雖然我們所說的種子脫粒機和一般農用脫粒機有所區別，我們的產品主要是水稻、小麥、玉米等作物脫粒試驗用的，脫粒程度可作為育種專家評價作物成熟度及品質的依據，但兩者工作原理大體相同，都需要做好維護工作，尤其是在機器閑置的時候，需要做好以下工作：
1.試驗完要記得將機器內外塵土、污垢；莖稈、碎殼等雜物清理干凈。
2.將傳動皮帶輪、脫粒機滾筒等未涂漆的金屬零件表面涂上防銹油，對機架、罩蓋等磨去漆皮的地方補刷油漆。
3.卸下電機、傳動皮帶等附件，并連同其它附件一起妥善保管。
4.將機器放置在干燥的庫房，有條件時最好用枕木墊起，并蓋上油布，以免機器受潮、曝曬和被雨淋。
5.在下一次使用前，應對種子脫粒機進行一次全面的清掃和檢修，應打開全部軸承座蓋，清除油污和雜物，重新上足潤滑油，并更換修整變形、磨損的零件。更換滾筒紋桿時，應注意按重量分組，根據重量加平衡墊進行安裝，以保持滾筒平衡。更換個別紋桿時，不但要注意平衡，而且還要通過適當調整墊片厚度來使滾筒在最小的徑向跳動下運轉。零件更換、修理后，各連接螺栓都必須按要求緊固牢靠。
6.種子脫粒機在搬運過程中，要注意避免碰撞，做到輕拿輕放，擺放穩定。