病原體結合的分子伴侶免疫原性很強，在宿主體內能誘發產生某些免疫疾病，如結核，Ieprosy，Legionnaire's病，Iyme病，Q熱（Q fever）等（Schoel 1994）。而分子伴侶本身的變化，如cpn10的表達水平下降，可能與全身性致命性線粒體疾病（Agsteribbe 1993）有關。因而，對分子伴侶在各種病理現象中的作用的研究是非常必要的。
