近日，一項刊登在國際雜志Nature Cell Biology上的研究報告中，來自歐洲分子生物學實驗室等機構的科學家們通過研究開發出了一種新方法，其能夠在單細胞水平下揭示骨髓的三維組織架構，由于骨髓中含有負責機體終生血液產生的造血干細胞，相關研究結果或有望幫助研究人員深入研究多種血液癌癥發生的分子機制。
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研究者表示，這種新方法能幫助我們對復雜器官的特性進行分析，研究人員重點對小鼠的骨髓進行研究，其骨髓中含有產生畢生血液的造血干細胞，由于會影響干細胞和維持血液產生的能力，如今科學家們非常有興趣利用骨髓環境來作為靶向治療白血病的新型靶點。研究者Chiara Baccin說道，截至目前為止，我們并不清楚不同類型的細胞是如何在骨髓中進行空間組織，以及其又是如何彼此相互作用的，我們所開發的新方法就能夠幫助揭示細胞的組成，即三維組織架構，以及細胞之間是如何進行相互作用的，文章中，研究人員鑒別出了此前未知的細胞類型—生境細胞（niche cells），其或許對于造血干細胞的調節非常重要。
為了理解骨髓中哪些細胞會影響干細胞的功能，研究人員將單細胞和空間轉錄組學技術與新型計算機技術相結合，通過分析單一骨髓細胞中的RNA內容物，研究人員鑒別出了32種不同的細胞類型，包括非常罕見和此前未知的細胞類型；研究者認為，這些罕見的生境細胞能在骨髓中建立一種特殊的環境，這對于干細胞的功能和新型血液和免疫細胞的產生都非常重要。
利用新型的計算機方法，研究人員并不僅僅能夠在3-D模式下確定骨髓中不同細胞類型的組織架構，還能夠預測不同細胞之間所發生的相互作用，本文研究提供了首個證據表明，組織中的空間相互作用或能根據基因組數據為基礎進行計算推導；研究者Lars Steinmetz表示，我們的數據庫對于世界上任何實驗室都是開放的，這或許有助于完善體內的研究；我們所開發的新方法能在多種組織中使用，用來確定組織中細胞的3-D架構；如今這種方法也能被用來研究人類疾病的復雜病理學機制，目前研究人員還能利用該方法來研究諸如白血病等血液疾病。（