我國完成小麥A基因組測序
5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和系統研究麥類植物的結構與功能基因組學，以及進一步推動栽培小麥的遺傳改良具有重要理論意義和實用價值。研究團隊在前期小麥A基因組草圖繪制的基礎上，完成了烏拉爾圖小麥材料G1812的基因組測序和精細組裝，繪制出了小麥A基因組7條染色體的分子圖譜，注釋出了41507個蛋白編碼基因，發現在小麥基因組中參與春化和開花的REM類轉錄因子基因有明顯擴增。通過與水稻、高粱和短柄草基因組的比較和共線性分析，科研人員推演出小麥A基因組7條染色體的進化模型，并鑒定出小麥A基因組從二倍體、經四倍體到六倍體進化過程中的染色體結構變異。群體遺傳......閱讀全文
基因組測序拯救鸮鸚鵡
為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo，幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序，這為其保護管理提供了重要信息。 新西蘭鸮鸚鵡kakapo（Strigops habroptila）有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡，有的雄性甚至超過3公斤，被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡，通過
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
簡化基因組測序好做嗎
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度，進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD（Restriction site Associated DNA）和GBS（Genotyping By Sequencing）。這些技
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成，巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快，可以用作燃料和木材，是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東
基因組測序的具體過程
講起來很復雜哈，簡單來說，就是邊合成邊測序，把所要測序的序列通過各種手段來建庫，然后加上5‘和3’都加上接頭，放在一個小玻璃片一樣的芯片上，上面一般是8個lane，把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合（之前的建庫時加的接頭與之反向互補），然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇，然
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
測序基因組勘探食品污染
上周，兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品，至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而，堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠（Blue Bell Creameries）已確認有少量食品原料已感染李斯特菌，目
基因測序揭示小麥馴化的關鍵基因突變
從野草到人類主糧之一，小麥在被馴化的過程中發生了巨大變化。一個國際科研小組對野生小麥進行基因測序，發現了控制穗軸易碎性的兩組基因，它們在小麥馴化過程中起著關鍵作用。這一發現有助于培育更好的小麥品種。 位于今天中東地區被稱作“新月沃地”的區域，是小麥的起源地。大約１萬年前，這里的居民開始種植小麥
幾近完成的普通小麥的基因組
麥田 研究人員已經展示了普通小麥基因組的序列草圖，從而在通往創制世界上種植最廣泛谷物作物之一的完整參考序列的道路上到達了一個主要的里程碑。他們的工作給了科學家們一個可在小麥個體染色體上快速定位特定基因的工具，這一資源可幫助他們改良小麥育種以滿足從未有過的對食物的更高需求，加快小麥新品種的開發并增加
小麥野生近緣種基因組“密碼”被破解
記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉，該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列，解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑，對兩者攜帶的抗小麥赤霉病基因Fhb7同源序列的功能與抗性效應進行了研究，為小麥抗性遺傳改良及牧草育種提供了重
史上最全小麥基因組序列圖集問世
??據最新一期《自然》雜志報道，加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中，對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因，從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥
歷經13年－小麥基因組圖譜繪制完成
