生物學的眾多奧秘之一是:細胞如何巧妙地分配它復制的DNA到兩個子細胞中?一個多世紀以來,我們已知道細胞中的DNA就好比一盤意大利面條:雜亂地混合在一起的面條。當細胞分裂時,它們必須將兩米長的DNA包裝成整潔的小包裹---染色體。這種包裝是由凝縮蛋白(condensin)誘導的,但是科學家們對它的真實作用機制產生分歧。一種觀點是這種蛋白像鉤子那樣發揮作用,隨機地抓住雜亂的DNA的某個地方,隨后將這些DNA系在一起。另一種觀點是這種環形的蛋白將DNA往內擠壓,產生一種環。
在一項新的研究中,來自德國、美國和荷蘭的研究人員大為支持這種環擠壓(loop-extrusion)觀點,證實凝縮蛋白確實具有產生這種動態變化所需的馬達功能。相關研究結果于2017年9月7日在線發表在Science期刊上,論文標題為“The condensin complex is a mechanochemical motor that translocates along DNA”。
早在1882年,當時知名的生物學家Walter Flemming記錄了DNA濃縮過程。通過在顯微鏡下觀察,他看到細胞如何巧妙地組裝成束的DNA,隨后將它們分布到兩個新的子細胞中。然而,100多年來,這個過程的精確細節一直是個謎。
論文共同作者、荷蘭代爾夫特理工大學卡弗里研究所研究部主任Cees Dekker解釋道,“在細胞生物學領域,針對這個問題存在不同的觀點。近年來,凝縮蛋白擠壓成環的觀點勝出,獲得計算機模擬的支持。這種觀點是環形的凝縮蛋白抓住DNA,以一種環狀的方式擠壓DNA通過它的環狀結構。僅當這種蛋白具有馬達活性時,這才是有可能實現的。這種環擠壓觀點存在的一個問題是迄今為止,這種類型的馬達功能未被檢測到。此外,擠壓DNA環通過凝縮蛋白的環狀結構需要太多的能量,遠多于我們針對凝縮蛋白觀察到的能量消耗。”
馬達功能
在這項新的研究中,這些研究人員首次證實凝縮蛋白確實具有馬達功能。他們把在一個表面上伸展的DNA放置在適當的位置上,加入凝縮蛋白,每個凝縮蛋白攜帶著發光的量子點便于觀察。論文共同第一作者Jorine Eeftens解釋道,“我們觀察到凝縮蛋白如何沿著DNA移動。這僅當ATP分子存在時才會發生。這些結果也表明凝縮蛋白在DNA表面上邁出非常大的步伐,因而需要比之前認為的顯著更少的ATP。”
接著,這些研究人員利用發光的DNA鏈替換凝縮蛋白上的這些發光的量子點。他們再次觀察到凝縮蛋白以同樣的方式移動。因此,凝縮蛋白能夠讓一段DNA相對于另一段DNA移動,這就與DNA環形成相對應。
Dekker說,“這種確切的作用機制仍有討論的余地。不過,這一發現當然會極大地支持這種環擠壓觀點。我們還證實所需的能量比之前認為的少很多。”
這項研究代表著對細胞的基礎理解取得重大的進展,不過它對醫學研究也產生重大的影響。凝縮蛋白所在的蛋白家族,即SMC蛋白,存在的故障與德朗熱綜合征等遺傳病相關聯。在細胞分裂期間,凝縮蛋白也在染色體組裝中發揮著關鍵性的作用,這個過程發生差錯可導致癌癥。更好地理解這些過程對追蹤嚴重疾病的分子起源是至關重要的。
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