Ricin由兩個肽鏈以二硫鍵共價相連接，作為糖蛋白，Ricin含有共價結合的糖分子，糖的主要組成是甘露糖、葡萄糖和半乳糖。蓖麻毒蛋白的一級結構分析已由Funatsu等人完成。 [11] 兩條多膚鏈分別稱為A鏈（Ricinchain A，RTA）和B鏈（Ricinchain B，RTB）。RTA是活性鏈，也是是毒性鏈，是一種糖苷酶，相對分子質量約為31000。RTB是結合鏈，有凝集素的活性，相對分子質量約為34000，B鏈上含有兩個半乳糖結合位點，能與細胞上含半乳糖的糖蛋白或糖脂結合。兩者間由二硫鍵連接。RTA和RTB都有糖基化的側鏈。蓖麻毒素的一級結構分析己由Funats等完成。結果顯示：A鏈含有約263個氨基酸殘基，第10個殘基Asn為糖基化部位，接有（G1cNAc）2（Man）4寡糖鏈。RTA 是由267個氨基酸組成的球形蛋白，含有8個α螺旋和8個β轉角和一些無規則卷曲等構象單位，活性中心為Arg180；RTB 是由262個氨基酸組成的啞鈴形蛋白。通過生化和突變分析，證明RTB至少有3個半乳糖結合位點，可與細胞膜上的糖，如半乳糖和N-乙酰多巴胺形成氫鍵。RTA的Cys259和RTB的Cys4 由二硫鍵結合，借助RTB的攜帶作用而使RTA進入細胞發揮其毒性。不同蓖麻及其變種的毒蛋白，其氨基酸序列不完全相同。Ramesh等分離出2種不同的毒蛋白Ricin D和Ricin E，而Cawley等分離出3種不同的毒蛋白Ricin1、Ricin2和Ricin3。這些蛋白的等電點從5.9到8.8不等。