1．尿堿化劑可減少本品在尿中的溶解度，導致結晶尿和腎毒性。
2．氟哌酸膠囊與茶堿類合用時可能由于與細胞色素P450結合部位的競爭性抑制，導致茶堿類的肝清除明顯減少，血消除半衰期(t1/2?)延長，血藥濃度升高，出現茶堿中毒癥狀，如惡心、嘔吐、震顫、不安、激動、抽搐、心悸等，故合用時應測定茶堿類血藥濃度和調整劑量。
3．環孢素與氟哌酸膠囊合用，可使前者的血藥濃度升高，必須監測環孢素血濃度，并調整劑量。
4．氟哌酸膠囊與抗凝藥華法林同用時可增強后者的抗凝作用，合用時應嚴密監測患者的凝血酶原時間。
5．丙磺舒可減少本品自腎小管分泌約50%，合用時可因本品血濃度增高而產生毒性。
6．氟哌酸膠囊與呋喃妥因有拮抗作用，不推薦聯合應用。
7．多種維生素，或其他含鐵、鋅離子的制劑及含鋁或鎂的制酸藥可減少本品的吸收，建議避免合用，不能避免時在本品服藥前2小時，或服藥后6小時服用。
8．去羥肌苷（didanosine,DDI）可減少本品的口服吸收，因其制劑中含鋁及鎂，可與氟喹諾酮類螯合，故不宜合用。
9．氟哌酸膠囊干擾咖啡因的代謝，從而導致咖啡因清除減少，血消除半衰期(t1/2?)延長，并可能產生中樞神經系統毒性。