小腸外瘺的死亡率為10%～20%，在其預后因素中，患者的年齡、腸外瘺的病因、腹腔感染、瘺口的部位和數目、腸液引流量的多少均是影響其預后的因素。如70歲以上的小腸外瘺死亡率達62%；高流量瘺的死亡率超過20%；多發瘺的死亡率高于單發瘺；正常腸段的腸瘺死亡率不足20%，而病例腸段可達48%，放射性腸炎達77%，新生物腸段為54%；急診手術引起腸瘺的危險性較擇期性手術增加3～4倍；伴有腹腔感染者的腸瘺死亡率高。
