第一天：接種與培養
接收標本后，立即對標本進行編號,然后在LIS系統中簽收。
將標本分別接種于血瓊脂平板和麥康凱瓊脂平板，置于5％～10％ CO2環境中35℃培養18～24h,觀察細菌生長情況。
疑似淋病患者標本，應接種淋病奈瑟菌瓊脂平板,置于5％～10％ CO2環境中35℃培養18～24h,觀察細菌生長情況。
疑似軟下疳的患者（杜克嗜血桿菌感染），應接種選擇性巧克力瓊脂平板,置于5％～10％ CO2環境中35℃培養18～24h,觀察細菌生長情況。
第二天：觀察菌落
觀察各種固體培養基上的細菌生長情況及其處理, 并將其記錄在程序單上（日期、涂片、分純、上機、手工生化,、藥敏等）。
血瓊脂平板：打開血瓊脂平板首先觀察是否有細菌生長，如果有細菌生長，初步確認是陽性菌還是陰性菌，挑取可疑菌落涂片染色進一步確認。如果沒有，則繼續培養24h。
杜克雷嗜血桿菌在巧克力瓊脂平板：觀察巧克力瓊脂平板是否有細小、無色透明似水滴狀的菌落。如果沒有菌生長，則繼續培養24h。
淋病奈瑟菌在淋病奈瑟菌瓊脂平板上形成較小、光滑、凸起、無色透明或呈灰白色的菌落，作氧化酶試驗，若陽性，則進一步鑒定；若無細菌生長，則繼續培養24h。
鑒定：根據菌落觀察和涂片結果確認為陽性或陰性菌后，選擇合適的鑒定卡片，挑取菌落制成菌懸液，用微生物鑒定儀、傳統生化試驗、MALDI-TOF-MS進行鑒定。
第三天：結果報告
陽性結果：培養出的病原菌，應進行鑒定、藥敏試驗，報告病原菌名和藥敏試驗結果。
若外生殖道檢測出腸桿菌科、葡萄球菌屬、腸球菌屬等則為正常菌群。
陰性結果：男性尿道標本、宮頸分泌物、女性陰道分泌物經培養兩天,仍無病原菌生長者,報告“培養兩天無細菌生長” 。
無菌部位標本細菌培養2日未檢出細菌，報告為“培養兩天無細菌生長”。
淋病奈瑟菌培養陰性，報告為“未檢出淋病奈瑟菌”。
厭氧菌培養參見《厭氧菌檢驗標準操作規程》
結核分枝桿菌培養參見《分枝桿菌屬檢驗標準操作規程》。
結果解讀
人體的生殖道有多種病原體,主要包括:淋病奈瑟菌、念珠菌屬、杜克嗜血桿菌、陰道加特納菌、沙眼衣原體、人乳頭瘤病毒、皰疹病毒等。
通常外生殖道標本檢出腸桿菌科、金黃色葡萄球菌、腸球菌屬等無臨床意義。
內生殖道膿腫或抽吸液標本分離出腸桿菌科、葡萄球菌屬、腸球菌屬等及厭氧菌可考慮為病原菌。
從產婦患者（在懷孕35～37周時）的陰道和會陰標本分離B群鏈球菌（無乳鏈球菌）很重要，因為這種微生物可引起嚴重的新生兒膿毒癥和新生兒腦膜炎。
產單核細胞李斯特菌在生殖道標本中容易被誤認為類白喉棒狀桿菌，可引起先兆流產，應引起臨床注意。
軟下疳是由杜克雷嗜血桿菌（又稱軟下疳桿菌）引起的一種性病，臨床以急性疼痛性生殖器潰瘍，局部淋巴結腫大、化膿，形成橫痃為特點。杜克雷嗜血桿菌不同于流感嗜血桿菌，它是一種呈鏈狀或長絲狀的革蘭陰性桿菌，而流感嗜血桿菌是革蘭陰性小球桿菌，應引起檢驗人員的注意。
陰道加特納菌：革蘭陰性、細長、多形狀桿菌。兼性厭氧菌，在綿羊血瓊脂平板上生長的菌落為細小、露珠狀，有狹窄的綠色環出現，在含人血瓊脂平板上有β溶血。