CIDP的臨床表現與AIDP相似，免疫治療有效，提示該病有免疫介導的發病機制，但CIDP的機制及其與AIDP的關系并不清楚。在CIDP中，自身免疫反應性T細胞和B細胞發生分化，引起周圍神經的自身免疫性損害，分子模擬可能是重要的病理啟動機制。在AIDP的研究中，發現了一系列周圍神經抗原和相關的自身抗體，但CIDP的分子模擬機制在分子靶點上缺少足夠的證據。
但分子模擬假說不能解釋CIDP的全部免疫學和病理學改變。CIDP似乎是一種器官特異性的免疫介導的疾病，起源于細胞免疫反應和體液免疫反應對特征未完全確定的周圍神經抗原的協同相互作用。