版納植物園葉綠體比較基因組學研究取得進展

　　樟科油丹屬樹種木材質優，國際市場上的商品名為“medang”，和楠木樹種的親緣關系較近。以往的分子系統學研究表明油丹屬為復系類群，但與潤楠屬、鱷梨屬和楠屬等的系統關系尚不明晰。

　　近日，中國科學院西雙版納熱帶植物園生物多樣性研究組以分布于印度南部的油丹模式種Alseodaphne semecarpifolia Nees和分布于我國云南的極危種細梗油丹（A. gracilisKosterm）、黃連山油丹（A.huanglianshanensis H. W. Li & Y. M. Shui）為實驗材料，通過二代測序技術完成了葉綠體基因組全覆蓋測序。

　　通過比對發現，樟科油丹屬植物的葉綠體基因組大小約為153kb，比近緣屬潤楠屬、鱷梨屬及楠屬植物的葉綠體基因組大，比土楠屬植物的葉綠體基因組小。差異主要源自連接單拷貝區和反向重復區的兩個基因ycf1和ycf2。兩基因的長度變化造就了反向重復區的縮減和擴張，直接影響葉綠體基因組的大小。在油丹的整個葉綠體基因組上，聚集突變位點最多的區域分別是trnG-UCC、ndhF-rpl32、rpl32-trnL和ycf1，而傳統系統分析序列上的突變位點則較為少見，是先前用于樟科系統學研究的葉綠體基因片段在種屬級別上缺乏分辨力的原因。利用葉綠體基因組序列構建的十二種樟科植物的系統進化樹進一步確認了樟科內部由油丹屬、楠屬、鱷梨屬和潤楠屬構成的單系屬群。

　　相關研究成果以Complete plastid genome sequences of threetropical Alseodaphne trees in the family Lauraceae為題發表在Holzforschung上。該研究得到了中科院東南亞生物多樣性研究中心和“西部之光”計劃等的資助。

　　圖2.黃連山油丹（Alseodaphnehuanglianshanensis H. W. Li & Y. M. Shui）。