凝膠色譜法又稱體積排阻色譜法，使用水溶液流動相的稱為凝膠過濾色譜，使用有機溶劑流動相的稱為凝膠滲透色譜。凝膠色譜的固定相是多孔物質，如多孔凝膠、交聯聚苯乙烯、多孔玻璃及多孔硅膠等。試樣是按照其中各組分分子大小的不同而分離的。大于填料微孔的分子，由于不能進入填料微孔，而直接通過柱子，Z先流出柱外，在色譜圖上Z早出現，小于填料微孔的組分分子，可以滲透到微孔中不同的深度，相對分子質量Z小的組分，保留時間Z長。
凝膠色譜與凝膠層析是否一樣？
基本上是一致的只是固定相存在差異。凝膠色譜法又稱分子排阻色譜法。凝膠色譜主要用于高聚物的相對分子質量分級分析以及相對分子質量分布測試。
凝膠層析又稱分子篩過濾、排阻層析，操作條件比較溫和，可在相當廣的溫度范圍下進行，并且對分離成分理化性質的保持有獨到之處。
兩者的共同點是都不需要有機溶劑。凝膠色譜色譜一般用在HPLC等分析場合。而凝膠層析一般用在制備的時候。
凝膠凈化柱和凝膠色譜柱是一回事嗎?
原理是一回事，都是排阻色譜。 但是前者是制備柱，對大量樣品進行分離，柱子口徑大，一般要有切割承樣的尾接裝置；后者是分析柱，主要目的是對小量樣品進行分析，柱子直徑小，一般還有柱溫箱，對泵的穩定性要求高，必須接檢測器。