庫克薩基病毒（Coxsackie virus）是小RNA病毒科、腸道病毒屬的一種。因最初于美國的庫克薩基地區被分離到而得名。庫克薩基病毒引起的感染，表現復雜多變。1948年美國紐約州庫克薩基鎮發生脊髓灰質炎流行﹐研究人員將肌松弛性癱瘓病兒的糞液接種新生小白鼠﹐分離出一種病毒（A組庫克薩基病毒）。1950年又分離出B組庫克薩基病毒。二者之間的區別是在新生小白鼠中引起不同的病理改變。庫克薩基病毒感染在世界很多國家傳播流行。在中國也較常見﹐南方更為多見。在某些地方呈地方性流行﹔某些型的流行還有周期﹐有數年一次的傾向。病人及帶病毒者均為傳染源﹐主要經腸道傳播﹐但感染初期也可經呼吸道傳播。