在紫外線下，黃曲霉毒素b1,b2發藍色熒光，黃曲霉毒素g1,g2發綠色熒光.黃曲霉毒素的相對分子量為312-346.難溶于水，易溶于油，甲醇，丙酮和氯仿等有機溶劑，但不溶于石油醚，己烷和乙醚中.一般在中性溶液中較穩定，但在強酸性溶液中稍有分解，在ph9-10的強堿溶液中分解迅速.其純品為無色結晶，耐高溫，黃曲霉毒素b1的分解溫度為268℃紫外線對低濃度黃曲霉毒素有一定的破壞性.
