LncRNA芯片應用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范圍內,每年因肝癌死亡的病例超過50萬人,是主要的致死惡性腫瘤之一。在過去的十年中,隨著影像學的進步以及健康體檢的普及,越來越多的肝癌病人在患病早期被發現。但由于肝臟捐贈者的短缺,外科肝臟切除術仍然是治療早期肝癌病人的最主要方法。目前對于術后患者缺乏準確預測體系或標志物。本研究建立了一種預測早期肝癌病人術后復發的模型。 研究結果 1. CpG位點選擇 研究者首先對66例病人的樣本采用450K芯片(該研究中Illumina Methylation 450k Beadchip服務由伯豪生物提供)檢測,過濾得到2550個差異CpG位點。隨后,研究者為了區分高風險和低風險的病人,采用LASSO和SVM-RFE算法分別得到了30個差異最顯著的CpG位點。 2. 探究可預測的標簽 通過比較兩種算法得到的CpG位點......閱讀全文
條碼化紙基芯片應用于即時檢驗
即時檢驗(POCT)技術在近些年得到了快速發展,被廣泛應用于醫學檢驗、食品安全和環境監測等領域,在POCT技術的發展歷程中,紙基芯片扮演了十分重要的角色,紙基芯片具有檢測速度快、操作簡便、可便攜、成本低廉等特點,完全契合POCT技術對即時性、便捷性和低成本的需求,在極大程度上推動了POCT的發展。然
染色體芯片應用于產前檢查
2012.12.“新英格蘭醫學雜志”登哥倫比亞大學醫學中心所發表1 項臨床研究顯示,染色體芯片(Chromosomal microarray)比傳統的染色體核型分析(Karyotyping)能提供更多的臨床訊息,可以成為產前診斷的標準做法。華聯生技 “Phalanx Biotech Gr
蛋白質芯片技術應用于藥物篩選
疾病的發生發展與某些蛋白質的變化有關,如果以這些蛋白質構筑芯片,對眾多候選化學藥物進行篩選,直接篩選出與靶蛋白作用的化學藥物,將大大推進藥物的開發。蛋白質芯片有助于了解藥物與其效應蛋白的相互作用,并可以在對化學藥物作用機制不甚了解的情況下直接研究蛋白質譜。還可以將化學藥物作用與疾病聯系起來,以及藥物
染色體芯片應用于產前檢查
2012.12.“新英格蘭醫學雜志”登哥倫比亞大學醫學中心所發表1 項臨床研究顯示,染色體芯片(Chromosomal microarray)比傳統的染色體核型分析(Karyotyping)能提供更多的臨床訊息,可以成為產前診斷的標準做法。華聯生技 “Phalanx Biote
lncRNA在農業領域的研究成果
miRNA的好Homie,非編碼RNA界的NewStar --沒想到在農業上大展身手啦 你沒看錯!不是標題黨。說到miRNA的好Homie,非編碼RNA界的NewStar,想必聰明博學的你就已經猜到了是lncRNA。今天大閱哥要給大家挖一挖lncRNA在農業上的研究進展。為了寫這篇主題
上海交大LncRNA研究刊登國際期刊
長非編碼RNA(lncRNA)不編碼蛋白質,最初被認為是基因組“暗物質”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色質修飾復合物的招募過程中發揮作用,并能影響基因的表達。然而,是否lncRNAs以類似的方式在癌癥中發揮作用,尚不明確。延伸閱讀:中美學者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
長鏈非編碼-RNA(lncRNA)研究策略
長鏈非編碼 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是轉錄本長度在 200-100000 nt 之間的 RNA 分子,它們不編碼蛋白,位于細胞核或胞質內,具有保守的二級結構。研究顯示,lncRNA 并非以前所認識的那樣沒有功能,它可與蛋白質、DNA 和 RNA 相互作
華裔學者Cell發表lncRNA研究的利器
長非編碼RNA(lncRNA)是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本,絕大多數位于細胞核內。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質,但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,這說明lncRNA具有重要的生物學意義。在測序技術的幫助下,人們已經發現了數千種lncRNA,但這些lncRNA的生物學功能依然
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...2
(二)云序客戶m6A RNA甲基化修飾表達譜,一次測序兩篇文章疾病:胃癌樣品:胃癌組織vs癌旁組織(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修飾對其修飾基因在胃癌中的異常表達及預后的潛在影響發表雜志:Frontiers in Genetics影響因子:3.258
微流控芯片應用于快速鑒定多重細菌
