分離包涵體并復性蛋白質的操作步驟并不復雜,從破碎細胞開始,然后將細胞勻漿離心,回收包涵體后,加入變性劑溶解包涵體,使之成為可溶性伸展態,再通過透析等除去變性劑使表達產物折疊恢復天然構象及活性。
但在實際研究中發現,在體外折疊時,蛋白質分子間由于存在大量錯誤折疊和聚合,復性效率往往很低。究其原因,蛋白質的立體結構雖然由其氨基酸順序決定,然而伸展肽鏈折疊為天然活性結構的過程還受到周圍環境的影響。