GWAS薈萃分析發現新的乳腺癌風險位點

　　由劍橋大學研究人員領導的國際研究小組通過全基因組關聯研究（GWAS）的薈萃分析，發現了15個與乳腺癌風險有明顯關聯的新位點。這項成果于3月9日在線發表于《Nature Genetics》雜志上。

　　這個團隊匯集了超過10萬名婦女（包含病例和對照）的數據，其中幾萬個樣本已通過定制的iCOGS芯片進行了基因分型。這項研究重復了過去在70多個位點中發現的乳腺癌相關變異，并發現了15個新的位點。

　　文章的通訊作者、劍橋大學的遺傳流行病學研究人員Douglas Easton表示，這些遺傳標記不僅帶來更多信息，說明乳腺癌高風險為何遺傳以及如何遺傳，也幫助他們針對那些最需要篩查和預防的婦女實施措施。

　　“解決這個難題的下一步是深入了解遺傳變異如何讓婦女增加風險，”Easton談道。“我們肯定更多變異仍有待發現。”

　　之前的研究已經發現了一些與乳腺癌的中等至高風險相關的稀有變異，以及幾十個常見SNP。然而，盡管一直在取得進展，但在理解乳腺癌風險的遺傳可能性上仍有較大的差距。

　　為了縮小這種差距，研究人員匯集了15,748名歐洲乳腺癌患者及18,084名對照的數據。他們還融入了46,785名乳腺癌病例和42,892名對照的數據。這些樣本曾在定制的iCOGS芯片上進行了基因分型。iCOGS是一款定制的Illumina iSelect基因分型芯片，包含211,155個標記，適用于研究三種與激素相關的癌癥：乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌。

　　從千人基因組計劃獲得信息之后，研究團隊比較了1100多萬個SNP在乳腺癌病例和對照中的模式。這項分析最終鑒定出15個新位點，之前未曾與乳腺癌相關聯。

　　研究人員還深入研究了新位點上的潛在致病SNP。他們利用了ENCODE計劃產生的乳腺細胞的增強子元件圖譜，以及癌癥基因組圖譜所產生的表達數量性狀位點的模式。

　　通過這些分析，Easton及其他作者指出，新發現的位點似乎解釋了乳腺癌家族風險的2%，而分布在大約90個位點上的與乳腺癌相關的所有常見變異似乎解釋了遺傳可能性的16%。