E.coli的DNA pol Ⅰ涉及DNA損傷修復,在半保留復制中起輔助的作用。DNA polⅡ在修復損傷中也具有重要的作用。DNA polⅢ是一種多亞基的蛋白質,在DNA新鏈的從頭合成中起復制酶的作用。
復制的忠實性問題會影響到翻譯的精確性,這種忠實性主要依賴于堿基的特異性配對。據估計每個堿基對將有10-3。的概率會發生錯配,但實際的錯配率只有10-8~10-10,即每1000個細菌復制周期中,每個基因組只產生一次錯誤。DNA多聚酶能增加互補堿基的特異性,該特異性主要表現在以下兩方面:
①能夠檢查進入的堿基是否和模板互補,這時通過一個匹配的化學特點加以識別,這是合成前的一種預防措施,稱為合成前( presynthetic)錯誤控制;
②在新的堿基加到鏈上以后,檢查堿基是否配對。若發生錯配,將會把剛加上去的錯誤堿基切除掉,這是校正控制( proofreading)。
細菌的三種DNA聚合酶都具有3 7硝’外切活性,逆DNA合成方向進行加工,提供校對功能。在鏈的延伸階段中,一個核苷酸進人生長鏈的末端,形成鍵,該酶就向前移一個堿基對,準備下一個堿基對的進入。若一個錯誤產生了,這個酶就向回退,切除最后加進來的這個堿基,產生一個位點,然后被正確的堿基取代。
不同DNA多聚酶聚合和校正之間的關系是不同的。有時,這些活性是由相同的蛋白質亞基產生的,但有時它們又還有不同的亞基。一個錯誤堿基的排除實際上是十分復雜的,因為這種切除反應是由不同位點催化的。