1、檢測方法：目前已有一種WHO標準，報告結果建議使用國際單位（1U=1.21ng)
2、樣本純化的AFP，如為標準品最好以凍干粉的形式在4-8°C貯存，或加入正常血清后進行冷凍貯存。4-8°C時樣本可穩定一周，-30°C可貯存更久。
3、注意假陽性：在經新鮮細胞治療或干細胞抽提后，可因合成直接針對外來抗原的抗體而出現交叉反應，AFP可出現假陽性升高。
4、對于混合性細胞腫瘤的監測要使用不同腫瘤標志物：在不同細胞群組成的腫瘤中（睪丸復合腫瘤），AFP濃度的下降僅反映產生標志物的細胞類型的應答，這可能與其他細胞類型不同。因此，對于混合性細胞腫瘤的監測要使用不同腫瘤標志物，入對睪丸腫瘤使用AFP和HCG。這是生化學評價不同細胞類型反應的僅有的方法。
5、其他接受化療和（或）放療的胚胎細胞腫瘤、肝癌病人，由于腫瘤溶解綜合征和腫瘤細胞急性破壞引起的AFP釋放，AFP的濃度可出現短暫的升高。經兩個化療周期后，血漿AFP半衰期高于7d，或HCG半衰期高于3d的病人比那些腫瘤標志物清除率正常的生存率要顯著降低。建議將這些病人視為高危人群，應給予更為積極的治療。在未經治療的病人中，晚期時AFP濃度可能下降，一般為腫瘤壞死所致。