RNA表觀修飾能夠影響天然免疫研究
前言 DDX46是RNA解旋酶DDX家族成員，對于細胞核內mRNA前體的剪接具有重要的調控作用。《Nature Immunology》雜志8月29日發表了中國醫學科學院院長、中國工程院院士曹雪濤研究團隊的論文，揭示了RNA解旋酶DDX46通過結合RNA去甲基化酶ALKBH改變細胞核內RNA修飾的新方式，參與調控抗病毒天然免疫應答。這篇文章提出了一種新的天然免疫與炎癥調控機制，為病毒感染和炎癥性疾病的防治提供了新的潛在靶標與思路，伯豪助力完成了實驗轉錄組可變剪接的分析部分。 研究思路DDX解螺旋酶對于RNA的識別和代謝具有重要的調控作用，其家族成員DDX46一般專一地在細胞核內發揮作用，調控mRNA前體的剪接。免疫系統在受到病毒侵染時，會快速激活抗病毒天然免疫反應中相關mavs、traf3等I型干擾素的轉錄，在核內產生大量相關轉錄本。文章發現DDX46可以與干擾素轉錄本結......閱讀全文
研究發現組蛋白表觀修飾參與調控植物鐵離子的吸收
蛋白精氨酸甲基轉移酶在轉錄調控、RNA加工、DNA修復和信號轉導等重要生物學過程中發揮著重要作用。中科院遺傳與發育生物學研究所凌宏清和鮑時來研究組最近的合作研究發現，擬南芥蛋白精氨酸甲基轉移酶SKB1可根據細胞內鐵離子含量的多少，動態結合到控制鐵離子吸收的轉錄調控基因bHLH38、bHLH39、
Nature子刊：表觀遺傳學修飾調控染色體數
眾所周知，染色體數的異常往往與癌癥發展有關。日前瑞典卡羅琳斯卡醫學院的科學家們發現，一個微小的表觀遺傳學改變，在染色體的正確分離中起到了至關重要的作用。這項研究于二月十六日提前發表在Nature Structural and Molecular Biology雜志的網站上。 在正常情況
看表觀新修飾6mA甲基化如何助力IF飆升!
DNA甲基化修飾是表觀遺傳研究的熱點之一，我們通常認為DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），卻不知道隨著測序技術的快速發展，科研者們已經在真核生物中（果蠅 、真菌、萊茵衣藻、秀麗隱桿線蟲等）發現了一種新的DNA甲基化修飾—DNA-6mA甲基化，且DNA-6m
表觀遺傳學修飾對軸突再生調控作用的研究進展
軸突是神經沖動傳遞過程中結構與功能的基本單位。無論在中樞抑或是周圍神經系統損傷后，誘導有效的軸突再生過程是改善神經功能的基礎。現已證實，脊髓損傷后軸突能否再生不僅取決于其固有的生長能力，還取決于軸突所處的環境。神經系統損傷后，神經細胞對軸突再生相關基因的表達動員能力及細胞骨架原料的形成能力是決定
研究揭示植物感知春化信號表觀修飾位點和記憶調控網絡
冬性植物、二年生植物和多年生植物的開花需要長時間環境低溫誘導，此過程稱為春化作用。春化作用的發現已近百年。隨著遺傳和生理學研究的進展，人們發現春化作用受遺傳和表觀遺傳調控，植物對春化處理有記憶功能，但僅能維持一代。目前，科研人員對春化作用的表觀調控機制有了一定研究，但僅局限于少數幾個基因，對春化
新CRISPR轉基因鼠體內基因表達和表觀遺傳修飾精準調控
CRISPR-Cas9系統為基礎的基因編輯技術極大的推動了生物醫學研究的進步。除直接編輯基因組DNA外，研究者還將失活型Cas9（dCas9）與轉錄調控元件或染色體修飾元件融合，構建出可實現轉錄和表觀遺傳學修飾調控的新工具如CRISPRa（轉錄激活工具），CRISPRi（轉錄抑制工具）以及CRI
骨髓增生異常綜合癥的表觀遺傳學修飾治療
5-阿扎胞苷（Azacitidine，AZA）和5-阿扎-2?-脫氧胞苷（Decitabine，地西他濱）可降低細胞內DNA總體甲基化程度，并引發基因表達改變。兩種藥物低劑量時有去甲基化作用，高劑量時有細胞毒作用。阿扎胞苷和地西他濱在MDS治療中的具體劑量方案仍在優化中。高危MDS患者，是應用去
Nature：線粒體中的RNA修飾能促進癌癥的擴散
腫瘤細胞在轉移過程中會消耗遠超正常細胞需要的能量，德國癌癥研究中心的研究團隊發現了與能量代謝相關的新型癌細胞轉移的促進因素，相關成果在《Nature》發表，論文的標題為：Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met
揭示RNA－m6A修飾調控抗腫瘤免疫機制
