急性血源性骨髓炎過去死亡率很高。但近年來對此病有進一步的認識，早期診斷和積極治療，適當抗菌藥物與綜合療法的應用，死亡率已大為降低。常見的并發癥為：
1.化膿性關節炎。
2.病理骨折。
3.肢體生長障礙
如骨骺破壞，肢體生長長度受影響，患肢變短；或因骨骺附近炎癥，血液供給豐富，使骨骺生長較快，患肢反而稍長。有時亦因骨骺部分受累形成畸形生長，如膝內翻或外翻等。
4.關節攣縮及強直。
5.外傷性骨髓炎
常因感染而有骨折延遲連接和不連接，以及關節活動受限等。
