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  • 發布時間:2016-04-26 09:18 原文鏈接: ZL大數據揭醫藥化學家藥物研發新趨勢

      在藥物開發領域,化學家非常關注制藥過程中哪些分子、哪些反應更有價值。最近,瑞士諾華生物醫藥研究所和英國一家軟件公司合作,研究了美國1976年至2015年間公布的ZL情況,揭示了這40年來藥物化學家在從事哪些研究,以及藥物開發趨勢的變化。這一研究成果有助于了解藥物研制中最常用的化學反應。

      據美國化學協會化學與工程網站報道,以往研究所用的數據大多來自科學雜志、醫藥公司實驗室電子筆記等。但該研究團隊認為,在ZL數據中能發掘出更多東西。因為該行業傳統觀點認為,用來構造新奇結構的化學方法,可能不會公布在科學文獻中,或即使公布也是在之后很久的事。

      研究人員發表在最近的《醫藥化學》雜志上的論文稱,新研究利用NextMove軟件公司開發的化學信息學工具軟件,調查了美國批準和應用的20萬個ZL,其中用到約130萬個化學反應和模型數據。通過文本挖掘,研究人員從中提取了115萬個獨特的全程反應計劃,包括反應的作用和產品,然后用一個專家系統給這些反應分類,并歸入一些知名反應類型中。結果發現,化學家們確實對某些反應類型更加偏愛,如酰胺鍵形成、脫保護反應或C-C鍵形成等。

      負責這項研究的諾華公司娜丁·施耐德及其團隊通過計算分析,揭示了化學家們所喜好的“面包和黃油”反應的消長波動。隨著藥品新戰略和新種類的演變,研究情勢也隨之發生變化。如鈴木-宮浦偶聯反應(一種構建C-C鍵的主要方法)已進入排名前列,由此導致一些傳統化學反應的運用有所下降,如合成烯烴的維蒂希(Wittig)反應,而另一些仍保持穩固地位,如格林尼亞(Grignard)反應。

      總的來看,與40年前相比,現在的藥物分子更大,有更多芳香環,更加疏水,更堅硬,反應類型也更加多樣,但傾向于更低的藥物產量。

      總編輯圈點

      研究近幾十年來的藥物研發趨勢,更像是對醫藥化學家過去的“實驗成績”做一次復檢,只不過它并非基于某一份特定的考卷,而是基于文本的“大數據分析”。這不僅可以幫助我們了解過去醫藥化學家做了些什么,還能讓我們了解人類的藥物開發正朝著怎樣的方向發展——也許醫藥化學家自己都還不知道!了解其中的演變態勢還能為今后的藥物研發打下更好的基礎,讓醫藥化學家從更廣闊的尺度上看到自己的工作具備哪些傾向性,還需要加強哪些方面。

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