免疫治療是對抗腫瘤的前沿陣地，其治療成功的關鍵是引發針對腫瘤抗原的自發性T細胞反應。許多病人的免疫系統無法有效識別腫瘤抗原，難以引發持續性的T細胞應答并清除腫瘤。研究免疫系統識別腫瘤抗原的分子機制有望發現新型藥物靶點，提高免疫治療效果。 中國科學院北京基因組研究所韓大力團隊與清華大學徐萌團隊、
RNA修飾過程中重要化學步驟揭示
項新的研究揭示了為一些RNA添加化學標簽的重要細胞修飾過程中的化學步驟。這一過程被干擾可能會導致人類患神經元疾病、糖尿病和癌癥。由美國賓夕法尼亞州立大學化學家領導的一個研究小組已經對一種促進細菌RNA修飾的蛋白質進行了成像，從而重建這一過程。相關論文15日發表在《自然》雜志上。 轉運RNA（t
Nature：線粒體中的RNA修飾能促進癌癥的擴散
腫瘤細胞在轉移過程中會消耗遠超正常細胞需要的能量，德國癌癥研究中心的研究團隊發現了與能量代謝相關的新型癌細胞轉移的促進因素，相關成果在《Nature》發表，論文的標題為：Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met
Nature：線粒體中的RNA修飾能促進癌癥的擴散
腫瘤細胞在轉移過程中會消耗遠超正常細胞需要的能量，德國癌癥研究中心的研究團隊發現了與能量代謝相關的新型癌細胞轉移的促進因素，相關成果在《Nature》發表，論文的標題為：Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met
擬南芥RNA核糖甲基化修飾研究方面獲進展
3月30日，中國科學院生物物理研究所研究員葉克窮課題組、北京大學現代農學院博士王玉秋和中科院遺傳與發育研究所研究員李家洋課題組合作在Nucleic Acids Research上發表了題為Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
表觀遺傳研究熱點：RNA－甲基化（m6A）研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入，組蛋白修飾（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和?DNA?甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存在可逆的表觀遺
表觀遺傳研究熱點：RNA－甲基化（m6A）研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入，組蛋白修飾（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和 DNA 甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存
揭示腸道細菌調控表觀轉錄組修飾促進結直腸癌轉移機制
結直腸癌是常見惡性腫瘤之一，是全世界發病人數第三、死亡人數第二的惡性腫瘤。結直腸癌在我國同樣不容樂觀。盡管結直腸癌的治療手段不斷發展，但晚期轉移性結直腸癌患者的預后生存仍然不理想，我們需要對結直腸癌的轉移機制有更深刻的認識。 近年來，隨著宏基因組測序等研究手段的不斷進展，人們發現腸道菌群能廣泛
Nature：科學家成功解析人類表觀遺傳學修飾的特殊語言
表觀遺傳學改變在癌癥、代謝性疾病和年齡相關疾病的發生過程中扮演著重要角色，但在機體適應力喪失的過程中其或許也發揮著重要作用，因為其會導致受影響細胞中的遺傳物質被錯誤解釋。 近日，一篇發表在國際雜志Nature上題為“Decoding chromatin states by proteomic
表觀遺傳修飾的細胞中DNA發生BZ構象轉變被揭示
細胞核中，纏繞在組蛋白上的雙鏈DNA一般以右手螺旋的B-DNA構象存在，但也會存在其它構象。組蛋白的乙酰化修飾是表觀遺傳學研究的重要內容。當組蛋白發生乙酰化時，DNA 與組蛋白八聚體的緊密纏繞被解開。那么，組蛋白的乙酰化是否影響DNA的構象，甚至導致B-DNA構象向其它構象包括Z-DNA構象轉化
心理所發現青少期應激導內側前額葉BDNF表觀修飾改變
精神疾病發病是環境因素和遺傳因素交互作用的結果。應激，尤其是發生在生命早期的應激會影響腦的發育過程，顯著增加個體成年后罹患精神疾病的風險。這種早期環境因素導致的長期效應，其具體機制目前尚不明確。近年來，越來越多的臨床及基礎研究表明，早期應激導致表觀遺傳指標發生持久性變化，進而改變基因的表達，這種
我國學者揭示發育過程中表觀遺傳修飾的協同調控
