1、高壓恒流泵：
正相系統：使用流動相保存即可。
反相系統：運行有機相的泵，直接保存即可。運行緩沖鹽或純水的泵，首先純水1mL/min沖洗泵20min，然后甲醇1mL/min沖洗20min即可。
注意：溶劑過濾頭必須放置于液面以下，且假期期間必須保存在有機試劑中。
2、色譜柱：
正相系統：首先流動相沖洗色譜柱，然后使用色譜柱建議的試劑保存即可。
反相色譜柱(C18為例)：首先使用甲醇/水(10/90)的流動相1mL/min沖洗30min，然后純甲醇1mL/min沖洗30min即可。
3、檢測器：
正相系統：使用流動相沖洗檢測池即可。
反相系統：檢測池中為有機相和水時，直接使用甲醇1mL/min沖洗檢測池10min即可。檢測池中有緩沖鹽時，首先用純水1mL/min沖洗檢測池10min，然后用甲醇1mL/min沖洗10min即可。
4、自動進樣器：
正相系統：灌注5次后，使用流動相填充液體管路。
反相系統：洗液為純水時，將洗液更換為甲醇/水(50/50)，灌注5次，然后用甲醇填充管路。洗液為有機試劑時，灌注排氣泡5次，使用甲醇填充管路。
5、手動進樣閥：
正相系統：使用手動進樣閥配套的洗閥工具，使用流動相分別沖洗進樣閥的load和inject位置各3次，每次1mL，進樣針同樣使用流動相洗3次后保存，然后使用進樣閥配套的紅色蓋子蓋住進樣閥以防止灰塵進入。
反相系統：首先使用純水在inject和load位置各洗3次，每次1mL，然后使用甲醇在inject和load位置各洗3次，每次1mL，進樣針同進樣閥清洗步驟，然后使用進樣閥配套的紅色蓋子蓋住進樣閥以防止灰塵進入。
6、關機：
妥善處理所有的樣品及廢液。
關閉所有的儀器電源及電腦，如有總電源，可關閉總電源