新生兒肝脾腫大的原因是很多的。一部分是肝臟本身的原發病或局部疾病。大多數是全身性疾病（其中有些病因不明）累及肝臟的結果。可分為感染性或非感染性兩類。一般通過病史、體格檢查、臨床表現、血象或其他有關實驗室檢查等可得出病因診斷。當肝、脾均腫大而其他診斷指標又缺乏時，常應考慮肝臟代謝疾病，如果肝臟明顯腫大而脾臟未腫大，又不能用心力衰竭、血液病或是感染性疾病證明者，應考慮是否由肝糖原積累病、肝腫瘤等疾病。診斷最困難的是全身癥狀缺乏，肝腫大是惟一體征，或伴有脾腫大而患兒其他情況又似乎正常。對這種患兒必要時使用肝穿刺組織病理檢查以明確診斷及時給以合理治療。