細菌感染可以引發多種疾病,不僅發病率高而且經常引發危重病情,因而需要及時診治。細菌感染的主要治療手段是使用抗生素,而抗生素治療需要在明確病原的前提下合理選擇抗生素的種類和劑量 。傳統的細菌鑒定方法是將病人體液標本涂布在含有培養基的瓊脂平板上培養增菌,繼而挑選優勢細菌培養鑒定并且進行藥敏實驗。這種方法
蛋白質芯片技術應用于疾病診斷
蛋白質芯片技術在醫學領域中有著潛在的廣闊應用前景。蛋白質芯片能夠同時檢測生物樣品中與某種疾病或者環境因素損傷可能相關的全部蛋白質的含量情況,即表型指紋(phenomic fingerprint)。表型指紋對監測疾病的過程或預測,判斷治療的效果也具有重要意義。Ciphelxen Biosystems公
幽門螺桿菌與胃癌的研究
幽門螺桿菌是1983年澳大利亞學者羅賓。沃倫(J.Robin,Warren)和巴里馬歇爾(Barry,Marshall)從一個慢性活動性胃炎患者胃粘膜活檢標本中首先分離到的。它是一種呈S形或弧形彎曲的革蘭陰性桿菌,菌體一端的鞭毛可以使細菌方便地穿過胃粘膜而定居至胃上皮細胞,又能產生大量尿素酶,分解尿
LncRNA:從分子調控到臨床應用的最新成果
2009年,隨著非編碼RNA(ncRNA)研究進展的深入,一類新的ncRNA分子—lncRNA掀起科學界的熱點話題,并逐漸成為分子生物學及臨床醫學研究的重要方向。康成生物與美國Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平臺,率先開展lncRNA表達篩查服務。Arra
LncRNA:從分子調控到臨床應用的最新成果
2009年,隨著非編碼RNA(ncRNA)研究進展的深入,一類新的ncRNA分子—lncRNA掀起科學界的熱點話題,并逐漸成為分子生物學及臨床醫學研究的重要方向。康成生物與美國Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平臺,率先開展lncRNA表達篩查服務。Arra
Diabetes:新研究發現調節leptin表達的lncRNA
長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類長度大于200nt的非編碼RNA,其在轉錄沉默、轉錄激活、染色體修飾等方面有重要的功能。許多研究已經發現肥胖會誘導脂肪細胞發生劇烈的轉錄組變化,最近一些證據表明長非編碼RNA在該過程中發揮關鍵作用。來自新加坡的研究人員對棕色脂肪細胞和白色脂肪細胞中與肥胖相關
lncRNA在農業領域的研究成果(一)
miRNA的好Homie,非編碼RNA界的NewStar --沒想到在農業上大展身手啦 你沒看錯!不是標題黨。說到miRNA的好Homie,非編碼RNA界的NewStar,想必聰明博學的你就已經猜到了是lncRNA。今天大閱哥要給大家挖一挖lncRNA在農業上的研究進展。為了寫這篇主題,大閱哥嘔心瀝
lncRNA反向遺傳學研究的典型案例
研究背景長鏈非編碼RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被認為是一類不能編碼蛋白的長鏈RNA。由于其序列較長,所以可以有較大的潛力形成多種復雜構象,從而通過不同生物學途徑發揮其作用。此外,由于其不具備蛋白編碼能力,因此此類RNA也主要由其堿基序列形成的高級結構來執行生物
lncRNA在農業領域的研究成果(二)
【思路及相應結果】內容與圖片源:(王立方,2015)【結論】通過全轉錄組測序、lncRNA測序和實時熒光定量的方法發現和鑒定了與家蠶產絲相關的lncRNA和其在不同產絲階段的表達量變化,挑出了與家蠶產絲調控緊密相關的非編碼RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互補鏈的lncR2034,與P25
lncRNA在農業領域的研究成果(三)
【結論】①通過lncRNA測序,在上萬條白菜中候選的lncRNA中挑出了1,300余條與花粉授粉相關的lncRNAs。分析結果顯示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整個發育過程中持續表達,其余的部分為階段、部位特異性表達。lncRNA在白菜不同發育階段花蕾種的表達呈現出較明顯的差異,在V級花蕾中特異
蛋白質芯片技術應用于抗原抗體檢測
在CavinM.等人的實驗中,蛋白質芯片上的抗原抗體反應體現出很好的特異性,在一塊蛋白質芯片上10800個點中,根據抗原抗體的特異性結合檢測到唯一的1個陽性位點。Cavin M.指出,這種特異性的抗原抗體反應一旦確立,就可以利用這項技術來度量整個細胞或組織中的蛋白質的豐富程度和修飾程度。其次利用蛋白
蛋白質芯片技術應用于生化反應的檢測
對酶活性的測定一直是臨床生化檢驗中不可缺少的部分。Cohen用常規的光蝕刻技術制備芯片、酶及底物加到芯片上的小室,在電滲作用中使酸及底物經通道接觸,發生酶促反應。通過電泳分離,可得到熒光標記的多肽底物及產物的變化,以此來定量酶促反應結果。動力學常數的測定表明該方法是可行的,而且,熒光物質穩定。Are
如何利用胃癌病人細胞建立類器官庫及研究胃癌發生分...
