立克次氏體目分為立克次體科和無形體科以及全孢菌科。立克次體科分為立克次體屬和東方體屬，前者主要有普氏立克次體和立氏立克次體，后者主要有恙蟲病立克次體。無形體科包括無形體屬、埃立克體屬、埃及小體屬、考德里體屬、新立克次體屬、沃爾巴克體屬。無形體科主要有邊緣無形體，中央無形體，鼠埃立克體等。全孢菌科含有全孢螺菌屬。
