近日,爭奪美國國防部的DNA分析挑戰賽100萬美元大獎的科學家表示強烈抗議。數位排名前10位的競爭者指責利用國防威脅降低局(DTRA)的算法規則和評分標準,來檢測生物恐怖威脅的DNA樣本,結果含糊不清。提交期7月14日截止,103個“解決方案中”的3個——包括個人和團隊——將參加最后的角逐,現在他們的計算機程序將在最后一輪評價中等待最終得分。
“他們組織競爭的方式和評分方式都非常令人難以接受。”英國倫敦帝國理工學院生物信息學博士生David Ainsworth說,他的團隊仍在為爭取獎金而努力。
組織者承認這項比賽非常艱難,稱要算出在哪里設置障礙非常棘手。“我們不想將門檻設置得太高,而導致沒有人能贏得比賽;但也不想將門檻設置得很低,讓200人都能并列第一。”該挑戰項目負責人Christian Whitchurch說。事實上,三個團隊的成功已經讓他樂觀地認為,最終的產物將廣泛地應用于政府部門。
但是一些參與者說,評分系統不必那么復雜,也沒能反映出他們的工作質量。“根據我所理解的比賽目標,我認為讓最好的算法勝出是不可能的。”美國馬里蘭州巴爾的摩市約翰斯·霍普金斯大學生物信息學家Steven Salzberg說。他沒有參與這項比賽,但他實驗室的兩名科學家—— 一個博士生和一個生物信息學工程師——未進入決賽。
今年1月,DTRA設置了該挑戰賽,以期盡快找到一種更快、更準確的方式在原始DNA基礎上識別物種和基因的技術。因為DNA測序技術越來越快捷、便宜,DTRA希望挑戰會激發一個高度精確的程序的誕生,以便在1小時內檢測出具有潛在危險的 DNA樣本——這將是對人類現有能力的一個巨大提升。
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