初步診斷后應立即停用抗菌藥物，如病情需要則應該用很少誘發本病的抗菌藥物。輕癥病例停用抗菌藥物后可自愈。病情較重，大便中有假膜者則宜用萬古霉素，500～2000mg/d，分4 次口服。甲硝唑適用于缺乏萬古霉素或萬古霉素治療后的復發病例，用法：600～1200mg/d，分2～3 次口服，療程均為7～10 天。
