毛細管電泳的主要特點是柱效高（N＞105～106）、分析時間短，所用樣品量和試劑消耗少，操作模式多，更容易改變背景電解質，在線檢測和自動化，使其成為同 HPLC 互補的分析技術，在生命科學領域顯示出很好的應用前景。對肽和蛋白質的分析已經從對標準樣品混合物的初步優化研究朝著應用方向發展，如定量測定重組蛋白質及其污染物，CE／MS 用于蛋白質的表征，CE-免疫分析，配體-生物分子結合研究以及酶活性分析。在基因工程、生化、臨床、天然產物的分析方面已得到了較廣泛的應用，成為基因工程領域中對重組蛋白生產的監控、下游處理和最終產物分析的最有吸引力的技術之一。在臨床化學上用于內源性肽的分離、血紅蛋白病診斷等。在食品分析中用于奶蛋白、大豆水解產物等的分析。
來源：《蛋白質技術手冊》
| 實驗材料 | 蛋白質溶液 |
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| 儀器、耗材 | 毛細管電泳儀 |
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| 實驗步驟 |
「操作條件選擇」具體見「其他」
1. 毛細管電泳柱的制備：清洗、反應與柱平衡；
2. 移開進樣端的緩沖溶液池，換上樣品管；
3. 使用低壓或電遷移方式進樣；
4. 再換上緩沖溶液池；
5. 施加分離所需的電壓。 進行電泳分析。 展開 |
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| 注意事項 |
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| 其他 |
操作條件選擇
1. 毛細管尺寸
最常用的為內徑為 25～75 um 熔融石英毛細管，從分析時間上考慮，毛細管應盡可能得短，常用的有效長度（進樣端至檢測窗之間的距離）為 20～50 cm。
2. 高壓電源
HPCE 所用的高壓電源要能提供 30 kV 的直流電壓和 200～300 uA 的電流。欲獲得遷移時間的高重現性，須使電壓穩定在 ±0.1％。電源極性應能切換。恒壓方式最為常用，當進行等速電泳或溫度不能很好控制時，則應采用恒流或恒功率方式，從而獲得恒定的遷移時間。
3. 溫度控制
由于進樣和遷移時間決定于溶液的黏度，應將溫度控制在 ±0.1℃，這對于操作的重現性是很重要的。采用液體恒溫較氣體恒溫更為有效。
4. 進樣量
樣品區帶長度應該小于毛細管長度的 1％～2％。樣品超載會使峰變寬，峰形畸變。
5. 進樣方式
采用流體力學的方式，進樣量基本不受樣品基質的影響；電遷移進樣時，進樣量決定于每一個組分的電泳淌度，應注意歧視效應帶來的影響。
6. 樣品預濃縮
在等速電泳和等電聚焦分析中，樣品在穩態時可被濃縮許多倍，有利于紫外檢測分析，但在毛細管區帶電泳中，樣品區帶會展寬，因此常需要采用樣品堆積、等速電泳和色譜法，通過對低電導介質的電動進樣或壓力進樣來達到樣品堆積的目的。非連續的緩沖系統被用于柱上低濃度樣品的濃縮，進樣體積較常規方法要大 30 倍。采用整個毛細管進樣技術，樣品可以濃縮 400～1000 倍。
瞬態等速電泳濃縮既可采用典塑的等速電泳電解質系統，也可以在樣品中補充高淌度的與分離的樣品電荷符號相同的離子（co-ion）， 而電解質的同號離子具有低淌度。在電泳過程中，由等速電泳模式逐漸轉變為區帶電泳模式。
色譜法預濃縮是先將樣品捕集于一反相或親和填料，然后用少量溶劑洗脫下來，同時使樣品得到凈化，如蛋白 G 和結合亞胺二乙酸金屬螯合功能團的固定相。采用很低濃度的緩沖液和孔徑非常小的聚丙烯酰胺凝膠進行濃縮，樣品中的水擴散入凝膠，鹽分同時被脫除，可適用于少量樣品的處理。 展開 |
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