黃體功能不全的診斷可以根據基礎體溫、血孕酮測定和內膜活檢。這類患者的基礎體溫是雙相的，但是上升和下降緩慢，上升幅度小于0.3℃，持續時間僅9～10天，有時卵泡期延長。基礎體溫上升第8天，血孕酮低于10毫微克/毫升。以往一般以月經第21～22天作內膜活檢，內膜時相少于正常2天以上為診斷標準，現在發現部分臨床診斷黃體功能不全的患者經腹腔鏡檢查為未破裂卵泡綜合征。因此本病的確診還應該結合B超和腹腔鏡檢查。
