根據病史、臨床表現和必要的輔助檢查，綜合分析，一般可明確診斷，尤其CT檢查起決定作用。因腦膿腫絕大多數為繼發于身體其他部位的化膿性病灶，所以病人常有慢性中耳炎、乳突炎急性發作、鼻竇炎、胸部及肺部化膿性感染、細菌性心內膜炎、發紺型先天性心臟病、皮膚癤腫及癰、骨髓炎、顱骨髓炎、敗血癥及膿毒血癥等炎癥病史。開放性顱腦外傷，尤其有碎骨片或異物存留于腦內的患者，在此基礎上經過一段潛伏期，患者出現化膿性腦炎的癥狀和體征，經抗生素等治療，病情緩解后再次出現顱內壓增高的征象和局灶定位體征，即應首先考慮腦膿腫的可能，進一步經過輔助檢查，大多可明確病變的定位和定性診斷。