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  • 發布時間:2019-04-08 16:07 原文鏈接: Cell發布神秘的exRNA第一份詳細指引地圖

      exRNA(extracellular RNA),也就是細胞外RNA。一般認為RNA僅存在于細胞內,近年來的研究表明這種分子也存在于細胞外,科學家們在血漿或血清樣本中檢測到了疾病相關的exRNA,希望exRNA能成為非侵入性的生物標志物,但是這種分子也參與細胞-細胞通訊系統。

      為了更好的了解這一方面的進展,美國NIH細胞外RNA通訊研究協會創建了exRNA Atlas資源,并發布了人體循環系統中exRNA的第一份詳細目錄。他們還開發了可訪問的計算工具,其他研究人員可以使用他們的數據中分析exRNA。

      這一研究成果公布在Cell雜志上,這提供了第一份“地圖”,能幫助科學家更好的研究exRNA在健康和疾病中的潛在作用。

      “大約10年前,科學家們開始發現由exRNA介導的細胞之間的新通訊系統,這一系統似乎在正常生理條件下,還有癌癥等疾病中都能發揮作用”,文章作者之一,貝勒醫學院計算與綜合生物醫學研究中心聯合主任Aleksandar Milosavljevic博士說。

      Milosavljevic實驗室與其他實驗室合作,分析了19項研究中的人類exRNA。他們很快發現這一系統比最初假設的要復雜得多。

      由于這一意外的復雜性,現有的實驗室方法不能可重復地分離exRNA及其載體。因此Milosavljevic等人采用了計算工具對復雜的實驗數據進行反卷積(deconvolution)。反卷積是指將復雜信息分離為易于解釋的組件的數學方法和計算算法。

      “使用反卷積,我們發現了六種主要類型exRNA及其載體,它們在體液中可以被檢測到,包括血清,血漿,腦脊髓液,唾液和尿液,”共同一作,Oscar D. Murillo說,“載體的作用類似于分子血管將RNA載體移動到全身。它們包括脂蛋白(HDL,也就是所謂的“好膽固醇”),各種含有小蛋白質的顆粒和小囊泡的小蛋白。”

      研究人員發現,由于生物系統的自然復雜變化,計算方法有助于揭示以前在個別研究中無法檢測到的生物信號。例如,在運動研究中,他們的計算方法揭示了運動前后HDL顆粒和人血漿中囊泡中exRNA-運載“貨物”比例的差異。

      “運動增加了參與調節代謝和肌肉功能的RNA分子的比例,表明機體對運動的適應性反應,”Milosavljevic說,“這一發現指出了這樣一種可能性:在健康或疾病的條件下,計算方法可能會識別出具有生理和臨床相關性的信號。”

      為了幫助世界各地的研究人員進行分析,研究人員在網上提供了計算工具(https:/ / exrna-atlas.org)。

      “我們預計它將結合科學知識,實驗技術來分離體液中的exRNA和載體,并通過先進的計算方法來反卷積和解釋exRNA通訊系統的復雜性,”Murillo說。


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