黃三文：蔬菜遺傳密碼的破譯者
黃三文，1971年出生于湖南岳陽。中國農業科學院蔬菜花卉所研究員，博士生導師。1996年碩士畢業于北京農業大學，2005年獲荷蘭瓦赫寧根大學博士學位。現任深圳農業基因組所副所長，國家“973”項目“主要蔬菜重要品質性狀形成的遺傳機理與分子改良”首席科學家、國際黃瓜基因組計劃首席科學家、國際茄科基因組研究聯盟的執行委員等；獲國家科技進步二等獎1項，2012年獲“國家杰出青年科學基金”“華耐園藝科技獎”，入選科技部中青年科技創新領軍人才、“百千萬人才工程”國家級人選等。 “吃黃瓜快吃到瓜蒂時，往往會變得非常苦。關于黃瓜苦味問題，科學家一直沒找到原因。”中國農科院蔬菜花卉所研究員、深圳農業基因組所副所長黃三文高興地說，“經5年努力，我們終于找到了合成苦味物質葫蘆素c的9個基因，也找到了調控黃瓜苦味的兩個‘主開關’。” 今年11月28日出版的《科學》雜志以長篇論文形式發表了該成果，這也是近5年來《科學》《自然》和《自然遺傳學......閱讀全文
基因組研究持續存在“歐洲偏向”
科學家近日在《自然》雜志評論版塊撰文表示，目前基因組學持續存在一種“歐洲偏向”，即大部分研究以歐洲群體為主，這導致其多樣性嚴重不足。而正是歷史、文化、科學和情理因素交織在一起，使基因組學研究維持了這種“尷尬的偏向”。 全基因組關聯研究（GWAS）掃描成千上萬人的基因組，通過對大規模的群體D
基因組研究持續存在“歐洲偏向”
科學家近日在《自然》雜志評論版塊撰文表示，目前基因組學持續存在一種“歐洲偏向”，即大部分研究以歐洲群體為主，這導致其多樣性嚴重不足。而正是歷史、文化、科學和情理因素交織在一起，使基因組學研究維持了這種“尷尬的偏向”。 全基因組關聯研究（GWAS）掃描成千上萬人的基因組，通過對大規模的群體D
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物（包括其他藻類）中的葉綠體，都同樣進行放氧的光合作用，這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析，證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。 藍藻基因組的
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物（包括其他藻類）中的葉綠體，都同樣進行放氧的光合作用，這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析，證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。藍藻基因組的作圖和測
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物（包括其他藻類）中的葉綠體，都同樣進行放氧的光合作用，這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析，證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。 藍藻基因組的
最大規模腎癌基因組研究
腎癌起源于腎小管上皮細胞，是泌尿系統常見惡性腫瘤之一，發病率占全身惡性腫瘤的3%。腎癌的化療效果并不理想，腎切除手術被認為是最有效果的治療途徑。近50年來腎癌的發病率和死亡率在持續上升，但人們還不太清楚腎癌的發病原因。 貝勒醫學院的副教授Dr. Chad Creighton領導研究團隊深入分析
研究發現全新全基因組組裝方法
十年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 英國時間12月9日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 這篇論文只有兩位作者，
《Nature－Genetics》：癌癥的基因組結構研究
癌癥的基因組結構研究發表《Nature Genetics》 B細胞通過一系列精心控制的染色體重排和“良好”突變產生抗體，這些突變使細胞能夠產生大量不同的抗體。“盡管變化對產生大量多樣的抗體至關重要，但仍有可能發生‘壞’突變并導致B細胞源性癌癥，”研究負責人、哥倫比亞大學內科醫師和外科醫生學院微
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
藍藻和葉綠體基因組的比較研究原核的藍藻和真核植物（包括其他藻類）中的葉綠體，都同樣進行放氧的光合作用，這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析，證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模
茄子基因組研究邁入高清時代
10月31日，由廣西農業科學院蔬菜研究所研究員王益奎領銜的研究團隊，于生物學論文預印本服務器BioRxiv在線發布了染色體級別的高質量茄子基因組序列。該團隊采用PacBio測序技術，結合Dovetail Hi-C建庫技術與HiRise組裝算法，獲得了目前連續性最好的茄科作物基因組，標志著茄子基
茄子基因組研究邁入高清時代
10月31日，由廣西農業科學院蔬菜研究所研究員王益奎領銜的研究團隊，于生物學論文預印本服務器BioRxiv在線發布了染色體級別的高質量茄子基因組序列。該團隊采用PacBio測序技術，結合Dovetail Hi-C建庫技術與HiRise組裝算法，獲得了目前連續性最好的茄科作物基因組，標志著茄子基因
基因組研究顯示：豬與人“如此相似”
