有許多種操縱基因用足跡法定位并進行了DNA序列分析,將影響阻遏物結合的操縱基因突變的特性加以描述,它們最重要的特征是反向重復(inverted repeat)或毗鄰重復(near repeat)。
例如,用核酸酶消化DNA與lac阻遏物的復合體,分離得到一個乳糖操縱基因片段,由24bp組成,其中約有16個是與二重對稱軸有關,以第11位堿基為中心,其結構如圖1。操縱基因的序列測定出來后就使人們了解到這種對稱能夠使阻遏蛋白多聚體的兩亞基可以同時結合在操縱基因上,從而阻礙了轉錄的發生。
