近紫外CD分析蛋白質三級結構
蛋白質中芳香氨基酸殘基，如色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)、苯丙氨酸(Phe)及二硫鍵處于不對稱微環境時，在近紫外區250～320nm，表現出CD信號[8]。另外芳香氨基酸殘基在遠紫外光譜區也有CD信號；二硫鍵的變化信息反映在整個近紫外CD譜上。實際的近紫外CD光譜形狀與大小受蛋白質中芳香氨基酸的種類、所處環境(包括氫鍵、極性基團及極化率等)及空間位置結構(空間位置小于1nm的基團形成偶極子，雖然這對CD光譜的貢獻不是很明顯)的影響。近紫外CD光譜可作為一種靈敏的光譜探針，反映Trp、Tyr和Phe及二硫鍵所處微環境的擾動，能應用于研究蛋白質三級結構的精細變化。總的來說，在250～280nm之間，由于芳香氨酸殘基的側鏈的譜峰常因微區特征的不同而改變，不同譜峰之間可能產生重疊。Krell[9] 等研究了來自Streptomyces coelicolor的野生型與突變型dehydroquinase 的遠紫外與近紫外CD光譜，結果表明，野生型與突變型dehydroquinase 的遠紫外CD光譜幾乎沒有發生變化，即二級結構沒有發生明顯變化，而其近紫外CD光譜卻發生較為明顯的變化，即較之二級結構，突變型dehydroquinase 的三級結構可能發生了較為明顯變化。