中醫分類：中醫認為結腸炎大多為濕熱壅結、脾腎陽虛、氣血兩虛、氣滯血瘀、飲食失調、勞累過度、精神因素而誘發。
（1）腹瀉型：泄瀉、大便不成型、腹痛、、粘液便、膿血便、腸鳴及排便不暢、不盡、里急后重，伴有消瘦、全身乏力、惡寒、頭昏等癥。（此型最易治療，一般20-60天可根治）
（2）便秘型：大便秘結，如羊屎樣，排便不暢、不盡，甚則數日內不能通大便，有一部分患者原有長期腹瀉史，伴有腹痛、消瘦、口干、腹脹貧血等癥，易惡變。（治療一般30-60天）
（3）腹瀉便秘交替型：大便時干時稀、時有粘液、便血，伴有腹痛、腹脹等癥。（治療一般20-60天）慢性結腸炎屬自身免疫性疾病，可能與某些病原體感染、遺傳基因及精神因素有關，大多病程長，病情纏綿難愈，尤其是潰瘍性結腸炎，大便帶粘液和膿血，患者十分痛苦，這些癥狀不是通過調理脾胃、健脾益腸就能解決的，而應寒熱通補、健脾和中、調理陰陽，就能從根本上治療腸炎。
西醫分類：根據致病原因分為特異性，即有明顯原因的結腸炎和非特異性即致病原因不明的結腸炎。
特異性結腸炎常見的有痢疾、結腸結核、阿米巴痢疾、放射性直腸炎等；
非特異性結腸炎有潰瘍性結腸炎、克隆氏病等。而臨床所稱的慢性結腸炎多指非特異性的。