咖啡基因組咖啡因、香氣和風味的完美混合

　　研究人員已經對咖啡的基因組進行了測序，從而揭示了植物中咖啡因的演化并對這一大眾飲料的廣受歡迎的風味和香氣提出了見解。該基因組序列還給科學家們一種用來快速定位在具體咖啡染色體上特定基因的工具，這是一種可幫助他們改善咖啡育種、加速研發新咖啡品種并增加咖啡植物對像氣候變化及害蟲等環境應力抵抗力的資源。France Denoeud及其同事用先進的測序技術來獲取一個中果咖啡—俗稱羅布斯塔咖啡—的基因組草圖，它大約占全球生產的30%的咖啡來源。

　　中果咖啡是兩種最重要的市售咖啡中的一種--另一種是阿拉比卡咖啡，后者因為它的酸味較輕(這是咖啡因濃度較低的結果)使得它占了世界其余咖啡生產中的大多數。為了確定中果咖啡的獨特基因族，Denoeud等人對來自咖啡、葡萄樹、番茄及擬南芥等植物的蛋白序列運行了比較基因組學軟件。他們在這些植物中確認了1萬6000多個基因，它們源自一個最后共同祖先的某單一基因。研究人員說，進一步的分析揭示了對咖啡基因獨特的有價值的適應性變化，其中包括在抗病基因及產生咖啡因基因中的適應性變化;與咖啡的咖啡因產生有關的酶則進行了獨立于那些在可可和茶中的酶的適應性改變。相較于擬南芥——它有一個亞油酸基因，后者是香氣和口味的一個重要促成因子——咖啡有6個亞油酸基因。在一則相關的《視角》文章中，Dani Zamir突出介紹了將咖啡基因組轉變成為咖啡培育新工具的重要性，尤其是在全球咖啡類植物多元性下降的時候。Zamir說，作為這一過程的一部分，科學家們必須分享(像香氣及風味等特征的)表型數據，這樣，基因序列能被清晰地與其所希望的背后的表型聯系起來。Zamir說，這一努力對確保咖啡類植物品種中的變異的持續存在是至關重要的，而這將轉而幫助減輕不穩定氣候及植物疾病對這一作物的影響。