通過迄今為止規模最大的豬基因組研究，科學家發現豬擁有很強的適應能力，容易被食物誘惑和馴化，這些特征都與人類非常相似。而且，豬具有與人類相同的與很多人類疾病有關的基因和蛋白質變異。這一成果近日刊登在了《自然》雜志上。 在奧威爾的經典小說《動物莊園》中，豬和人類幾乎一模一樣。根據上述研究，《動
“863”腫瘤全基因組研究獲進展
7月14日，“十一五”國家“863”重大專項“食管癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”和“肺癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”成果匯報會在京召開。 日前，遺傳學權威期刊《自然—遺傳學》刊登了我國科學家食道癌和肺癌研究的重要進展。由中國醫學科學院腫瘤研究所分子腫瘤學國家重點實驗室教授林東昕
Nature發布輪蟲基因組研究新成果
有一群動物放棄了性，但卻在進化過程中生成了460多種物種。本周的《自然》(Nature)雜志上發表了一篇關于蛭形輪蟲(bdelloid rotifer)全基因組的研究論文，為揭示這一進化機制減少了些許神秘。 Woods Hole海洋生物學實驗室(MBL)David Mark Wel
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物（包括其他藻類）中的葉綠體，都同樣進行放氧的光合作用，這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析，證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。藍藻基因組的作圖和測
－Nature：基因組研究探秘膀胱癌
日前，來自癌癥基因組圖譜研究網絡(The Cancer Genome Atlas Research Network, TCGA)的研究人員在《自然》雜志上報告稱，他們確定了一種主要的膀胱癌形式的新潛在治療靶點，其中包括疾病中遭到破壞的一些重要基因和信號通路。 此外，他們還發現，在分子水
近期最受關注的基因組測序研究
想象一下有人遞給你一杯奶昔，要你鑒別出里面所有的東西。或許你能夠辨別出有一點點的草莓或是酸奶的味道。但總體上它的味道就像是無法分辨的成分構成的混成品。 現在再想象一下，這杯奶昔是由來自大腦的2萬個碾碎了的細胞所組成。你可以通過測試來確定樣本中有什么分子，這就是科學家們現在所做的事情。這當然會提
作物基因組學研究進展
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
華大基因宏基因組研究獲顛覆性發現
嬰兒的微生物組需要在成長過程中慢慢成熟。科學家們對98名一歲以內的瑞典嬰兒進行了腸道菌群分析。他們發現，即使引入了固體食物，非母乳嬰兒的微生物組仍舊比母乳嬰兒更接近成人。這項研究發表在五月十三日的Cell Host & Microbe雜志上。 “我們一直以為引入固體食物是改變嬰兒腸道菌群的關鍵
華大基因攜手愛丁堡大學，共促基因組學研究
2012年7月24日，深圳華大基因研究院與英國愛丁堡大學簽署合作協議，宣布雙方將在基因組領域展開廣泛的科研合作，通過匯聚中英兩國研究專長，加速基因組學在人類健康和農業及其他相關領域的創新和發展。 在簽署的合作備忘錄中，雙方將著眼于對人類和其他生物的科學認識，通過共同努力，對遺傳信息進行深入
基因組所參加國際基因組ENCODE計劃取得系列研究成果
? 近日，國際科學界宣布“DNA元素百科全書”(簡稱ENCODE)計劃獲得了迄今最詳細的人類基因組分析數據，并以30余篇論文的形式同時發表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI學術期刊上。ENCODE被認為是繼“人類基
基因組所參與的人類全基因組關聯分析合作研究獲重要進展
與血小板數量相關的GWAS SNP與222 kb 以外的JAK2基因相關聯 日前，中科院北京基因組研究所重大疾病基因組與個體化醫療實驗室“百人計劃”方向東研究員項目組助理研究員渠鴻竹博士等參與開展的國際合作研究“人類疾病全基因組關聯分析研究”獲得重大進展。相關研究成果Systema
宏基因組研究新突破，復旦最新研究發Nature
近年來偽狂犬、猴痘等病毒從動物向人類外溢引發新發傳染病甚至全球大流行的頻率正在顯著增加如何精準預測和預報動物源新發傳染病是關系綠色健康養殖與公共衛生防控的重要科學問題復旦大學公共衛生學院粟碩教授團隊與合作者運用前沿交叉研究方法揭示多種哺乳動物宏基因組數據中的病毒基因組組成、生態學特征與跨物種傳播規律
基因組所國際合作項目椰棗基因組測序及功能研究獲進展
最近，由中國科學院北京基因組研究所與沙特阿卜杜拉國王科技城(King Abdulaziz City for Science and Technology, KACST)共同啟動的合作項目“棗椰 (Phoenix dactylifera L.)基因組計劃”獲得系列進展，本月初其標志性研究—
Coimbra基因和華大基因聯合發起胃癌基因組研究計劃
2013年9月30日，華大基因和來自葡萄牙的一家新興生物公司Coimbra基因聯合發起了一項胃癌基因組研究計劃，以解密胃癌背后的遺傳奧秘。該項目的啟動經費達90萬美元，將成為胃癌領域內首個大規模基因組研究項目。該項目的科研團隊包括來自葡萄牙波爾圖頂級癌癥研究所 ――IPATIMUP的遺傳學家
Nature：從基因到功能，紅細胞全基因組關聯研究
一項新研究正揭示機體如何生成紅血細胞，以及隨時調控紅細胞中血紅蛋白(haemoglobin)量的機制。利用全基因組分析技術，研究人員將有可能與紅細胞形成相關的遺傳區域數量增加了一倍，隨后的果蠅研究獲得了關于這些區域功能的一些新認識。相關成果發表在《自然》(Nature)雜志上。 血紅蛋白是