由山東圣豐種業科技有限公司、廣東省農業科學院作物研究所、山東省花生研究所、Macrogen千年基因等共同發起的中國花生基因組計劃目前已全面啟動,并在“第十一屆中國ZL高新技術產品博覽會”上舉行了盛大的簽約儀式。該項目計劃于全球范圍內首次完成對花生A基因組的全基因組測序、組裝及序列結果的注釋。
第十一屆中國ZL高新技術產品博覽會是由國家知識產權局、科學技術部、中國科學院、中國工程院、山東省人民政府共同主辦的一次科技盛會,于6月26日-28日在濟寧市曲阜孔子文化會展中心舉辦,共有27項合作項目在本次會議中成功簽約,中國工程院院士李國杰、范云六及濟寧市市長梅永紅、市委副書記崔洪剛等共同見證了這些項目的簽約。作為必將對中國農業的發展產生深遠影響的花生基因組計劃,在本次會議中得到了相關部門的廣泛關注和大力支持。
花生(Arachis hypogaea L.)是世界上重要的油料作物和優質的植物蛋白源之一,我國的花生種植面積僅次于印度,總產位居世界第一。完成花生基因組的測序及遺傳密碼解析,將對花生的遺傳育種及新品種改良具有重要的戰略意義。此外,作物種質資源是國家生存和發展的戰略性資源,作物種質資源保護是生物多樣性保護的重要內容。由中國科學家啟動中國花生基因組計劃,將有利于對我國花生種質資源的保護。
花生栽培種(AABB)是異源四倍體,基因組由A基因組和B基因組組成,采用目前的測序技術直接進行測序組裝是很困難的,容易造成序列拼接錯誤。前期研究結果表明,花生A基因組與B基因組的相似度達98%, A基因組所含的優質基因與B所含的優質基因基本是一致的。因此僅對花生A基因組進行測序即可挖掘相當數量的優質基因并開發大量分子標記,從而將研究結果應用于花生分子育種。
本項目的發起人之一廣東省農科院梁炫強教授表示:“花生全基因組測序的結果將為其遺傳改良提供重要的數據資源和平臺,有助于科研人員從分子水平了解花生的生長、發育及繁殖過程,并對花生新品種的培育以及提高花生的產量、品質和抗病性等具有重要的意義”。花生體系首席科學家禹山林研究員以及本項目的主要資助企業山東圣豐種業公司的副總裁及科研總監李洪杰也表示:“本項目僅是花生基因組研究的開始,后期我們將開展更多的花生基因組重測序和花生轉錄組測序,以及花生B基因組和AABB基因組的測序,從而深入地揭示花生的遺傳多樣性及基因表達調控模式。”
Macrogen的中國項目總監于越表示:“很多植物基因組因為重復度和雜合度較高,對全基因組的序列組裝提出了巨大的挑戰。本項目的實驗和分析工作將全部在Macrogen的標準實驗室完成,我們計劃將結合多種測序平臺來完成花生基因組的組裝,根據 Macrogen大量的全基因組項目執行經驗以及通過結合各測序平臺的優勢,我們非常有信心得出花生基因組高質量的序列圖譜”。
第十一屆中國ZL高新技術產品博覽會簽約儀式
關于千年基因:
千年基因以總部Macrogen作為強大的技術依托,主要致力于為研究人員提供最高質量標準的測序服務及相關技術支持。Macrogen集團由首爾大學于1997年成立,并于2000年成功上市,是世界領先的生物技術研發與應用企業,目前已經在亞洲、歐洲、美國等成立了多家分部。Macrogen同時擁有通過ISO9001 & ISO13485 & CLIA國際質量標準認證的大型基因組學實驗室及多種高通量測序平臺,包括4臺Roche 454 & 454+、30臺HiSeq2000、2臺MiSeq、2臺GAII、2臺ABI SOLiD、1臺Ion Torrent及幾十臺ABI 3730測序儀等。Macrogen已參與了白菜、玉米、馬鈴薯、辣椒、油棕櫚、1,000人基因組、100,000人外顯子組計劃、第一個韓國人基因組計劃、Asian Genome Road 等眾多國際項目,其豐富的項目執行經驗使各個測序平臺的優勢均能在Macrogen得到最佳體現。
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