物基因組DNA纏繞在組蛋白八聚體上形成染色質,并在染色質架構蛋白的作用下逐級折疊形成遠距離的染色質相互作用(或染色質環)、拓撲相關結構域和染色質區室等染色質高級結構。遠距離染色質互作可以調控基因表達,在細胞命運決定過程中具有關鍵作用。CCCTC結合因子(簡稱CTCF)最早被認為是絕緣子結合蛋白
染色質架構蛋白CTCF結合人類基因組位點的機制研究取得..
近日,國際著名學術期刊《Cell Research》雜志在線發表了上海交通大學系統生物醫學研究院比較生物醫學中心吳強課題組和中科院北京生物物理所王艷麗課題組合作研究成果,“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diver
新研究揭示導致神經發育障礙的分子機制
7月1日,《自然-通訊》刊發了廣州國家實驗室研究員姚紅杰團隊與合作者最新成果。他們綜合運用小鼠模型和人源類器官模型,揭示了染色質架構蛋白CCCTC結合因子(簡稱CTCF)的精氨酸567突變為色氨酸(R567W)點突變通過調控CTCF在染色質上的結合和局部三維基因組結構,進而導致神經發育障礙的分子機制
廣州生物院在抑制宮頸癌細胞增殖機理方面取得新進展
CCCTC結合因子(下簡稱CTCF)是含有11個高度保守的鋅指結構蛋白,具有多種生物學功能,包括啟動子的激活與抑制、基因印記、基因沉默與絕緣、X染色體的失活等。已有研究發現,CTCF可以抑制c-Myc基因的表達,在細胞生長與增殖、系統發生以及腫瘤發生等方面都有著重要的作用。 最近,中科院廣
染色質高級結構調控多能干細胞誘導機制獲進展
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員姚紅杰課題組聯合美國加州大學圣地亞哥分校教授付向東課題組,運用體細胞重編程到誘導多能干細胞為模型結合多維組學技術并聯合生物信息分析,揭示了CCCTC結合因子(以下簡稱CTCF)介導的染色質絕緣和染色質結構變化協同調控干細胞多能性獲得的新機制。相關研究4月5日發
中科院JBC文章揭示轉錄調控新機制
來自中科院廣州生物醫藥與健康研究院、吉林大學等機構的研究人員證實,凝集蛋白復合體負向調控了基因組調控蛋白CTCF介導的核糖體RNA基因轉錄。這項工作發表在7月24日的《生物化學雜志》(JBC)上。 中科院廣州生物醫藥與健康研究院的姚紅杰(Hongjie Yao)是這篇論文的通訊作者。其主要
中國醫學科學院最新文章解析HOX基因表達模式
“核心刊物”迎來了新期刊:科學通報,中國科學C輯:生命科學,這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的,我國學術期刊中的知名品牌,被國內外各主要檢索系統收錄,如國內的《中國科學論文與引文數據庫》(CSTPCD)、《中國科學引文數據庫》(CSCD)等;美國的SCI、CA、EI,英
第二軍醫大學發表癌癥表觀遺傳學研究
近年來人們發現,γ-氨基丁酸(GABA)對腫瘤的發生和發展有調控作用。在腫瘤組織中,GABA及其合成酶GAD1(谷氨酸脫羧酶1)的表達水平顯著增加。不過,人們對這一現象背后的機制還知之甚少。 第二軍醫大學的研究團隊最近在Oncogene雜志上發表文章,揭示了癌細胞中DNA甲基化重新激活GAD1
Nature:人類早期胚胎發育過程中的染色體結構動態變化
染色體三維結構是重要的表觀遺傳因素,與基因的表達調控密切相關。研究染色體三維結構在人類精子及早期胚胎中的動態變化和調控分子對于深入理解人類胚胎發育有重要的理論和臨床意義。 人類個體發育從精卵結合形成受精卵開始,經歷早期胚胎發育過程,由一個細胞逐漸分裂分化形成一個含有上百種細胞類型、多種器官的
JEM:飲食干預改善2型糖尿病胰島β細胞功能損傷分子機制
營養過剩和運動缺乏引起的肥胖和2型糖尿病(T2D)已成為全球性公共衛生突出問題之一,嚴重危害人類健康的同時造成了巨大的社會負擔和經濟損失。然而最新的統計數據顯示,目前全球僅有不到一半的 T2D 患者接受治療,且其中超過半數患者的血糖控制不佳,最終引起多種并發癥。胰島β細胞功能損傷是 T2D 發生
研究發現影響血液干細胞中特殊基因表達的關鍵元件
基因轉錄通常會被啟動子和調節元件(比如增強子和沉默子)之間的染色質環來進行調節,不同的轉錄因子(TFs,transcription factors)能夠與這些調節元件結合,并以一種細胞類型特異性的方式來調節啟動子-增強子環。盡管其在控制基因表達方面發揮著重要作用,但轉錄因子如何促進啟動子-增強子
一般在共定位中用到免疫熒光,“共定位”是什么
共定位的定義:共定位是對樣品內兩種熒光標記的信號共同分布的位置進行分析。?共定位就如字面意思上所說的,只能夠表明蛋白A和B都在此細胞有表達,并且在同樣的細胞內位置/細胞器。相關短語:共定位通道?PDM Channel細胞共定位?Cellular co localization細胞內共定位信息?cel
免疫熒光共標記怎么計算共標記的細胞個數
共定位的定義:共定位是對樣品內兩種熒光標記的信號共同分布的位置進行分析。 共定位就如字面意思上所說的,只能夠表明蛋白A和B都在此細胞有表達,并且在同樣的細胞內位置/細胞器。相關短語:共定位通道 PDM Channel 細胞共定位 Cellular co localization 細胞內共定位信息 c
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共定位(免疫熒光)是什么
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共定位(免疫熒光)是什么
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共定位中用到免疫熒光,“共定位”是什么
共定位的定義:共定位是對樣品內兩種熒光標記的信號共同分布的位置進行分析。?共定位就如字面意思上所說的,只能夠表明蛋白A和B都在此細胞有表達,并且在同樣的細胞內位置/細胞器。相關短語:共定位通道?PDM Channel細胞共定位?Cellular co localization細胞內共定位信息?cel
首次揭示人類早期胚胎中的染色體三維結構的動態變化
《自然》雜志刊發了中國科學院北京基因組研究所研究員劉江團隊與中國科學院院士、山東大學附屬生殖醫院教授陳子江團隊合作研究成果。 該研究首次揭示了人類早期胚胎中的染色體三維結構的動態變化,并發現CTCF蛋白對于早期胚胎發育中拓撲相關結構域(TAD結構)有著重要的調控功能,為進一步揭示人類胚胎發育機
熱帶爪蟾表明染色質重塑對從頭-TAD-建立有重要影響
動物間期染色體被組織成拓撲關聯域 (TAD)。尚未完全了解 TAD 的形成方式。 2021年6月7日,南方科技大學侯春暉,陳永龍,華中農業大學李立及澳門大學張仲榮共同通訊在Nature Genetics 在線發表題為“Three-dimensional folding dynamics of