經過１３年努力，來自２０個國家７３個研究機構的２００多名科學家終于繪制完成完整的小麥基因組圖譜。這項“里程碑”工作為培育產量更高、營養更豐富、氣候適應性更強的小麥品種奠定基礎。 國際小麥基因組測序協會１６日在說，他們以一種叫做“中國春”的小麥遺傳研究模式品種為材料，研究整合了２１條小麥染色
小麥基因組編輯抗病育種研究取得進展
民為國基，谷為民命。糧食安全是國家安全的重要基礎，是關乎國運民生和社會穩定的頭等大事。植物病害每年造成全球作物減產可達30%，全球氣候變化、耕作制度改變及種植品種單一化等多種因素的疊加，致使植物病害更加頻繁發生，嚴重威脅全球和我國糧食安全。選育和推廣抗病新品種是防治作物病害經濟、有效和環境友好的策略
盤點基因組測序的最新成果
近日，the scientist雜志發表文章盤點了最近發布的幾項基因組測序成果，一起來看看吧。 昏睡病傳播者 種屬：采采蠅(Glossina morsitans morsitans) 基因組：360 million bp 國際舌蠅基因組計劃(International G
基因組高通量測序的原理
測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等，1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序，每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和標準M
美洲大蠊基因組測序完成
中科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所詹帥及同事對美洲大蠊進行了基因組測序和分析，表明在已測基因組的昆蟲中，其基因組規模僅次于蝗蟲。這項研究3月21日在線發表于《自然—通訊》，文章揭示了該物種成功適應城市環境的遺傳學基礎的相關洞察。 美洲大蠊（Periplaneta americana
基因組測序竟能準確預測長相！
克萊格·文特爾（Craig Venter）博士是一名不折不扣的“科學狂人”。幾十年前，他創立的Celera Genomics曾以一家公司之力，加快了“人類基因組計劃”的發展。他本人也于2000年和美國NIH負責人弗朗西斯·柯林斯（ Francis Collins）博士一道，共同宣布了人類基因組草
Nature發布基因組測序驚人發現
來自沖繩科學技術研究院大學(OIST)的一支研究團隊與合作者們，完成了對兩個稱作為柱頭蟲(acorn worm)的小水生生物物種的測序，顯示相比于許多其他動物，我們與柱頭蟲共享了更多的基因，確立了它們是我們的遠親。研究結果發布在《自然》（Nature）雜志上。 研究發現，所有后口動物（deut
Nature發布基因組測序重要發現
由科隆大學Roman Thomas領導的一個國際研究小組，對110個小細胞肺癌（SCLC）樣本進行了測序，發現除了兩個樣本其余所有的均包含失活的TP53和RB1基因。通過調查這一疾病的基因組景觀，他們還發現有不少的腫瘤具有與TP73基因相關的基因組重排或突變，以及激酶基因突變和Notch家族基因
最新基因組測序成果盤點
近來，各大雜志上陸續發表了不少重要的基因組測序成果。the scientist雜志對此進行了盤點，以饗讀者。 種屬：野鴨，綠頭鴨(Anas platyrhynchos) 基因組：約13 billion bp 鴨子是幾乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人員測
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，將為鳥類的群體
Science公布最新基因組測序結果
來自法國農業科學研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人員發表了題為“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”
基因組測序助力腫瘤精密治療
最近，約翰霍普金斯大學Kimmel癌癥中心的科學家，在對101例胰腺癌患者的血液和腫瘤進行基因組測序后發現，至少三分之一患者的腫瘤有基因突變，這些突變有朝一日可能幫助指導疾病的精密治療。他們說，與標準的影像學檢查方法相比，血液檢測的結果，可以早半年預測到癌癥的復發。 約翰斯霍普金斯大學醫學院腫
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
讓基因組測序繞過PCR擴增
在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
GenomeBiology發布基因組測序重要成果
Genome Biology雜志發布了遠東豹（Far Eastern Amur leopard）的首個全基因組序列，為人們揭示了肉食對基因多樣性和種群規模的影響。“我們將遠東豹基因組與其它哺乳動物基因組進行比較，發現肉食似乎是很強的選擇壓力。這種現象在雜食動物和食草動物中并不明顯。舉例來說，牛吃肉對
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，
PNAS：基因組測序的驚人發現
科學家們發現，水母（平凡的海洋生物）經過漫長的進化變成了生活在其它動物體內的奇特寄生蟲。這項研究發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 Myxozoa是感染無脊椎動物和脊椎動物宿主的微小寄生蟲，由少數幾個細胞組成。美國堪薩斯大學的研究人員對這種生物進行了基因組測序，發現它們實際上是高度