現已確定其為由1213個氨基酸組成的單鏈糖蛋白,分子量155kDa,既有長桿狀部分,也有球形區域。新近用透射電鏡檢查發現,H因子的影象為一長而柔順的分子。伸長型分子長49.5nn,橫截直徑為3.4mm但大多數不呈線型而呈折疊狀,因此分子的實際長度僅為伸展型的一半,但其構象則呈多樣化。通過園二色譜分析表明,H因子既無α螺旋也無β折疊,借二硫鍵維持其功能活性的構象。