近期，哈爾濱工業大學和哈爾濱醫科大學的研究人員利用生物信息學方法，整合高通量的表觀基因組數據，發現了在小鼠發育過程中CpG島上各種表觀遺傳修飾的協同變化，并揭示了其對發育基因的共調控。相關成果公布在Nature出版集團旗下期刊Scientific Reports雜志上。 CpG島是指基
表觀遺傳修飾家族又添新成員－組蛋白丁酰化新功能詮釋
近年來，芝加哥大學趙英明教授課題組運用高分辨質譜技術發現了多種組蛋白密碼，極大豐富了表觀遺傳修飾調控機制。在剛剛上線的國際知名期刊Molecular Cell上，該課題組又同時報道了三項最新研究成果。其中第一項研究首次發現了一種跟酮體代謝密切相關的表觀遺傳新修飾——組蛋白三羥基丁酰化[1]；第二
莊小威院士：新成像方法測量染色質的表觀遺傳修飾
空間組學方法的最新發展使得單細胞轉錄組分析和三維基因組組織具有較高的空間分辨率。空間分辨單細胞表觀基因組學方法將擴展空間組學工具的知識庫，加速對細胞和組織功能的空間調節的理解。 2022年10月21日，哈佛大學莊小威團隊在Cell 在線發表題為“Spatially resolved epige
我國學者揭示發育過程中表觀遺傳修飾的協同調控
近期，哈爾濱工業大學和哈爾濱醫科大學的研究人員利用生物信息學方法，整合高通量的表觀基因組數據，發現了在小鼠發育過程中CpG島上各種表觀遺傳修飾的協同變化，并揭示了其對發育基因的共調控。相關成果公布在Nature出版集團旗下期刊Scientific Reports雜志上。 CpG島是指基
Nature子刊：表觀遺傳學修飾與阿爾茨海默癥
失憶是阿爾茨海默癥AD患者的典型癥狀，日前科學家們鑒定了導致這些患者失憶的關鍵蛋白，這項研究發表在一月十九日的Nature Neuroscience雜志上。 神經連接蛋白NLGN1是一種突觸后蛋白，存在于中樞系統的興奮性突觸中，控制著興奮性突觸的有效性和大腦的可塑性。此前人們已經發現N
Cell子刊：表觀修飾在抗病毒天然免疫中的作用
來自浙江大學生科院的研究人員發表了題為“Lck/Hck/Fgr-mediated tyrosine phosphorylation negatively regulates TBK1 to restrain innate antiviral responses”的文章，報道抗病毒天然免疫關鍵激酶
Cell子刊：表觀修飾在抗病毒天然免疫中的作用
來自浙江大學生科院的研究人員發表了題為“Lck/Hck/Fgr-mediated tyrosine phosphorylation negatively regulates TBK1 to restrain innate antiviral responses”的文章，報道抗病毒天然免疫關鍵激酶
2019年云序RNA甲基化修飾領域文章匯總
感恩有你，一路同行！2019年末，云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候！光陰如梭，一年轉瞬又將成為歷史，新的一年意味著新的起點、新的機遇、新的挑戰，決心再接再厲，更上一層樓。回首即將過去的2019，云序生物不斷創新，碩果累累；展望2020，任重道遠卻信心倍
一種修飾RNA療法更有助治療心力衰竭
與傳統的提供較長時間蛋白表達的傳統DNA投遞方法相比，一種采用修飾RNA的治療方法通過限制治療蛋白表達數日的方式在患有心力衰竭小鼠身上具有更優秀的表現。本周發表在《自然—生物技術》上的這項研究表明，修飾RNA或許能為通過激活內在干細胞以修復受損組織的治療方案提供一種有用的工具。 Kenne
植物RNA修飾將成為新一代作物改良靶標
近日，上海交通大學生命科學技術學院副教授姜博晨課題組在《生物技術通報（英文）》（aBIOTECH）發表了綜述論文。文章系統梳理了植物m6A調控的最新研究進展以及利用m6A修飾進行作物改良的潛在應用策略。 RNA表觀修飾是指發生在RNA分子上的化學修飾，廣泛存在于動物、植物、真菌等真核生物。N6
揭示了m6A－RNA修飾的新的進化意義
無義介導的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一種重要的mRNA質量控制方式，細胞通過檢驗終止密碼子與最后一個剪接接頭的距離是否超過55nt來判斷該終止密碼子是否為提前終止密碼子（Premature Termination Codon, PTC）從而決