尿素循環是哺乳動物的主要代謝途徑,精氨酸琥珀酸合成酶ASS1將天冬氨酸和瓜氨酸結合形成精氨琥珀酸,后者被精氨酸裂解酶ASL分解形成鳥氨酸和尿素。ASS1還與ASL在細胞質中參與精氨酸-瓜氨酸循環,以供應細胞所需的精氨酸及其下游代謝物和富馬酸。此前的研究發現,ASS1在許多癌癥類型中被沉默,其表達降低影響了嘧啶核苷酸的平衡,進而促進了癌癥增殖。此外,有研究發現,ASS1的啟動子區域內存在p53結合位點,在X射線或阿霉素(DOX)誘導DNA損傷后,p53誘導ASS1基因表達上調。上述現象表明,ASS1與p53介導的DNA損傷之間存在聯系。
近日,以色利魏茨曼科學研究所的Ayelet Erez團隊在Nature Metabolism發表了題為ASS1 metabolically contributes to the nuclear and cytosolic p53-mediated DNA damage response的研究性論文,揭示了ASS1在DNA損傷中的關鍵作用。
為探究ASS1在p53介導的DNA損傷反應中的潛在作用,研究人員在攜帶野生型p53的結腸癌細胞中使用多柔比星(Dox)誘導DNA損傷。結果顯示,Dox處理后,ASS1表達顯著增加,與p53蛋白上調相一致。ASS1上調降低了DNA損傷后的天冬氨酸水平,阻礙了核苷酸的合成并暫停了細胞周期進程。
為了進一步表征ASS1的細胞效應,研究人員在Dox處理后進行了ASS1免疫熒光染色。結果顯示,盡管ASS1是一個已知的細胞質酶,但在未經處理的結腸癌細胞中觀察到了ASS1的核表達,并且其表達在Dox處理后顯著增加。通過對結腸癌細胞進行細胞質和核部分分離,研究人員證實了Dox處理后ASS1和p53在核中的積累。接著,研究人員通過質譜鑒定到了ASS1與入核蛋白IPO7存在相互作用。免疫沉淀和鄰位連接測定發現,DNA損傷增強了ASS1和IPO7之間的相互作用,促進了ASS1在細胞核中的存在。
鑒于ASS1產生精氨酸和富馬酸鹽需有ASL參與,研究人員對ASL的細胞核表達進行了探索,結腸癌細胞中ASL的核和胞質水平在Dox誘導的DNA損傷后增加,ASS1-ASL介導的細胞核內富馬酸生成增加了DNA損傷后的存活率。
為了進一步破譯ASS1在細胞核中的作用,我們對結腸癌細胞中的核部分進行了沉淀-質譜分析,發現了ASS1與幾種與染色質重塑相關的蛋白質的相互作用。其中,與染色質亞家族C成員1(SMARCC1)的相互作用在Dox處理后增加,并隨著ASS1丟失而減少。SMARCC1通過琥珀化調節染色質的可及性,而琥珀化是一種依賴于富馬酸鹽的翻譯后修飾。在沒有ASS1的細胞中進行Dox處理會導致SMARCC1琥珀化和SMARCC1蛋白水平降低,表明核ASS1是DNA損傷后的核蛋白琥珀化所必需的,特別是SMARCC1琥珀化。
RNA測序分析表明,ASS1缺失后,許多基因的轉錄增加,尤其是與p53和細胞周期調控相關的基因。ATAC測序分析表明,這些p53相關DNA損傷反應基因的啟動子可及性在ASS1敲除細胞中受到的影響較小,表明ASS1對于限制幾種p53調控基因的轉錄是必需的。
圖:ASS1在p53介導的DNA損傷反應中的作用
總之,上述實驗結果表明,ASS1是一個代謝檢查點,在DNA損傷后,它通過限制核苷酸合成和p53相關基因轉錄來阻斷細胞周期進程,從而實現基因組的維持和存活。ASS1缺失則會導致DNA損傷并加快細胞周期進程,進而引發導致癌癥突變。
尿素循環是哺乳動物的主要代謝途徑,精氨酸琥珀酸合成酶ASS1將天冬氨酸和瓜氨酸結合形成精氨琥珀酸,后者被精氨酸裂解酶ASL分解形成鳥氨酸和尿素。ASS1還與ASL在細胞質中參與精氨酸-瓜氨酸循環,以供......
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