如何利用胃癌病人細胞建立類器官庫及研究胃癌發生分子機制胃癌是我國的主要癌癥之一,每年有數十萬人因胃癌而死亡。盡管腫瘤研究快速發展,胃癌研究卻相對滯后,原因是沒有合適的研究模型。2018年8月9日最頂級雜志《Cell》發表了來自于日本慶應大學醫學院,日本大冢制藥,日本國立癌癥研究中心醫院的文章,Div
譜芯片應用于TMED3調控原發性肝細胞癌HCC的轉移機制研究
原發性肝細胞癌(HCC)肝內外轉移是導致臨床手術后病人預后較差的重要原因之一。由于目前臨床上尚缺乏有效的靶向治療肝癌的化療藥物,尋找治療HCC轉移的有效靶點一直是科學家關注的重點。來自東方肝膽外科醫院周偉平教授,第二軍醫大學微生物教研室任浩教授,上海同仁醫院馬俐君教授的研究團隊通過臨床樣本,細胞
南方醫胃癌研究刊登國際權威期刊
腫瘤進展是惡性細胞和周圍微環境中各種基質細胞、免疫細胞亞群之間相互作用的產物。炎性細胞和炎癥介質是腫瘤微環境的重要組成部分。促炎性白細胞介素-17(IL-17)細胞因子最初因為它們在慢性炎癥性疾病中的致病作用而聞名,越來越多的證據表明,中性粒細胞參與了致癌作用和血管生成。臨床研究表明,浸潤在腫瘤
研究發現胃癌免疫治療作用機理
近日,中山大學腫瘤防治中心團隊研究發現了胃癌免疫治療的作用機理。相關成果近日在線發表于《先進科學》(Advanced Science)。論文共同通訊作者、中山大學腫瘤防治中心教授周志偉表示,該研究表明,EB病毒(EBV)陽性胃癌中大量浸潤的淋巴細胞通過持續分泌IFN-γ上調吲哚胺2,3-雙加氧酶1(
研究發現胃癌免疫治療作用機理
近日,中山大學腫瘤防治中心團隊研究發現了胃癌免疫治療的作用機理。相關成果近日在線發表于《先進科學》(Advanced Science)。 論文共同通訊作者、中山大學腫瘤防治中心教授周志偉表示,該研究表明,EB病毒(EBV)陽性胃癌中大量浸潤的淋巴細胞通過持續分泌IFN-γ上調吲哚胺2,3-雙加
研究稱肉毒素可遏制胃癌發展
法新社8月20日發表題為《肉毒素可抑制胃癌的發展》的文章,主要內容如下: 一份研究報告20日指出,注射美容院用于抗皺的肉毒素可阻止胃癌病灶周圍的神經沖動,這或可成為有希望的抗癌療法。 從事該研究的蒂莫西·王(音)教授和杜安·陳(音)教授分別來自紐約哥倫比亞大學醫學院和挪威科技大學,他們表示,
研究揭示:低鈉鹽或可降低胃癌風險
近日,由哈爾濱醫科大學公共衛生學院田懋一教授團隊與南昌大學公共衛生學院尹學珺教授團隊聯合完成的一項科研課題被國際期刊《BMC醫學》在線發表。審稿專家指出,盡管當前研究數據尚未達到統計學顯著性,但如果延長隨訪時間,有望更清晰地揭示低鈉鹽對降低胃癌風險的效應。胃癌位列全球常見癌癥第5位及癌癥相關死亡原因
瑞金醫院胃癌“轉化醫學”研究見成效
中新上海網9月4日電 今年8月份剛剛出版的國際生物醫學領域極具影響力的《蛋白質組研究》(J Proteome Res)上公布了瑞金醫院胃癌研究團隊最新研究成果。該研究利用血清抗體芯片、酶聯免疫吸附實驗、蛋白質免疫沉淀、免疫組織化學以及質譜鑒定等技術,通過翔實的體外實驗以及大量臨床病例分析,提出IPO
microRNA芯片篩選發現血清血漿中的胃癌早期診斷標志物
胃癌是世界第四大癌癥,在所有癌癥致死率排行中名列第二。每年都有超過?百萬的病人被確診為胃癌,其中75%來自亞洲。常見的胃癌相關生物標志物有癌胚抗原(carcinoembryonic an/gen)和糖類抗原19-9(carbohydrate an/gen 19-9),但這些生物標志物對于早期胃癌