蛋白酶3(PR3)是抗中性粒細胞胞漿抗體(ANCA)的主要靶抗原之一，與ANCA結合形成ANCA的胞漿型抗體—抗蛋白酶3抗體，而ANCA是針對中性粒細胞和單核細胞胞漿蛋白的自身抗體。抗蛋白酶3抗體是活動性肉芽腫性血管炎(Granulomatosis with Polyangiitis, GPA)及微動脈炎的特異和敏感的標志抗體，與肉芽腫性血管炎的診斷和疾病活動密切相關。用間接免疫熒光法(IIF) 檢測抗PR3抗體可產生典型的胞質型熒光，也可以采用酶聯免疫吸附法（ELISA）檢測。
